ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ahamus yunnanensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018095	ATA	4	384	395	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39328165
2	NC_018095	ATT	4	916	926	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	39328165
3	NC_018095	TAT	4	1097	1107	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	39328165
4	NC_018095	TAA	4	1171	1181	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	39328165
5	NC_018095	TAA	4	1741	1751	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	39328165
6	NC_018095	ATA	7	2843	2863	21	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	39328165
7	NC_018095	ATT	4	3307	3317	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	39328165
8	NC_018095	ATT	4	3959	3969	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	39328165
9	NC_018095	ATT	4	4838	4848	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	39328166
10	NC_018095	TAT	7	5567	5587	21	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	39328166
11	NC_018095	ATT	6	5593	5610	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	39328166
12	NC_018095	ATA	4	5620	5631	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39328166
13	NC_018095	TAT	4	5634	5644	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	39328166
14	NC_018095	AAT	4	5812	5823	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39328166
15	NC_018095	TAT	4	5856	5867	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	39328166
16	NC_018095	TAA	4	5988	5998	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_018095	TAA	4	6100	6110	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_018095	AAT	4	6529	6540	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39328166
19	NC_018095	ATA	4	6777	6789	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	39328166
20	NC_018095	TTA	4	7210	7221	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	39328166
21	NC_018095	AAG	4	7459	7470	12	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	39328166
22	NC_018095	TAA	4	7760	7771	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39328166
23	NC_018095	ATA	4	7783	7794	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39328166
24	NC_018095	TAA	4	8197	8211	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	39328166
25	NC_018095	TAA	12	9172	9207	36	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39328166
26	NC_018095	TAT	4	9256	9267	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	39328166
27	NC_018095	TAA	4	9367	9378	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39328166
28	NC_018095	TAT	4	9394	9404	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	39328166
29	NC_018095	ATT	5	9876	9889	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_018095	AAT	4	9926	9937	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39328166
31	NC_018095	ATT	5	9986	10000	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	39328166
32	NC_018095	TTA	5	10155	10168	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	39328166
33	NC_018095	ATA	8	10168	10190	23	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39328166
34	NC_018095	TAT	4	11137	11148	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	39328166
35	NC_018095	AAT	4	11143	11154	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39328166
36	NC_018095	ATT	4	11429	11440	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	39328166
37	NC_018095	AAT	4	11626	11637	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_018095	TAA	4	13070	13081	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_018095	TAA	4	13378	13389	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_018095	AAT	4	13390	13400	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_018095	TTA	4	13411	13422	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_018095	AAT	4	13524	13535	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_018095	TAA	4	14578	14589	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018095	ATT	4	14896	14907	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_018095	ATA	4	15779	15789	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ahamus yunnanensis mitochondrion