ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Gossypium robinsonii chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_018113TTAT33944041125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
2NC_018113AAGT3125112611150 %25 %25 %0 %9 %39483095
3NC_018113AT7182218341350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
4NC_018113GAA4315431651266.67 %0 %33.33 %0 %8 %39483095
5NC_018113TAA5408741011566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
6NC_018113AATT3428742991350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
7NC_018113TAAA3473547471375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
8NC_018113ATCT3482748381225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
9NC_018113A134957496913100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
10NC_018113T2849745001280 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
11NC_018113ATT5500650201533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
12NC_018113TTTTA3505050641520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
13NC_018113TGT450655075110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
14NC_018113TTCA3509651071225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
15NC_018113GTT451625172110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
16NC_018113A135783579513100 %0 %0 %0 %7 %39483095
17NC_018113T1260796090120 %100 %0 %0 %8 %39483095
18NC_018113AAAT4662266371675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
19NC_018113TAA4675667671266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
20NC_018113TAA4678567961266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_018113AAT4680368141266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
22NC_018113ATAG3851885291250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
23NC_018113TAT5854185541433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
24NC_018113AT6856485751250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
25NC_018113ATTT3878887991225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
26NC_018113AATC3887688861150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
27NC_018113AGA4888788981266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
28NC_018113CAATA3923492471460 %20 %0 %20 %7 %Non-Coding
29NC_018113TTATCT3990099181916.67 %66.67 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
30NC_018113TATTT4991999392120 %80 %0 %0 %9 %Non-Coding
31NC_018113TTTC399419951110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
32NC_018113ATTCT310110101231420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
33NC_018113T141246012473140 %100 %0 %0 %7 %39483103
34NC_018113TTTCT31282912843150 %80 %0 %20 %6 %39483103
35NC_018113A14134211343414100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
36NC_018113TTCTA413473134911920 %60 %0 %20 %5 %Non-Coding
37NC_018113TCTA313634136451225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
38NC_018113AAT413688136991266.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
39NC_018113A12139601397112100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
40NC_018113AAAT314258142691275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
41NC_018113TTTA414858148721525 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
42NC_018113TAAA314997150071175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
43NC_018113CT81713017145160 %50 %0 %50 %6 %Non-Coding
44NC_018113TTA417273172841233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
45NC_018113TGT41747317483110 %66.67 %33.33 %0 %9 %39483096
46NC_018113ATG718320183402133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %39483096
47NC_018113T151936019374150 %100 %0 %0 %6 %39483096
48NC_018113TAA424021240311166.67 %33.33 %0 %0 %9 %39483096
49NC_018113GTT42445324464120 %66.67 %33.33 %0 %8 %39483096
50NC_018113T122707427085120 %100 %0 %0 %0 %39483096
51NC_018113GATA327317273271150 %25 %25 %0 %9 %39483096
52NC_018113GAA427904279151266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
53NC_018113A13280152802713100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
54NC_018113AT728143281551350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
55NC_018113TAT528591286041433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
56NC_018113T172867728693170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
57NC_018113CTAA329186291971250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
58NC_018113A14299342994714100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
