ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Thitarodes renzhiensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018094	ATTTAA	3	213	230	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	39328164
2	NC_018094	ATA	4	354	365	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39328164
3	NC_018094	ATT	4	648	658	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39328164
4	NC_018094	ATTT	5	795	813	19	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	39328164
5	NC_018094	ATTA	4	988	1002	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	39328164
6	NC_018094	TAT	4	1067	1077	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39328164
7	NC_018094	ATTA	3	1151	1162	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39328164
8	NC_018094	AATT	3	1186	1198	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	39328164
9	NC_018094	AAT	4	1516	1527	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39328164
10	NC_018094	TAA	4	1708	1718	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39328164
11	NC_018094	ATA	5	2810	2824	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	39328164
12	NC_018094	TAATTA	3	3113	3130	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	39328164
13	NC_018094	ATT	4	3273	3283	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39328164
14	NC_018094	AATT	3	3680	3691	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39328164
15	NC_018094	TATTTT	3	3892	3914	23	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	39328164
16	NC_018094	ATT	4	3924	3934	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39328164
17	NC_018094	AATTA	3	3945	3958	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	39328164
18	NC_018094	ATT	4	4803	4813	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39328164
19	NC_018094	T	13	4953	4965	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	39328164
20	NC_018094	TTTAA	4	5511	5530	20	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
21	NC_018094	TAT	5	5538	5552	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	39328164
22	NC_018094	ATT	6	5558	5575	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	39328164
23	NC_018094	ATA	4	5585	5596	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39328164
24	NC_018094	ATTT	3	5787	5798	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39328164
25	NC_018094	TAT	4	5819	5829	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39328164
26	NC_018094	TAA	4	5953	5963	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_018094	TAA	4	6061	6071	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_018094	TAAA	3	6309	6319	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39328164
29	NC_018094	ATAAAT	3	6329	6345	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	39328164
30	NC_018094	AAAT	3	6543	6554	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	39328164
31	NC_018094	TAA	4	6602	6612	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39328164
32	NC_018094	ATA	4	6733	6745	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39328164
33	NC_018094	ATAA	3	6825	6836	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	39328164
34	NC_018094	TTA	4	7166	7177	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39328164
35	NC_018094	AAG	4	7415	7426	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	39328164
36	NC_018094	TAA	4	7709	7721	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39328164
37	NC_018094	TA	6	7799	7809	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39328164
38	NC_018094	AAAT	3	7845	7856	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	39328164
39	NC_018094	TTA	4	7874	7885	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39328164
40	NC_018094	AAATAA	3	7977	7994	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	39328164
41	NC_018094	AAATT	4	8074	8092	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
42	NC_018094	TAA	4	8153	8167	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	39328164
43	NC_018094	TAT	4	8720	8731	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39328164
44	NC_018094	AAAAT	3	9088	9101	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	39328164
45	NC_018094	AAT	8	9135	9157	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39328164
46	NC_018094	ATA	4	9322	9333	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39328164
47	NC_018094	TAT	4	9350	9360	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39328164
48	NC_018094	A	14	9590	9603	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	39328165
49	NC_018094	AAAT	3	9694	9706	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	39328165
50	NC_018094	ATT	4	9831	9841	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_018094	ATTTT	4	10007	10026	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	39328165
52	NC_018094	TAT	5	10111	10124	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39328165
53	NC_018094	TAA	5	10126	10140	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	39328165
54	NC_018094	TAT	4	10148	10159	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39328165
55	NC_018094	ATTT	3	10983	10993	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39328165
56	NC_018094	ATA	5	11096	11110	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	39328165
57	NC_018094	ATT	7	11380	11400	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39328165
58	NC_018094	TAAA	3	11821	11831	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39328165
59	NC_018094	TAAATA	3	12564	12580	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
60	NC_018094	T	12	12842	12853	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_018094	A	14	12861	12874	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_018094	TAAA	4	13000	13015	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_018094	TTCA	4	13140	13155	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
64	NC_018094	AAT	4	13348	13358	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_018094	TTA	4	13369	13380	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_018094	TAAT	3	13413	13424	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018094	AAATT	3	13467	13481	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_018094	AAT	4	13482	13493	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_018094	ATTA	3	13715	13726	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018094	ATTAA	3	14130	14144	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018094	TAA	4	14546	14557	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018094	ATTA	6	14568	14592	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_018094	TTCTTT	3	14795	14812	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
74	NC_018094	TA	7	14828	14841	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_018094	TA	7	14901	14914	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_018094	AT	7	14988	15000	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_018094	TA	6	15021	15032	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_018094	TTTA	3	15049	15059	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_018094	TAAT	3	15064	15075	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_018094	TA	9	15079	15095	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
81	NC_018094	AT	11	15116	15138	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_018094	A	13	15202	15214	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_018094	A	13	15315	15327	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_018094	A	13	15428	15440	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_018094	A	13	15541	15553	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_018094	A	13	15766	15778	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_018094	A	13	15879	15891	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_018094	A	13	15992	16004	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_018094	A	13	16105	16117	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

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