ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Datura stramonium chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018117	TTCT	3	149	161	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
2	NC_018117	TAT	4	173	183	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_018117	AAAC	3	361	371	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
4	NC_018117	AAAG	4	399	414	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_018117	AAGT	3	1197	1207	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	39483108
6	NC_018117	TTA	4	1997	2008	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_018117	AAG	5	2960	2974	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	39483108
8	NC_018117	T	12	3747	3758	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018117	CATT	3	4091	4102	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
10	NC_018117	GAA	4	4388	4399	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_018117	GAAA	3	4434	4444	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_018117	ATTT	3	4885	4895	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_018117	AATA	3	5993	6004	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	39483108
14	NC_018117	AT	7	6426	6438	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_018117	ATA	4	6465	6477	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_018117	GAAT	3	6482	6493	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_018117	GTTT	3	7509	7521	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_018117	TTAC	3	7738	7750	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
19	NC_018117	TTCT	3	7951	7961	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	39483108
20	NC_018117	AAAAT	3	8053	8066	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_018117	A	12	8576	8587	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018117	CAAG	3	9038	9048	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
23	NC_018117	CCTAT	3	9234	9248	15	20 %	40 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
24	NC_018117	AAAG	3	9592	9603	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_018117	T	13	10187	10199	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_018117	AT	7	10323	10336	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_018117	AATT	3	12512	12523	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39483108
28	NC_018117	ATGA	3	12553	12565	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	39483108
29	NC_018117	AAAT	3	12649	12659	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39483108
30	NC_018117	TAAA	3	13363	13374	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_018117	ATTCA	3	14183	14196	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
32	NC_018117	TATT	3	14648	14659	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018117	ATT	4	14661	14672	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_018117	TTTTA	3	14723	14737	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_018117	AAAC	3	18860	18870	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	39483109
36	NC_018117	T	12	19044	19055	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	39483109
37	NC_018117	GAAT	3	19448	19458	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	39483109
38	NC_018117	ATT	4	24129	24141	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39483109
39	NC_018117	TTCA	3	27396	27406	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
40	NC_018117	ATTAG	3	27411	27424	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_018117	AG	7	27885	27897	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_018117	AT	6	28157	28167	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_018117	TGAA	3	28495	28506	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_018117	CAG	4	28788	28799	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
45	NC_018117	TTGGA	3	29005	29019	15	20 %	40 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_018117	TTAA	3	30598	30608	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39483109
47	NC_018117	TTTA	3	30954	30965	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018117	TTCT	3	30990	31001	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
49	NC_018117	T	17	31463	31479	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
50	NC_018117	GAAA	4	31685	31699	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_018117	TAG	4	32358	32369	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_018117	TTCT	3	32694	32704	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
53	NC_018117	AAAG	3	32844	32855	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_018117	ATT	4	32917	32927	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_018117	ATGA	3	33276	33286	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_018117	T	14	33459	33472	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_018117	TATT	4	33849	33865	17	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
58	NC_018117	TTC	4	36622	36633	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39483109
59	NC_018117	TTTC	3	36821	36831	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
60	NC_018117	AG	6	36979	36989	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_018117	TA	6	37184	37195	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_018117	TC	6	37603	37613	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	39483109
63	NC_018117	TA	7	37845	37857	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_018117	ATTG	3	40051	40061	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	39483110
65	NC_018117	AATG	3	41697	41708	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	39483110
66	NC_018117	TG	6	42139	42149	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	39483110
67	NC_018117	TTTA	3	43452	43463	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_018117	TA	6	43729	43740	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_018117	TAA	4	43769	43780	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_018117	TAA	4	44016	44026	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_018117	T	15	44955	44969	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	39483116
72	NC_018117	TAG	4	45699	45709	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	39483116
73	NC_018117	A	14	45936	45949	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	39483116