59NC_018113T153009030104150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
60NC_018113GAAA331256312671275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
61NC_018113ATCA331456314661150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
62NC_018113TTCA432305323201625 %50 %0 %25 %6 %Non-Coding
63NC_018113GT63243232443120 %50 %50 %0 %8 %Non-Coding
64NC_018113TA732726327391450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
65NC_018113AT733084330971450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
66NC_018113AATA333339333501275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
67NC_018113TCTT33341733429130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
68NC_018113GTTT33375533766120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
69NC_018113GAAA335750357611275 %0 %25 %0 %8 %39483097
70NC_018113TTGC33615136161110 %50 %25 %25 %9 %39483097
71NC_018113T123685336864120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
72NC_018113AG636973369831150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
73NC_018113ATCT337172371831225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
74NC_018113TA637185371961250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
75NC_018113AAAT337236372471275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
76NC_018113AAAAT337708377211480 %20 %0 %0 %7 %Non-Coding
77NC_018113TGAA437787378011550 %25 %25 %0 %6 %Non-Coding
78NC_018113ATA437921379311166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
79NC_018113ATA437995380071366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
80NC_018113ATA438022380341366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
81NC_018113AAAT338150381621375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
82NC_018113GATC338746387561125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
83NC_018113TG64253542545110 %50 %50 %0 %9 %39483097
84NC_018113ATCT443817438321625 %50 %0 %25 %6 %Non-Coding
85NC_018113AT844205442191550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
86NC_018113ATTAA344483444971560 %40 %0 %0 %6 %Non-Coding
87NC_018113ATA444568445801366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
88NC_018113TAG446225462351133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %39483097
89NC_018113TAAA446472464861575 %25 %0 %0 %6 %39483097
90NC_018113AT646492465041350 %50 %0 %0 %7 %39483097
91NC_018113GTAA346528465381150 %25 %25 %0 %9 %39483097
92NC_018113TTTA346820468311225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
93NC_018113AT848086481001550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
94NC_018113AT848155481701650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
95NC_018113AAAT348502485141375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
96NC_018113AAT448752487621166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
97NC_018113TTTAT448898489161920 %80 %0 %0 %10 %Non-Coding
98NC_018113TAA449274492861366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
99NC_018113ATTTTT349292493091816.67 %83.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
100NC_018113AAAG349379493901275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
101NC_018113G154979949813150 %0 %100 %0 %0 %Non-Coding
102NC_018113ATT550012500251433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
103NC_018113TATTT350241502551520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
104NC_018113AGAAT350340503541560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
105NC_018113AT750714507261350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
106NC_018113CATA350769507791150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
107NC_018113GTTT35086550876120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
108NC_018113ACAT351062510721150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
109NC_018113TTATT351110511231420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
110NC_018113CAAA352174521851275 %0 %0 %25 %8 %39483097
111NC_018113TTTA352217522271125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
112NC_018113GTCT35278352794120 %50 %25 %25 %8 %39483098
113NC_018113TTA453010530211233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
114NC_018113CAA453515535251166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
115NC_018113GATT353586535971225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
116NC_018113ATTTCG353630536461716.67 %50 %16.67 %16.67 %5 %Non-Coding
