ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Datura stramonium chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018117	TAT	4	173	183	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_018117	TTA	4	1997	2008	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_018117	AAG	5	2960	2974	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	39483108
4	NC_018117	GAA	4	4388	4399	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_018117	ATA	4	6465	6477	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_018117	ATT	4	14661	14672	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_018117	ATT	4	24129	24141	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39483109
8	NC_018117	CAG	4	28788	28799	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_018117	TAG	4	32358	32369	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_018117	ATT	4	32917	32927	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_018117	TTC	4	36622	36633	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39483109
12	NC_018117	TAA	4	43769	43780	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_018117	TAA	4	44016	44026	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_018117	TAG	4	45699	45709	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	39483116
15	NC_018117	GTA	4	46303	46313	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_018117	AAT	4	46867	46878	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_018117	TAT	8	52675	52697	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_018117	TTA	4	53314	53325	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018117	ATA	4	56283	56296	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39483110
20	NC_018117	TTG	4	57059	57069	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_018117	TTA	5	58958	58973	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_018117	ATT	4	60856	60866	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_018117	TAT	4	61231	61242	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_018117	GTT	4	67181	67191	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_018117	TCT	4	67453	67464	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_018117	TCT	4	76006	76017	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	39483112
27	NC_018117	AGA	4	79050	79060	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	39483112
28	NC_018117	TTA	4	86075	86086	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39483112
29	NC_018117	CTT	4	86488	86499	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	39483112
30	NC_018117	GAT	4	86955	86965	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	39483112
31	NC_018117	GAT	4	88329	88339	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	39483112
32	NC_018117	TGA	4	93050	93061	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	39483112
33	NC_018117	TTC	4	100872	100883	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	39483116
34	NC_018117	ATT	4	112640	112652	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39483116
35	NC_018117	TAA	4	113054	113065	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39483116
36	NC_018117	AAG	4	113279	113290	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	39483116
37	NC_018117	TTC	5	121916	121930	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	39483116
38	NC_018117	TTA	4	130332	130343	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39483116
39	NC_018117	GAA	4	141286	141297	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	39483116
40	NC_018117	ATC	4	153830	153840	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
41	NC_018117	ATC	4	155204	155214	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	39483116
42	NC_018117	GAA	5	155669	155683	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	39483116

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Datura stramonium chloroplast