Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Gossypium capitis-viridis chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_018111TGT449424952110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
2NC_018111GTT450395049110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
3NC_018111TAA4667966901266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
4NC_018111AAT4669767081266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_018111TAT4842084341533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
6NC_018111AGA4876887791266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
7NC_018111AAT413532135431266.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
8NC_018111TGT41731217322110 %66.67 %33.33 %0 %9 %39483078
9NC_018111ATG718159181792133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %39483078
10NC_018111TAA423851238611166.67 %33.33 %0 %0 %9 %39483079
11NC_018111GTT42428324294120 %66.67 %33.33 %0 %8 %39483079
12NC_018111GAA427734277451266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
13NC_018111TAT428403284131133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
14NC_018111TTA436703367141233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
15NC_018111ATA537796378111666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
16NC_018111CTA441931419421233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %39483079
17NC_018111ATA444343443551366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
18NC_018111TAG446019460291133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %39483080
19NC_018111AAT448558485681166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
20NC_018111TAA449091491031366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
21NC_018111ATT549784497971433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
22NC_018111TTA452729527401233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
23NC_018111CAA453234532441166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
24NC_018111ATT561904619181533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
25NC_018111CTT46495864969120 %66.67 %0 %33.33 %8 %39483081
26NC_018111AAT466900669111266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
27NC_018111ATA467017670271166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
28NC_018111TCT46855668568130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
29NC_018111ATA571446714591466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
30NC_018111AAT471463714731166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
31NC_018111CTT47746977479110 %66.67 %0 %33.33 %9 %39483084
32NC_018111ATA487782877931266.67 %33.33 %0 %0 %8 %39483084
33NC_018111CTT48818588196120 %66.67 %0 %33.33 %8 %39483084
34NC_018111GAT488657886671133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %39483084
35NC_018111GAT490053900631133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %39483084
36NC_018111AGA493778937881166.67 %0 %33.33 %0 %9 %39483084
37NC_018111TTC4103077103088120 %66.67 %0 %33.33 %8 %39483086
38NC_018111GAA51137401137541566.67 %0 %33.33 %0 %6 %39483086
39NC_018111AAG41183461183571266.67 %0 %33.33 %0 %8 %39483086
40NC_018111AAT41185781185901366.67 %33.33 %0 %0 %7 %39483086
41NC_018111TAA41191841191951266.67 %33.33 %0 %0 %8 %39483086
42NC_018111CAA41292851292951166.67 %0 %0 %33.33 %9 %39483086
43NC_018111TAT41299191299311333.33 %66.67 %0 %0 %7 %39483086
44NC_018111TAA51311981312131666.67 %33.33 %0 %0 %6 %39483086
45NC_018111ATT41337921338031233.33 %66.67 %0 %0 %8 %39483086
46NC_018111AAT51338181338311466.67 %33.33 %0 %0 %7 %39483086
47NC_018111GAA41444451444561266.67 %0 %33.33 %0 %8 %39483086
48NC_018111ACC41529451529551133.33 %0 %0 %66.67 %9 %39483085
49NC_018111TTC4153744153754110 %66.67 %0 %33.33 %9 %39483085
50NC_018111ATC41574701574801133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
51NC_018111ATC41588661588761133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %39483086
52NC_018111GAA51593361593501566.67 %0 %33.33 %0 %6 %39483086