ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Erycina pusilla chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018114	TAT	4	8803	8814	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_018114	TCT	4	15466	15477	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018114	TGC	4	15951	15962	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	39500166
4	NC_018114	TCT	4	18033	18043	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	39500166
5	NC_018114	TCT	4	22119	22129	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	39500166
6	NC_018114	GTT	4	23581	23592	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39500166
7	NC_018114	ATT	4	30275	30287	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_018114	TAA	4	30712	30724	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_018114	TAT	4	32215	32226	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_018114	TAA	4	32487	32498	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_018114	ATT	4	33243	33254	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_018114	GGA	4	35764	35775	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	39500167
13	NC_018114	ATG	4	39657	39667	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	39500167
14	NC_018114	TTG	4	45054	45064	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	39500167
15	NC_018114	GTT	4	45841	45852	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_018114	TAA	8	46208	46231	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_018114	ATT	4	50541	50553	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_018114	CTA	4	50947	50958	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
19	NC_018114	ATT	4	52276	52288	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39500167
20	NC_018114	TTG	4	54840	54850	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_018114	AAG	4	59006	59017	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_018114	GAA	4	59407	59417	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_018114	GTT	4	59420	59430	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_018114	TAT	4	64031	64041	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_018114	TTC	4	69561	69572	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	39500169
26	NC_018114	TAT	4	70202	70214	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39500169
27	NC_018114	CTT	4	84530	84541	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	39500169
28	NC_018114	GAT	4	86368	86378	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	39500169
29	NC_018114	TGA	4	90891	90902	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	39500169
30	NC_018114	TGA	4	91377	91390	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	39500169
31	NC_018114	TAC	4	97143	97154	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	39500169
32	NC_018114	AAG	4	97426	97437	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	39500172
33	NC_018114	TAT	4	98067	98079	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39500172
34	NC_018114	AAT	5	107857	107871	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	39500172
35	NC_018114	TTC	4	108790	108801	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	39500172
36	NC_018114	CCG	4	109001	109012	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	39500172
37	NC_018114	ATT	4	111985	111996	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39500172
38	NC_018114	TAT	4	114231	114241	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39500172
39	NC_018114	AAT	4	114315	114326	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39500172
40	NC_018114	ATT	4	116266	116276	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39500172
41	NC_018114	TTC	5	117348	117362	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	39500172
42	NC_018114	TTG	4	118332	118343	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39500172
43	NC_018114	TAA	4	128817	128829	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39500172
44	NC_018114	GAG	4	129170	129181	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	39500172
45	NC_018114	GTA	4	129744	129755	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	39500172
46	NC_018114	TAA	4	134549	134560	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39500172
47	NC_018114	ATC	4	135507	135520	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	39500172
48	NC_018114	TCA	4	135999	136011	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	39500172
49	NC_018114	ATC	4	140520	140530	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Erycina pusilla chloroplast