ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Calosoma sp. BYU-CO241 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018339	A	12	368	379	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	40020147
2	NC_018339	TAA	5	460	474	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	40020147
3	NC_018339	AAT	4	477	487	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	40020147
4	NC_018339	ATA	4	879	891	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40020147
5	NC_018339	TA	6	1050	1061	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	40020147
6	NC_018339	ATA	4	1161	1171	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	40020147
7	NC_018339	TAAA	3	1427	1438	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018339	ATCT	3	2894	2904	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	40020147
9	NC_018339	ATTT	3	2928	2940	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	40020147
10	NC_018339	ATT	4	3376	3386	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40020148
11	NC_018339	ATT	4	4205	4216	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020148
12	NC_018339	TTAT	3	4226	4237	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	40020148
13	NC_018339	ATT	4	4691	4703	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	40020148
14	NC_018339	TATTT	3	5073	5087	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	40020148
15	NC_018339	TTA	4	5950	5961	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020148
16	NC_018339	CTTT	3	6260	6270	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
17	NC_018339	AAATT	3	6505	6518	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	40020148
18	NC_018339	TAT	4	6523	6534	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020148
19	NC_018339	AAAT	3	7033	7043	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	40020148
20	NC_018339	TTA	4	7330	7341	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020148
21	NC_018339	TAA	5	7439	7453	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	40020148
22	NC_018339	TAA	4	7870	7882	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40020148
23	NC_018339	TAAA	3	8117	8129	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	40020148
24	NC_018339	ACTT	3	8205	8216	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
25	NC_018339	ATT	4	8233	8243	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_018339	AAATT	4	8244	8262	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	40020148
27	NC_018339	GAA	4	8350	8361	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	40020148
28	NC_018339	ATT	4	8683	8694	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020148
29	NC_018339	AATT	3	8775	8785	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020148
30	NC_018339	AT	7	9041	9054	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40020148
31	NC_018339	A	13	9078	9090	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	40020148
32	NC_018339	ATA	4	9111	9122	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020148
33	NC_018339	A	12	9249	9260	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	40020148
34	NC_018339	TAA	5	9315	9329	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	40020148
35	NC_018339	ATA	4	9569	9580	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020148
36	NC_018339	ATAA	4	9733	9748	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	40020148
37	NC_018339	TAA	6	9785	9802	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	40020148
38	NC_018339	TAT	4	10058	10069	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020148
39	NC_018339	TAG	4	10183	10194	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	40020148
40	NC_018339	A	13	11934	11946	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	40020149
41	NC_018339	TAA	4	12303	12315	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40020149
42	NC_018339	TAAAT	3	12393	12408	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	40020149
43	NC_018339	ATA	4	12437	12447	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	40020149
44	NC_018339	AAT	5	12473	12488	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	40020149
45	NC_018339	TAA	4	12666	12677	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020149
46	NC_018339	TTA	4	12849	12859	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_018339	TAT	4	13482	13492	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_018339	TAA	4	13586	13597	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_018339	TTAA	3	13700	13710	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_018339	ATA	4	13748	13759	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_018339	TAAA	3	13959	13969	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_018339	ATT	4	14059	14070	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_018339	TTAA	3	14388	14398	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_018339	ATA	4	14663	14674	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_018339	TTTAT	3	14726	14741	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_018339	AAAT	3	14944	14956	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_018339	AAATA	4	15365	15385	21	80 %	20 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
58	NC_018339	ATA	4	15493	15504	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_018339	ATA	4	15545	15555	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_018339	T	22	15564	15585	22	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
61	NC_018339	TA	11	15593	15616	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_018339	AT	8	15661	15677	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
63	NC_018339	AT	6	15679	15689	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_018339	AATT	3	15789	15800	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_018339	GATT	3	15876	15886	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_018339	TTA	4	15957	15968	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_018339	ATT	4	15990	16002	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_018339	TAT	4	16013	16023	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_018339	AT	6	16056	16066	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_018339	ATTA	3	16130	16141	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_018339	AATT	3	16291	16303	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_018339	ATT	4	16356	16367	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Calosoma sp. BYU-CO241 mitochondrion