ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Actias selene mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018133	TAAA	3	64	74	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_018133	TTTAT	3	127	141	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_018133	TTTTTA	4	283	306	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	39483148
4	NC_018133	AATT	3	788	798	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39483148
5	NC_018133	ATTT	3	843	853	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39483148
6	NC_018133	TAA	4	1045	1057	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39483148
7	NC_018133	ATT	4	1098	1109	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39483148
8	NC_018133	TAAA	3	1180	1190	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39483148
9	NC_018133	TTTA	3	1253	1264	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39483148
10	NC_018133	TAT	4	1969	1980	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39483147
11	NC_018133	GAAA	3	2256	2267	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	39483147
12	NC_018133	AATT	3	3741	3751	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39483147
13	NC_018133	ATTT	3	4198	4209	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39483147
14	NC_018133	CAAT	3	4687	4698	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	39483147
15	NC_018133	T	13	5024	5036	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	39483147
16	NC_018133	TATTTA	3	5538	5556	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
17	NC_018133	ATT	4	5783	5794	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39483147
18	NC_018133	ATTT	4	5833	5848	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	39483147
19	NC_018133	TAT	4	5893	5904	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39483147
20	NC_018133	TAAA	3	6401	6412	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	39483147
21	NC_018133	TTA	4	6416	6426	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39483147
22	NC_018133	TAT	4	6708	6719	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39483147
23	NC_018133	ATA	4	6797	6808	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39483147
24	NC_018133	A	12	6938	6949	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	39483147
25	NC_018133	TTA	4	7226	7237	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39483147
26	NC_018133	TAA	4	7769	7781	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39483147
27	NC_018133	AAAT	3	7981	7993	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	39483147
28	NC_018133	TA	6	8036	8047	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39483147
29	NC_018133	AATT	4	8387	8403	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	39483147
30	NC_018133	ATA	4	8447	8458	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39483147
31	NC_018133	ATC	4	8459	8470	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	39483147
32	NC_018133	TAAA	3	8946	8958	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	39483147
33	NC_018133	TATT	3	9002	9014	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	39483147
34	NC_018133	TAA	4	9119	9131	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39483147
35	NC_018133	AAAAT	3	9155	9168	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	39483147
36	NC_018133	AAT	4	9344	9354	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39483147
37	NC_018133	ATT	4	9475	9486	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	39483147
38	NC_018133	ATT	5	9900	9913	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_018133	ATT	5	10112	10126	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	39483148
40	NC_018133	CTTT	3	10158	10168	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	39483148
41	NC_018133	TTTA	3	10196	10206	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39483148
42	NC_018133	TTTA	5	10376	10395	20	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	39483148
43	NC_018133	TA	6	10633	10643	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39483148
44	NC_018133	T	14	10741	10754	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	39483148
45	NC_018133	TTA	4	10827	10837	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39483148
46	NC_018133	AAAT	3	11861	11871	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39483148
47	NC_018133	TAAAA	3	11897	11910	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	39483148
48	NC_018133	A	15	12298	12312	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	39483148
49	NC_018133	TAAA	3	12736	12747	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_018133	TTTA	3	13063	13074	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_018133	TTTTA	3	13171	13185	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_018133	AATT	3	13420	13431	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018133	AAATT	3	13518	13532	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018133	TTTAA	3	13539	13552	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_018133	ATTA	3	13815	13826	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018133	TAT	4	14036	14047	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_018133	AATT	4	14073	14088	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_018133	ATAA	3	14304	14315	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018133	TTA	4	14671	14683	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_018133	AATTT	3	14695	14709	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018133	TAAA	3	14820	14831	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_018133	T	17	14930	14946	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
63	NC_018133	AT	8	14960	14974	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_018133	TA	8	15108	15123	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_018133	AAAG	3	15210	15220	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Actias selene mitochondrion