ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Erycina pusilla chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018114	TCAA	3	1292	1303	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
2	NC_018114	ATAA	3	2074	2086	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	39500165
3	NC_018114	GTAT	3	3305	3315	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_018114	AAAT	3	3352	3363	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_018114	TCTA	3	3374	3384	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
6	NC_018114	AAAT	3	4370	4380	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_018114	TTTA	3	4600	4611	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39500165
8	NC_018114	TATT	3	6174	6185	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_018114	ATTT	3	6371	6382	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_018114	TAAAA	3	6679	6692	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_018114	AAGAA	3	7237	7252	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_018114	ATCTT	4	7818	7836	19	20 %	60 %	0 %	20 %	5 %	Non-Coding
13	NC_018114	GA	6	8097	8108	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_018114	ATTA	3	8508	8519	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_018114	TA	6	8572	8585	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_018114	TATTTT	3	8623	8641	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
17	NC_018114	TAT	4	8803	8814	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_018114	TAAAA	3	8990	9004	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
19	NC_018114	TAGA	3	10514	10524	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	39500166
20	NC_018114	GTCT	3	11428	11439	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	39500166
21	NC_018114	ATTT	3	12525	12535	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39500166
22	NC_018114	AAAG	3	12749	12759	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	39500166
23	NC_018114	AGAA	3	13221	13231	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	39500166
24	NC_018114	TTCTC	3	14118	14131	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
25	NC_018114	TCT	4	15466	15477	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018114	GAATC	3	15563	15576	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	39500166
27	NC_018114	TGC	4	15951	15962	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	39500166
28	NC_018114	AAAT	4	16266	16281	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_018114	TTTC	3	16342	16353	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
30	NC_018114	CTGCT	3	16824	16837	14	0 %	40 %	20 %	40 %	7 %	39500166
31	NC_018114	TCT	4	18033	18043	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	39500166
32	NC_018114	TCT	4	22119	22129	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	39500166
33	NC_018114	TTCA	3	22598	22609	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	39500166
34	NC_018114	T	15	22618	22632	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	39500166
35	NC_018114	GTT	4	23581	23592	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39500166
36	NC_018114	GAAA	3	26227	26239	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	39500166
37	NC_018114	AAAT	3	27241	27251	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_018114	AGTA	3	27633	27644	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018114	AAACA	3	27897	27911	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
40	NC_018114	AATCT	3	27925	27938	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
41	NC_018114	AAGT	3	28418	28428	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_018114	TA	6	29199	29209	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_018114	TA	8	29299	29313	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
44	NC_018114	ATT	4	30275	30287	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_018114	GTTG	3	30454	30465	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_018114	TAA	4	30712	30724	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_018114	AAAG	3	30985	30996	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_018114	TAT	4	32215	32226	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_018114	TAA	4	32487	32498	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_018114	TATCTA	3	32813	32831	19	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
51	NC_018114	A	12	33212	33223	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_018114	ATT	4	33243	33254	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_018114	ATTT	3	33526	33537	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_018114	GAAA	3	35562	35573	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	39500167
55	NC_018114	GGA	4	35764	35775	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	39500167
56	NC_018114	TTCT	3	36570	36580	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
57	NC_018114	AAAGA	3	36853	36866	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_018114	TGCA	3	36913	36923	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
59	NC_018114	TC	6	37171	37181	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	39500167
60	NC_018114	AT	11	37398	37417	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
61	NC_018114	TTTG	3	38237	38247	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_018114	ACAA	3	38258	38269	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
63	NC_018114	ATG	4	39657	39667	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	39500167
64	NC_018114	AAGA	3	40751	40762	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	39500167
65	NC_018114	AATG	3	41150	41161	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	39500167
66	NC_018114	TG	6	41592	41602	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	39500167
67	NC_018114	TGGCC	3	42674	42688	15	0 %	20 %	40 %	40 %	6 %	39500167
68	NC_018114	TTTTTA	3	43192	43210	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
69	NC_018114	AAGA	3	44012	44022	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	39500167
70	NC_018114	TCTTT	3	44375	44388	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	39500167
71	NC_018114	TTG	4	45054	45064	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	39500167
72	NC_018114	GTT	4	45841	45852	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_018114	TC	6	46038	46049	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
74	NC_018114	TAA	8	46208	46231	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_018114	AAAT	3	47276	47287	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_018114	ATTCGA	3	47687	47705	19	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
77	NC_018114	AT	6	47781	47792	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_018114	TTGA	3	48091	48103	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_018114	GAAA	3	48311	48323	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_018114	T	12	48925	48936	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018114	AAAT	4	49981	49996	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_018114	ACTT	3	50312	50322	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
83	NC_018114	TA	6	50481	50492	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_018114	ATT	4	50541	50553	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_018114	TTATGT	4	50611	50634	24	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_018114	CAAT	3	50777	50788	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
87	NC_018114	GA	6	50876	50886	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_018114	CTA	4	50947	50958	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
89	NC_018114	ATT	4	52276	52288	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39500167
90	NC_018114	AT	16	54419	54449	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_018114	TTCA	3	54733	54743	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
