ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Zootermopsis angusticollis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018123	CT	6	191	201	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
2	NC_018123	A	12	342	353	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	39483126
3	NC_018123	A	13	894	906	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	39483126
4	NC_018123	CA	6	2867	2877	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	39483126
5	NC_018123	A	14	3949	3962	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	39483126
6	NC_018123	CTAACA	3	4304	4321	18	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	5 %	39483126
7	NC_018123	TTC	4	4962	4973	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	39483126
8	NC_018123	AAC	4	5148	5159	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	39483126
9	NC_018123	AAT	4	5563	5574	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39483126
10	NC_018123	ATA	4	5597	5608	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39483126
11	NC_018123	TAA	4	6060	6071	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_018123	CAA	4	6320	6332	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	39483126
13	NC_018123	AGA	4	6535	6546	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	39483126
14	NC_018123	GAAA	3	6563	6573	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	39483126
15	NC_018123	ACA	5	6719	6734	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	39483126
16	NC_018123	ATA	4	6817	6827	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39483126
17	NC_018123	ACA	4	6870	6880	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	39483126
18	NC_018123	AAAC	3	6978	6989	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	39483126
19	NC_018123	CAA	4	7267	7278	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	39483126
20	NC_018123	AATA	3	7315	7326	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	39483126
21	NC_018123	AAG	4	7404	7415	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	39483126
22	NC_018123	CAA	4	7444	7454	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	39483126
23	NC_018123	CAA	4	7944	7954	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	39483126
24	NC_018123	CAAA	3	7965	7975	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	39483126
25	NC_018123	CAAT	3	8954	8964	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	39483126
26	NC_018123	AAAT	3	8990	9002	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	39483126
27	NC_018123	CAAA	3	9074	9084	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	39483126
28	NC_018123	ATA	4	9563	9573	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39483126
29	NC_018123	AAAG	3	9664	9674	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	39483126
30	NC_018123	AAAT	3	9681	9692	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	39483126
31	NC_018123	AT	6	10628	10638	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39483127
32	NC_018123	CAAA	3	11679	11690	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	39483127
33	NC_018123	A	18	11712	11729	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	39483127
34	NC_018123	AAAC	3	12161	12171	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	39483127
35	NC_018123	A	13	12450	12462	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	39483127
36	NC_018123	AAACAA	4	12451	12475	25	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	8 %	39483127
37	NC_018123	CAAA	3	12570	12582	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
38	NC_018123	ATAA	5	12849	12868	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_018123	TAAA	5	13224	13242	19	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
40	NC_018123	AAAAT	3	13247	13260	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_018123	TAAA	3	13297	13307	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_018123	TA	6	15059	15069	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_018123	TA	6	15113	15124	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_018123	ACAAA	3	15327	15341	15	80 %	0 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018123	AAAC	4	15342	15356	15	75 %	0 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
46	NC_018123	AAAAT	3	15367	15381	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_018123	A	13	15413	15425	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Zootermopsis angusticollis mitochondrion