ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Gossypium somalense chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_018110ATT5484848621533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
2NC_018110TGT449084918110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
3NC_018110TAA4663866491266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
4NC_018110AAT4665666671266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_018110TAT5838383961433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
6NC_018110AGA4872387341266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
7NC_018110TAT413377133891333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
8NC_018110AAT413484134951266.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
9NC_018110TTA417069170801233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
10NC_018110ATG718116181362133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %39483070
11NC_018110TAA423813238231166.67 %33.33 %0 %0 %9 %39483070
12NC_018110GTT42424524256120 %66.67 %33.33 %0 %8 %39483070
13NC_018110GAA427696277071266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
14NC_018110TAT428377283871133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
15NC_018110TTA436885368961233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
16NC_018110ATA437865378751166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
17NC_018110ATA437957379691366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
18NC_018110ATA444508445201366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
19NC_018110TAG446166461761133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %39483071
20NC_018110ATA448019480311366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
21NC_018110AAT448686486961166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
22NC_018110ATT549893499061433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
23NC_018110TTA452877528881233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
24NC_018110CAA453382533921166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
25NC_018110ATT461909619201233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
26NC_018110CTT46495964970120 %66.67 %0 %33.33 %8 %39483072
27NC_018110AAT466896669071266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
28NC_018110ATA467013670231166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
29NC_018110TCT46855068562130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
30NC_018110ATT670901709191933.33 %66.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
31NC_018110TAT571408714211433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
32NC_018110TAT571463714781633.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
33NC_018110ATA571490715031466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
34NC_018110AAT471507715171166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
35NC_018110CTT47755477564110 %66.67 %0 %33.33 %9 %39483075
36NC_018110ATA587863878771566.67 %33.33 %0 %0 %6 %39483075
37NC_018110CTT48827188282120 %66.67 %0 %33.33 %8 %39483075
38NC_018110GAT488743887531133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %39483075
39NC_018110GAT490139901491133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %39483075
40NC_018110AGA493864938741166.67 %0 %33.33 %0 %9 %39483075
41NC_018110TTC4103144103155120 %66.67 %0 %33.33 %8 %39483077
42NC_018110GAA51137911138051566.67 %0 %33.33 %0 %6 %39483077
43NC_018110AAG41183971184081266.67 %0 %33.33 %0 %8 %39483077
44NC_018110AAT41186351186471366.67 %33.33 %0 %0 %7 %39483077
45NC_018110TAA41192471192581266.67 %33.33 %0 %0 %8 %39483077
46NC_018110CAA41294091294191166.67 %0 %0 %33.33 %9 %39483077
47NC_018110TAT41300461300581333.33 %66.67 %0 %0 %7 %39483077
48NC_018110TAT41310491310591133.33 %66.67 %0 %0 %9 %39483077
49NC_018110AAT51313401313551666.67 %33.33 %0 %0 %6 %39483077
50NC_018110TAT41338621338741333.33 %66.67 %0 %0 %7 %39483077
51NC_018110GAA41445351445461266.67 %0 %33.33 %0 %8 %39483077
52NC_018110ACC41530161530261133.33 %0 %0 %66.67 %9 %39483077
53NC_018110TTC4153815153825110 %66.67 %0 %33.33 %9 %39483077
54NC_018110ATC41575411575511133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
55NC_018110ATC41589371589471133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %39483077
56NC_018110GAA51594071594211566.67 %0 %33.33 %0 %6 %39483077