117NC_018113GTATA353662536771640 %40 %20 %0 %6 %Non-Coding
118NC_018113TA653693537051350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
119NC_018113TAGAA353883538961460 %20 %20 %0 %7 %Non-Coding
120NC_018113ATTT353897539071125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
121NC_018113TTAAT454251542691940 %60 %0 %0 %10 %Non-Coding
122NC_018113AGAA354483544941275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
123NC_018113CATTT358044580571420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
124NC_018113AAAG360271602821275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
125NC_018113ATTT361987619981225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
126NC_018113TAGT362011620221225 %50 %25 %0 %0 %Non-Coding
127NC_018113ATT562108621221533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
128NC_018113TCTA363055630661225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
129NC_018113CTT46518765198120 %66.67 %0 %33.33 %8 %39483098
130NC_018113CTTT36551465525120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
131NC_018113TTTC36687166881110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
132NC_018113AAT467124671351266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
133NC_018113ATA467241672511166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
134NC_018113TCT46878168793130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
135NC_018113T156902269036150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
136NC_018113TTTTTA370892709091816.67 %83.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
137NC_018113ATT671123711411933.33 %66.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
138NC_018113TACA371495715061250 %25 %0 %25 %8 %39483099
139NC_018113TAAA371520715311275 %25 %0 %0 %8 %39483099
140NC_018113TAT771641716612133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
141NC_018113TAT571667716801433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
142NC_018113ATATTT371727717451933.33 %66.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
143NC_018113ATA571771717841466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
144NC_018113AAT471788717981166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
145NC_018113TCAT373105731161225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
146NC_018113GAAC373448734591250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
147NC_018113TTTA374374743851225 %75 %0 %0 %8 %39483102
148NC_018113A16746327464716100 %0 %0 %0 %6 %39483102
149NC_018113TAAAA475233752532180 %20 %0 %0 %9 %39483102
150NC_018113TGAA376203762131150 %25 %25 %0 %9 %39483102
151NC_018113CTT47783277842110 %66.67 %0 %33.33 %9 %39483102
152NC_018113TTATA379121791341440 %60 %0 %0 %7 %39483102
153NC_018113G127970279713120 %0 %100 %0 %0 %39483102
154NC_018113TTGA381252812641325 %50 %25 %0 %7 %39483102
155NC_018113A12818348184512100 %0 %0 %0 %8 %39483102
156NC_018113TTTC38221382223110 %75 %0 %25 %9 %39483102
157NC_018113CACTT383931839441420 %40 %0 %40 %7 %39483102
158NC_018113CTTT38414784157110 %75 %0 %25 %9 %39483102
159NC_018113TATCA385993860081640 %40 %0 %20 %6 %39483102
160NC_018113TTTC38652586536120 %75 %0 %25 %8 %39483102
161NC_018113AT686660866701150 %50 %0 %0 %9 %39483102
162NC_018113ATTTT386884868971420 %80 %0 %0 %7 %39483102
163NC_018113AATT387385873951150 %50 %0 %0 %9 %39483102
164NC_018113TTAT387522875331225 %75 %0 %0 %8 %39483102
165NC_018113AATT388164881751250 %50 %0 %0 %8 %39483102
166NC_018113TATT388182881931225 %75 %0 %0 %8 %39483102
167NC_018113CTT48860788618120 %66.67 %0 %33.33 %8 %39483102
168NC_018113GAT489079890891133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %39483102
169NC_018113ATATG390432904461540 %40 %20 %0 %6 %39483102
170NC_018113GAT490475904851133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %39483102
171NC_018113AACGG392016920291440 %0 %40 %20 %7 %39483102
172NC_018113TTCT39217592185110 %75 %0 %25 %9 %39483102
173NC_018113ATCG392933929451325 %25 %25 %25 %7 %39483102
174NC_018113CTTT39336293372110 %75 %0 %25 %9 %39483102
175NC_018113AGA494200942101166.67 %0 %33.33 %0 %9 %39483102
176NC_018113TGAT395244952561325 %50 %25 %0 %7 %39483102
177NC_018113AATA396127961391375 %25 %0 %0 %7 %39483102
178NC_018113GAAGGA396913969301850 %0 %50 %0 %5 %39483102
179NC_018113CTAATT398086981021733.33 %50 %0 %16.67 %5 %39483102
180NC_018113GAAAG398196982111660 %0 %40 %0 %6 %39483102
181NC_018113TCCGG39906499078150 %20 %40 %40 %6 %39483102
