ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Macrotermes subhyalinus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018128	CTA	4	1081	1093	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	39483139
2	NC_018128	CAA	4	1397	1407	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
3	NC_018128	TCT	4	1811	1823	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	39483139
4	NC_018128	CAA	4	1978	1990	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	39483139
5	NC_018128	GCT	4	2055	2065	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	39483139
6	NC_018128	TAAC	3	3019	3030	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	39483139
7	NC_018128	ACACTC	3	4380	4397	18	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	5 %	39483139
8	NC_018128	AATCCT	3	4664	4681	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	39483139
9	NC_018128	ACA	5	5624	5638	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	39483139
10	NC_018128	TTACCA	3	5834	5852	19	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10 %	39483139
11	NC_018128	AATT	3	6150	6160	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_018128	AAAC	3	6279	6290	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
13	NC_018128	TAA	4	6707	6717	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39483139
14	NC_018128	AAG	4	7492	7503	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	39483139
15	NC_018128	CAA	4	7532	7542	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	39483139
16	NC_018128	TAA	4	7786	7797	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39483139
17	NC_018128	AAAC	3	7807	7817	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	39483139
18	NC_018128	ATA	4	8230	8241	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39483139
19	NC_018128	CAA	4	9021	9032	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	39483139
20	NC_018128	A	14	9442	9455	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	39483139
21	NC_018128	AAAC	3	9523	9534	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	39483139
22	NC_018128	TAAA	3	9641	9651	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39483140
23	NC_018128	ATA	4	9686	9696	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39483140
24	NC_018128	ATA	4	9964	9975	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39483140
25	NC_018128	CTA	4	10045	10056	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	39483140
26	NC_018128	CAA	5	10265	10280	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	39483140
27	NC_018128	ACA	5	10321	10335	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	39483140
28	NC_018128	CCAA	3	11412	11423	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	39483140
29	NC_018128	CAA	4	11554	11565	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	0 %	39483140
30	NC_018128	CAC	4	11953	11964	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	39483140
31	NC_018128	AAAG	3	12360	12371	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	39483140
32	NC_018128	AAAT	3	12390	12400	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39483140
33	NC_018128	ACA	4	13398	13408	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
34	NC_018128	ACA	4	13930	13941	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_018128	CAAA	3	14243	14253	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
36	NC_018128	ACT	4	14479	14490	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
37	NC_018128	TAAA	3	14586	14596	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_018128	TAA	5	15453	15466	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_018128	TA	6	15677	15688	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_018128	TAA	5	16006	16019	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_018128	TA	6	16230	16241	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Macrotermes subhyalinus mitochondrion