92	NC_018114	TTG	4	54840	54850	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_018114	AAG	4	59006	59017	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_018114	GAA	4	59407	59417	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_018114	GTT	4	59420	59430	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_018114	AAAG	3	60576	60587	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_018114	GTTA	4	60626	60641	16	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
98	NC_018114	TACAA	3	61831	61844	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
99	NC_018114	GAAA	3	62302	62314	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	39500168
100	NC_018114	TTAT	3	63175	63185	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_018114	T	13	63293	63305	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_018114	TAT	4	64031	64041	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_018114	A	12	64610	64621	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_018114	TAAA	3	64812	64823	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_018114	TAAGAT	3	64854	64870	17	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
106	NC_018114	TTTC	3	65060	65071	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
107	NC_018114	AAAATA	3	66523	66541	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
108	NC_018114	ATTA	3	66792	66803	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018114	TTAA	3	66806	66816	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_018114	TTCT	3	66982	66993	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
111	NC_018114	GAAA	3	67249	67260	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	39500169
112	NC_018114	AAATAA	3	67339	67355	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
113	NC_018114	TCTT	3	67863	67874	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
114	NC_018114	TTTC	3	68430	68442	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
115	NC_018114	ATTT	3	68544	68554	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_018114	TAAA	3	69274	69286	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	39500169
117	NC_018114	TTC	4	69561	69572	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	39500169
118	NC_018114	TAT	4	70202	70214	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39500169
119	NC_018114	ATAA	3	70455	70466	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	39500169
120	NC_018114	ATTCT	3	71948	71961	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	39500169
121	NC_018114	GTTG	3	73132	73143	12	0 %	50 %	50 %	0 %	0 %	39500169
122	NC_018114	TTTTA	3	73680	73694	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	39500169
123	NC_018114	AAAAG	3	75212	75226	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	39500169
124	NC_018114	AATG	3	76938	76948	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	39500169
125	NC_018114	TGGA	3	77111	77121	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	39500169
126	NC_018114	AATC	4	78097	78112	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	39500169
127	NC_018114	GGTTAT	3	81481	81499	19	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	10 %	39500169
128	NC_018114	TAAA	4	81735	81749	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	39500169
129	NC_018114	TATCGT	3	82192	82210	19	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	39500169
130	NC_018114	TTCT	3	82222	82233	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	39500169
131	NC_018114	CTT	4	84530	84541	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	39500169
132	NC_018114	GAT	4	86368	86378	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	39500169
133	NC_018114	GCAA	3	86776	86786	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	39500169
134	NC_018114	TTTA	3	87232	87243	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39500169
135	NC_018114	TTCT	3	88062	88072	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	39500169
136	NC_018114	TGAT	3	90840	90852	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	39500169
137	NC_018114	TGA	4	90891	90902	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	39500169
138	NC_018114	TGA	4	91377	91390	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	39500169
139	NC_018114	TTTC	3	91800	91811	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	39500169
140	NC_018114	TCTA	3	93973	93984	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	39500169
141	NC_018114	TCCGG	3	94572	94586	15	0 %	20 %	40 %	40 %	6 %	39500169
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151	NC_018114	TTCT	3	100847	100859	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	39500172
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159	NC_018114	ATTC	3	107296	107306	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	39500172
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170	NC_018114	T	12	111901	111912	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	39500172
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175	NC_018114	TTTC	3	112271	112282	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	39500172
176	NC_018114	TAAA	3	113099	113109	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39500172
177	NC_018114	TTCTAT	3	113442	113460	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10 %	39500172
178	NC_018114	TTCA	4	113559	113573	15	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	39500172
179	NC_018114	TATT	3	114211	114221	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39500172
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183	NC_018114	TTAT	3	115196	115207	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39500172
184	NC_018114	CATT	3	115456	115467	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	39500172
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191	NC_018114	A	12	117981	117992	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	39500172
192	NC_018114	TCTTT	3	118110	118124	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	39500172
193	NC_018114	TTG	4	118332	118343	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39500172
194	NC_018114	CTTT	4	118378	118393	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	39500172
195	NC_018114	ATGA	3	119586	119597	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	39500172
196	NC_018114	CTTA	3	120967	120977	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	39500172
197	NC_018114	GGAT	3	125550	125561	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	39500172
198	NC_018114	A	14	128179	128192	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	39500172
199	NC_018114	AATAG	3	128799	128812	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	39500172
200	NC_018114	TAA	4	128817	128829	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39500172
201	NC_018114	GAG	4	129170	129181	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	39500172
202	NC_018114	GTA	4	129744	129755	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	39500172
203	NC_018114	ATTT	3	131575	131585	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
204	NC_018114	TAGA	3	132914	132925	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
205	NC_018114	TAA	4	134549	134560	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39500172
206	NC_018114	TGAA	3	135086	135097	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	39500172
207	NC_018114	ATC	4	135507	135520	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	39500172
208	NC_018114	TCA	4	135999	136011	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	39500172
209	NC_018114	ATCA	3	136046	136058	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	39500172
210	NC_018114	ATTT	3	138699	138710	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39500172
211	NC_018114	ATAA	3	139654	139665	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	39500172
212	NC_018114	TTGC	3	140112	140122	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	39500172
213	NC_018114	ATC	4	140520	140530	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
214	NC_018114	CATT	3	142573	142583	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Erycina pusilla chloroplast