ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ahamus yunnanensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018095	ATTTT	4	68	87	20	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
2	NC_018095	ATTTAA	3	243	260	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	39328165
3	NC_018095	ATA	4	384	395	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39328165
4	NC_018095	ATTT	5	825	843	19	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	39328165
5	NC_018095	ATT	4	916	926	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39328165
6	NC_018095	ATTA	4	1018	1032	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	39328165
7	NC_018095	TAT	4	1097	1107	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39328165
8	NC_018095	TAA	4	1171	1181	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39328165
9	NC_018095	AATT	3	1688	1699	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39328165
10	NC_018095	TAA	4	1741	1751	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39328165
11	NC_018095	ATA	7	2843	2863	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39328165
12	NC_018095	TTAATT	3	3146	3163	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	39328165
13	NC_018095	AT	6	3178	3188	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39328165
14	NC_018095	ATT	4	3307	3317	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39328165
15	NC_018095	CATTA	3	3339	3352	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	39328165
16	NC_018095	AATT	3	3714	3725	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39328165
17	NC_018095	TTTATT	3	3925	3942	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	39328165
18	NC_018095	ATT	4	3959	3969	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39328165
19	NC_018095	CTTT	3	4253	4264	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	39328165
20	NC_018095	AATT	3	4587	4598	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39328165
21	NC_018095	ATT	4	4838	4848	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39328166
22	NC_018095	T	15	4986	5000	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	39328166
23	NC_018095	TA	7	5506	5518	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_018095	TTTAA	4	5546	5565	20	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
25	NC_018095	TAT	7	5567	5587	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39328166
26	NC_018095	ATT	6	5593	5610	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	39328166
27	NC_018095	ATA	4	5620	5631	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39328166
28	NC_018095	TAT	4	5634	5644	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39328166
29	NC_018095	AAT	4	5812	5823	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39328166
30	NC_018095	TAT	4	5856	5867	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39328166
31	NC_018095	AACT	3	5908	5920	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	39328166
32	NC_018095	TAA	4	5988	5998	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_018095	TAA	4	6100	6110	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_018095	ATTT	3	6241	6251	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_018095	AATA	5	6331	6351	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39328166
36	NC_018095	TAAA	3	6353	6363	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39328166
37	NC_018095	ATAAAT	3	6373	6389	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	39328166
38	NC_018095	AAT	4	6529	6540	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39328166
39	NC_018095	AAAT	3	6587	6598	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	39328166
40	NC_018095	ATA	4	6777	6789	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39328166
41	NC_018095	ATAA	3	6869	6880	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	39328166
42	NC_018095	TTA	4	7210	7221	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39328166
43	NC_018095	AATT	3	7349	7360	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39328166
44	NC_018095	AAG	4	7459	7470	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	39328166
45	NC_018095	TAA	4	7760	7771	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39328166
46	NC_018095	ATA	4	7783	7794	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39328166
47	NC_018095	AAAT	3	7795	7805	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39328166
48	NC_018095	TA	6	7843	7853	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39328166
49	NC_018095	ATAA	3	7884	7894	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39328166
50	NC_018095	AAAT	3	8075	8086	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_018095	TTAAA	4	8116	8134	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
52	NC_018095	TAAA	5	8138	8158	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39328166
53	NC_018095	TAA	4	8197	8211	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	39328166
54	NC_018095	AATT	3	8713	8725	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	39328166
55	NC_018095	A	12	8996	9007	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	39328166
56	NC_018095	AAAT	3	9043	9053	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39328166
57	NC_018095	AAAAT	3	9132	9145	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	39328166
58	NC_018095	TAA	12	9172	9207	36	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39328166
59	NC_018095	T	12	9226	9237	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	39328166
60	NC_018095	TAT	4	9256	9267	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39328166
61	NC_018095	TAA	4	9367	9378	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39328166
62	NC_018095	TAT	4	9394	9404	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39328166
63	NC_018095	AAAT	3	9458	9469	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	39328166
64	NC_018095	AATTA	3	9618	9631	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	39328166
65	NC_018095	A	14	9634	9647	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	39328166
66	NC_018095	ATT	5	9876	9889	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_018095	AAT	4	9926	9937	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39328166
68	NC_018095	ATT	5	9986	10000	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	39328166
69	NC_018095	TTA	5	10155	10168	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39328166
70	NC_018095	ATA	8	10168	10190	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39328166
71	NC_018095	AATT	3	10487	10498	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39328166
72	NC_018095	TA	6	10764	10775	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39328166
73	NC_018095	ATTT	3	11028	11038	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39328166
74	NC_018095	TAT	4	11137	11148	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39328166
75	NC_018095	AAT	4	11143	11154	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39328166
76	NC_018095	ATT	4	11429	11440	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39328166
77	NC_018095	AAT	4	11626	11637	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_018095	A	18	11685	11702	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	39328166
79	NC_018095	AAAT	3	11817	11828	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	39328166
80	NC_018095	TAAAA	3	12260	12273	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	39328166
81	NC_018095	TAAA	3	12606	12617	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_018095	TTTA	3	12742	12753	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_018095	T	12	12882	12893	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_018095	A	14	12901	12914	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_018095	TCAT	3	12962	12973	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
86	NC_018095	TAA	4	13070	13081	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_018095	TTCA	4	13180	13195	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
88	NC_018095	TAA	4	13378	13389	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_018095	AAT	4	13390	13400	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_018095	TTA	4	13411	13422	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_018095	AAATT	3	13509	13523	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
92	NC_018095	AAT	4	13524	13535	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_018095	ATTT	3	13544	13555	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_018095	ATTA	3	13755	13766	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018095	TTAA	3	13945	13956	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_018095	ATTAA	3	14161	14175	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018095	TAA	4	14578	14589	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018095	TAAT	3	14607	14618	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_018095	TTCTTT	3	14827	14844	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
100	NC_018095	T	15	14836	14850	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
101	NC_018095	TA	12	14858	14882	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_018095	ATT	4	14896	14907	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_018095	T	15	14909	14923	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018095	AT	6	14925	14936	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_018095	TA	6	14949	14959	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_018095	AT	7	15030	15042	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_018095	AT	9	15066	15083	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
108	NC_018095	TTTA	3	15093	15103	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_018095	AT	13	15158	15182	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_018095	ATTTTA	3	15267	15285	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
111	NC_018095	TTTA	3	15337	15348	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_018095	ATTTTA	3	15374	15392	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
113	NC_018095	TTTA	3	15444	15455	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_018095	ATTTTA	3	15481	15499	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
115	NC_018095	TTTA	3	15551	15562	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_018095	ATTTTA	3	15588	15606	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
117	NC_018095	TTTA	3	15658	15669	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_018095	ATTTTA	3	15695	15713	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
119	NC_018095	ATA	4	15779	15789	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

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