ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Aspergillus oryzae 3.042 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018100	AAT	4	203	213	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_018100	TAA	4	1150	1161	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_018100	TAA	4	1279	1289	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_018100	ATA	4	1839	1849	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_018100	TAT	4	1942	1953	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39339540
6	NC_018100	TAA	4	1982	1993	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39339540
7	NC_018100	TTA	4	1995	2006	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39339540
8	NC_018100	AAT	4	2886	2897	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39339540
9	NC_018100	TGT	4	3788	3799	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39339540
10	NC_018100	TAT	4	4212	4223	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_018100	TAA	4	4464	4475	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39339540
12	NC_018100	TAT	4	5882	5893	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_018100	TAA	4	5979	5990	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_018100	ATA	4	6011	6022	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39339540
15	NC_018100	TAT	5	7723	7737	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_018100	ATT	5	7966	7980	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_018100	AAT	4	8339	8349	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39339540
18	NC_018100	ATT	5	8348	8362	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	39339540
19	NC_018100	ATT	4	8750	8761	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_018100	ATT	4	8768	8779	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_018100	TAT	5	8792	8805	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39339539
22	NC_018100	ATA	5	9359	9373	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	39339539
23	NC_018100	ATA	4	12049	12061	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_018100	ATT	4	13746	13757	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_018100	ACT	4	13899	13910	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_018100	TAA	4	15207	15218	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_018100	TAA	4	15420	15431	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_018100	GAT	4	17745	17756	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_018100	TAA	4	18976	18987	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39339541
30	NC_018100	ACT	4	20777	20788	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_018100	TAT	4	22124	22134	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39339541
32	NC_018100	ATT	4	22513	22525	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_018100	ATT	4	22673	22684	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_018100	ATA	4	23905	23918	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39339540
35	NC_018100	TAA	6	24292	24309	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	39339540
36	NC_018100	ATT	4	24846	24857	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018100	ATT	5	24984	24998	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_018100	ATT	4	25011	25022	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_018100	TCT	4	25557	25568	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
40	NC_018100	TTA	4	25826	25837	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_018100	AGA	4	26709	26719	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	39339540
42	NC_018100	TAA	4	27093	27103	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39339540
43	NC_018100	TTA	4	27697	27709	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_018100	TAA	5	27729	27743	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_018100	ATT	4	27880	27892	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Aspergillus oryzae 3.042 mitochondrion