ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Aspergillus oryzae 3.042 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018100	TA	11	73	95	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_018100	A	15	111	125	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_018100	AAT	4	203	213	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_018100	TTAA	3	393	404	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_018100	GATT	3	803	815	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_018100	TA	6	982	994	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_018100	TAA	4	1150	1161	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_018100	TAA	4	1279	1289	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_018100	ATA	4	1839	1849	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_018100	TTAAA	4	1882	1901	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
11	NC_018100	AT	7	1906	1919	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	39339540
12	NC_018100	TAT	4	1942	1953	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39339540
13	NC_018100	TAA	4	1982	1993	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39339540
14	NC_018100	TTA	4	1995	2006	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39339540
15	NC_018100	AATT	4	2296	2310	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	39339540
16	NC_018100	AAT	4	2886	2897	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39339540
17	NC_018100	TGT	4	3788	3799	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39339540
18	NC_018100	TAT	4	4212	4223	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_018100	TTAA	3	4434	4446	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	39339540
20	NC_018100	TAA	4	4464	4475	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39339540
21	NC_018100	AT	12	5850	5871	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_018100	TAT	4	5882	5893	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_018100	A	18	5964	5981	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
24	NC_018100	TAA	4	5979	5990	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_018100	ATA	4	6011	6022	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39339540
26	NC_018100	AT	9	6277	6293	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
27	NC_018100	TC	6	6516	6526	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
28	NC_018100	A	12	7085	7096	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018100	ATTT	3	7165	7176	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_018100	TAT	5	7723	7737	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_018100	ATT	5	7966	7980	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_018100	A	12	7986	7997	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018100	AAT	4	8339	8349	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39339540
34	NC_018100	ATT	5	8348	8362	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	39339540
35	NC_018100	T	12	8527	8538	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	39339540
36	NC_018100	TAATT	4	8640	8660	21	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	39339540
37	NC_018100	ATT	4	8750	8761	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_018100	ATT	4	8768	8779	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_018100	TAT	5	8792	8805	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39339539
40	NC_018100	ATA	5	9359	9373	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	39339539
41	NC_018100	AT	7	10249	10261	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_018100	TAAAAA	5	10446	10476	31	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_018100	TAATT	3	10778	10792	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
44	NC_018100	TAAGAT	3	10922	10938	17	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
45	NC_018100	TA	6	11011	11021	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_018100	ATA	4	12049	12061	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_018100	TAGA	3	12146	12156	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_018100	TTAA	3	12423	12433	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39339540
49	NC_018100	TTGTT	3	12714	12728	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	39339540
50	NC_018100	TATT	3	12730	12741	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39339540
51	NC_018100	ATT	4	13746	13757	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_018100	ACT	4	13899	13910	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
53	NC_018100	AATA	4	14296	14310	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_018100	TACT	3	15038	15049	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
55	NC_018100	TAA	4	15207	15218	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_018100	TAA	4	15420	15431	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_018100	TACT	3	15537	15547	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
58	NC_018100	CTTA	3	16266	16276	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
59	NC_018100	ATTT	3	16929	16939	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_018100	GAT	4	17745	17756	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_018100	ACCT	3	18535	18547	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	39339541
62	NC_018100	TAA	4	18976	18987	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39339541
63	NC_018100	AAATA	4	19066	19086	21	80 %	20 %	0 %	0 %	9 %	39339541
64	NC_018100	TA	6	19188	19199	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_018100	AAAC	3	19290	19301	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
66	NC_018100	TA	7	19316	19328	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_018100	TA	7	19406	19419	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_018100	ACT	4	20777	20788	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
69	NC_018100	TA	6	20890	20900	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_018100	AAATAA	3	20953	20970	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
71	NC_018100	A	13	20963	20975	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018100	TA	6	21096	21106	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_018100	TAT	4	22124	22134	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39339541
74	NC_018100	ATT	4	22513	22525	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_018100	AATT	3	22527	22538	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_018100	ATT	4	22673	22684	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_018100	AT	11	22754	22775	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_018100	ATA	4	23905	23918	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39339540
79	NC_018100	TAA	6	24292	24309	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	39339540
80	NC_018100	AT	6	24804	24814	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_018100	ATT	4	24846	24857	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018100	ATT	5	24984	24998	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
83	NC_018100	ATT	4	25011	25022	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_018100	TTTC	3	25434	25445	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
85	NC_018100	TCT	4	25557	25568	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
86	NC_018100	TTA	4	25826	25837	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_018100	TA	7	25923	25936	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_018100	ATATTA	3	26024	26040	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
89	NC_018100	AGA	4	26709	26719	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	39339540
90	NC_018100	TAA	4	27093	27103	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39339540
91	NC_018100	AAAT	3	27597	27608	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_018100	TTA	4	27697	27709	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_018100	TAA	5	27729	27743	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
94	NC_018100	TAAT	5	27789	27809	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_018100	ATT	4	27880	27892	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_018100	AAAT	3	28007	28018	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_018100	TTTA	3	28030	28040	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39339540

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Aspergillus oryzae 3.042 mitochondrion