ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Thitarodes renzhiensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018094	ATA	4	354	365	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39328164
2	NC_018094	ATT	4	648	658	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	39328164
3	NC_018094	TAT	4	1067	1077	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	39328164
4	NC_018094	AAT	4	1516	1527	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39328164
5	NC_018094	TAA	4	1708	1718	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	39328164
6	NC_018094	ATA	5	2810	2824	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	39328164
7	NC_018094	ATT	4	3273	3283	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	39328164
8	NC_018094	ATT	4	3924	3934	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	39328164
9	NC_018094	ATT	4	4803	4813	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	39328164
10	NC_018094	TAT	5	5538	5552	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	39328164
11	NC_018094	ATT	6	5558	5575	18	33.33 %	66.67 %	0 %	5 %	39328164
12	NC_018094	ATA	4	5585	5596	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39328164
13	NC_018094	TAT	4	5819	5829	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	39328164
14	NC_018094	TAA	4	5953	5963	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_018094	TAA	4	6061	6071	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_018094	TAA	4	6602	6612	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	39328164
17	NC_018094	ATA	4	6733	6745	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	39328164
18	NC_018094	TTA	4	7166	7177	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	39328164
19	NC_018094	AAG	4	7415	7426	12	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	39328164
20	NC_018094	TAA	4	7709	7721	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	39328164
21	NC_018094	TTA	4	7874	7885	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	39328164
22	NC_018094	TAA	4	8153	8167	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	39328164
23	NC_018094	TAT	4	8720	8731	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	39328164
24	NC_018094	AAT	8	9135	9157	23	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39328164
25	NC_018094	ATA	4	9322	9333	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39328164
26	NC_018094	TAT	4	9350	9360	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	39328164
27	NC_018094	ATT	4	9831	9841	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_018094	TAT	5	10111	10124	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	39328165
29	NC_018094	TAA	5	10126	10140	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	39328165
30	NC_018094	TAT	4	10148	10159	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	39328165
31	NC_018094	ATA	5	11096	11110	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	39328165
32	NC_018094	ATT	7	11380	11400	21	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	39328165
33	NC_018094	AAT	4	13348	13358	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_018094	TTA	4	13369	13380	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_018094	AAT	4	13482	13493	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_018094	TAA	4	14546	14557	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Thitarodes renzhiensis mitochondrion