ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Coptotermes lacteus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018125	CT	6	213	223	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
2	NC_018125	ACT	5	1088	1101	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	39483129
3	NC_018125	CAA	4	1977	1989	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	39483129
4	NC_018125	ACT	5	2056	2070	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	39483129
5	NC_018125	AGG	4	2149	2160	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	39483129
6	NC_018125	CAT	4	2833	2843	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	39483129
7	NC_018125	ATTA	3	3870	3881	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_018125	AATAG	3	3947	3960	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	39483129
9	NC_018125	CAA	4	4033	4044	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	39483129
10	NC_018125	CCA	4	4045	4056	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	39483129
11	NC_018125	ACACTA	3	4391	4408	18	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	5 %	39483129
12	NC_018125	TCA	4	5021	5031	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	39483129
13	NC_018125	TAA	4	5621	5632	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	39483129
14	NC_018125	AAC	4	5637	5648	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	39483129
15	NC_018125	ACT	4	5838	5849	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	39483129
16	NC_018125	TAA	4	6158	6169	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_018125	ACCA	3	6322	6333	12	50 %	0 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018125	ACT	4	6464	6474	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	39483130
19	NC_018125	ATA	4	6662	6674	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39483130
20	NC_018125	ACTAAA	3	6689	6706	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	39483130
21	NC_018125	TAAA	3	7195	7205	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39483130
22	NC_018125	CAA	4	7379	7389	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	39483130
23	NC_018125	AAG	4	7516	7526	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	39483130
24	NC_018125	CAA	4	7556	7566	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	39483130
25	NC_018125	ACA	4	8276	8287	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	39483130
26	NC_018125	ACCA	3	8773	8784	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	39483130
27	NC_018125	CAC	4	9017	9028	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	39483130
28	NC_018125	ACA	4	9268	9279	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	39483130
29	NC_018125	AGA	4	9767	9778	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	39483130
30	NC_018125	AC	6	10286	10298	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	39483130
31	NC_018125	CAA	4	10322	10333	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	39483130
32	NC_018125	ATCA	3	10529	10539	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	39483130
33	NC_018125	CCTA	3	11197	11207	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	39483130
34	NC_018125	ACC	4	11949	11960	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	0 %	39483130
35	NC_018125	CAA	4	12579	12590	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	39483130
36	NC_018125	ACAA	4	13075	13089	15	75 %	0 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
37	NC_018125	AATA	4	13476	13491	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_018125	ACAA	3	13636	13647	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
39	NC_018125	ATA	4	13807	13819	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_018125	ACA	4	13935	13946	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_018125	CAAA	3	14252	14262	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
42	NC_018125	CAA	4	14970	14980	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
43	NC_018125	AAAT	3	15285	15296	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_018125	ATA	4	15400	15411	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_018125	CT	6	15486	15496	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
46	NC_018125	AAAT	3	15850	15861	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_018125	ATA	4	15965	15976	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_018125	CT	6	16051	16061	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Coptotermes lacteus mitochondrion