182NC_018113TTTGTT3102094102112190 %83.33 %16.67 %0 %10 %39483102
183NC_018113TTC4103488103499120 %66.67 %0 %33.33 %8 %39483103
184NC_018113T16103557103572160 %100 %0 %0 %6 %39483103
185NC_018113TTCTA51040791041022420 %60 %0 %20 %8 %39483103
186NC_018113TATTAG41041011041232333.33 %50 %16.67 %0 %4 %39483103
187NC_018113ATTAGT31041281041441733.33 %50 %16.67 %0 %5 %39483103
188NC_018113TCTA31078121078231225 %50 %0 %25 %8 %39483103
189NC_018113AAGG31079611079711150 %0 %50 %0 %9 %39483103
190NC_018113GAGG31106901107011225 %0 %75 %0 %8 %39483103
191NC_018113AGGT31109021109131225 %25 %50 %0 %8 %39483103
192NC_018113TAAG31120221120321150 %25 %25 %0 %9 %39483103
193NC_018113AGAAA31139581139731680 %0 %20 %0 %6 %39483103
194NC_018113GAA51141391141531566.67 %0 %33.33 %0 %6 %39483103
195NC_018113A1711493111494717100 %0 %0 %0 %5 %39483103
196NC_018113A1311505311506513100 %0 %0 %0 %7 %39483103
197NC_018113A1311557611558813100 %0 %0 %0 %7 %39483103
198NC_018113TCTT3116201116212120 %75 %0 %25 %8 %39483103
199NC_018113AT61164451164551150 %50 %0 %0 %9 %39483103
200NC_018113A1911682611684419100 %0 %0 %0 %5 %39483103
201NC_018113AGTT31176511176611125 %50 %25 %0 %9 %39483103
202NC_018113GAAT31178091178201250 %25 %25 %0 %0 %39483103
203NC_018113ATTA31179721179831250 %50 %0 %0 %8 %39483103
204NC_018113AAG41187511187621266.67 %0 %33.33 %0 %8 %39483103
205NC_018113AAT41189891190011366.67 %33.33 %0 %0 %7 %39483103
206NC_018113TAA41196011196121266.67 %33.33 %0 %0 %8 %39483103
207NC_018113AAATA31235611235741480 %20 %0 %0 %7 %39483103
208NC_018113AAAG31237741237851275 %0 %25 %0 %8 %39483103
209NC_018113CAAA31245941246041175 %0 %0 %25 %9 %39483103
210NC_018113ATCA31258391258501250 %25 %0 %25 %0 %39483103
211NC_018113TTCTT3126539126553150 %80 %0 %20 %6 %39483103
212NC_018113TCTT3128072128082110 %75 %0 %25 %9 %39483103
213NC_018113TTAAGT31280861281021733.33 %50 %16.67 %0 %5 %39483103
214NC_018113ATTT31296321296441325 %75 %0 %0 %7 %39483103
215NC_018113CAA41297721297821166.67 %0 %0 %33.33 %9 %39483103
216NC_018113TGAA41298771298921650 %25 %25 %0 %6 %39483103
217NC_018113ATT61303961304121733.33 %66.67 %0 %0 %5 %39483103
218NC_018113TAT41304171304291333.33 %66.67 %0 %0 %7 %39483103
219NC_018113TA71308741308861350 %50 %0 %0 %7 %39483103
220NC_018113AACAA31309511309641480 %0 %0 %20 %7 %39483103
221NC_018113AGAA31310071310181275 %0 %25 %0 %8 %39483103
222NC_018113TA61311001311101150 %50 %0 %0 %9 %39483103
223NC_018113A1313140113141313100 %0 %0 %0 %7 %39483103
224NC_018113TTA41314161314261133.33 %66.67 %0 %0 %9 %39483103
225NC_018113TAA51317111317261666.67 %33.33 %0 %0 %6 %39483103
226NC_018113ATTT31326581326681125 %75 %0 %0 %9 %39483103
227NC_018113TTA41335431335541233.33 %66.67 %0 %0 %8 %39483103
228NC_018113ATTT31336371336491325 %75 %0 %0 %7 %39483103
229NC_018113TTAATT31341871342031733.33 %66.67 %0 %0 %5 %39483103
230NC_018113TTTAAT31342321342501933.33 %66.67 %0 %0 %5 %39483103
231NC_018113TA61351981352081150 %50 %0 %0 %9 %39483103
232NC_018113CTTA31363041363141125 %50 %0 %25 %9 %39483103
233NC_018113CCTT3140365140375110 %50 %0 %50 %9 %39483103
234NC_018113GGAT31409081409191225 %25 %50 %0 %8 %39483103
235NC_018113ACTAAT31441921442081750 %33.33 %0 %16.67 %5 %39483103
236NC_018113ACTAAT41442121442342350 %33.33 %0 %16.67 %4 %39483103
237NC_018113A1514476914478315100 %0 %0 %0 %6 %39483103
238NC_018113AATA41448161448311675 %25 %0 %0 %6 %39483103
239NC_018113GAA41448371448481266.67 %0 %33.33 %0 %8 %39483103
240NC_018113ACCGG31492571492711520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding
241NC_018113TTTC3149444149455120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
242NC_018113CTTTC3150125150140160 %60 %0 %40 %6 %Non-Coding
243NC_018113CATAC31505351505481440 %20 %0 %40 %7 %Non-Coding
244NC_018113CTCCTT3151405151422180 %50 %0 %50 %5 %39483103
245NC_018113ATCA31531221531341350 %25 %0 %25 %7 %39483103
246NC_018113TGAT31532171532291325 %50 %25 %0 %7 %39483103
247NC_018113ACC41533261533361133.33 %0 %0 %66.67 %9 %39483103
248NC_018113TTC4154125154135110 %66.67 %0 %33.33 %9 %39483103
249NC_018113AAAG31549641549741175 %0 %25 %0 %9 %39483103
250NC_018113CGAT31553911554031325 %25 %25 %25 %7 %39483103
251NC_018113TATT31560231560341225 %75 %0 %0 %8 %39483103
252NC_018113ATC41578511578611133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
253NC_018113ATC41592471592571133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %39483103
254NC_018113GAA51597171597311566.67 %0 %33.33 %0 %6 %39483103