74	NC_018117	GTA	4	46303	46313	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_018117	AAT	4	46867	46878	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_018117	GAAA	4	46889	46903	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_018117	CTTATT	3	47549	47567	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
78	NC_018117	TATTT	3	47594	47607	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_018117	TA	6	47775	47785	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_018117	AAGG	3	47838	47848	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_018117	TA	6	48314	48324	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_018117	AAAGAA	3	48661	48678	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
83	NC_018117	T	14	52570	52583	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_018117	TAT	8	52675	52697	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_018117	AGGTA	3	52795	52808	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_018117	TTA	4	53314	53325	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018117	CACC	3	55675	55687	13	25 %	0 %	0 %	75 %	7 %	39483110
88	NC_018117	ATA	4	56283	56296	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39483110
89	NC_018117	TTAGG	3	56835	56848	14	20 %	40 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_018117	TTG	4	57059	57069	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_018117	TTA	5	58958	58973	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
92	NC_018117	TTTA	3	59046	59057	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_018117	ATT	4	60856	60866	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_018117	TAT	4	61231	61242	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_018117	AT	6	64220	64230	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39483111
96	NC_018117	T	12	65340	65351	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018117	CAAA	3	65993	66004	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018117	TTTC	3	67038	67048	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
99	NC_018117	GTT	4	67181	67191	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_018117	TCT	4	67453	67464	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
101	NC_018117	TTAAA	3	67514	67529	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
102	NC_018117	AAAT	3	69009	69020	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_018117	T	12	69087	69098	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_018117	CTTTA	3	69672	69687	16	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
105	NC_018117	TA	6	70066	70076	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_018117	AAAT	3	70091	70102	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_018117	AAAC	3	70186	70197	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018117	GAAA	3	70598	70609	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_018117	TGAA	3	71106	71117	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_018117	T	12	72739	72750	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	39483112
111	NC_018117	GGTT	3	75635	75646	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	39483112
112	NC_018117	TCT	4	76006	76017	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	39483112
113	NC_018117	AT	6	78577	78587	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39483112
114	NC_018117	AGA	4	79050	79060	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	39483112
115	NC_018117	TA	6	79302	79312	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39483112
116	NC_018117	T	17	80334	80350	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	39483112
117	NC_018117	A	14	83280	83293	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	39483112
118	NC_018117	AT	6	83885	83896	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39483112
119	NC_018117	ACTT	3	84274	84284	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	39483112
120	NC_018117	TTCT	3	84507	84518	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	39483112
121	NC_018117	CAAT	3	84993	85003	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	39483112
122	NC_018117	TTA	4	86075	86086	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39483112
123	NC_018117	T	18	86376	86393	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	39483112
124	NC_018117	CTT	4	86488	86499	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	39483112
125	NC_018117	GAT	4	86955	86965	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	39483112
126	NC_018117	GAT	4	88329	88339	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	39483112
127	NC_018117	GAAA	3	90153	90165	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	39483112
128	NC_018117	TGA	4	93050	93061	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	39483112
129	NC_018117	AATA	3	93906	93918	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	39483112
130	NC_018117	TTTCG	3	99082	99095	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	39483112
131	NC_018117	TTC	4	100872	100883	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	39483116
132	NC_018117	ATTAGT	4	101424	101445	22	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	9 %	39483116
133	NC_018117	ATCC	3	104501	104512	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	39483116
134	NC_018117	AAGG	3	104809	104819	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	39483116
135	NC_018117	GAGG	3	107535	107546	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	39483116
136	NC_018117	AGGT	3	107747	107758	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	39483116
137	NC_018117	TAAG	3	108867	108877	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	39483116
138	NC_018117	A	15	109535	109549	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	39483116
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173	NC_018117	ATC	4	153830	153840	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
174	NC_018117	ATC	4	155204	155214	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	39483116
175	NC_018117	GAA	5	155669	155683	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	39483116
176	NC_018117	A	18	155778	155795	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Datura stramonium chloroplast