ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Lachancea kluyveri mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018056	AATT	3	92	103	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018056	ATAA	3	105	116	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018056	AAAT	8	212	242	31	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_018056	GCCC	3	294	304	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	Non-Coding
5	NC_018056	TAAA	3	358	369	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018056	AATT	3	467	478	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_018056	GCCC	3	734	745	12	0 %	0 %	25 %	75 %	8 %	Non-Coding
8	NC_018056	ATTT	3	1462	1474	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	39123335
9	NC_018056	ATTA	4	1624	1639	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018056	TATT	3	1849	1860	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018056	AAAT	4	2007	2022	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_018056	TAAA	3	2030	2042	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_018056	TTAA	3	2270	2280	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_018056	AATA	5	2439	2457	19	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
15	NC_018056	TAAT	5	2545	2564	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
16	NC_018056	AAAT	3	2734	2744	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_018056	TTTA	3	3877	3888	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018056	TATT	6	3952	3975	24	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_018056	ATAA	3	4000	4010	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_018056	TATT	6	4038	4060	23	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_018056	ATTA	5	4376	4399	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_018056	TAAC	9	4417	4452	36	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
23	NC_018056	AAAT	5	4449	4468	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
24	NC_018056	ATAA	3	4559	4569	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_018056	ATTA	8	5079	5110	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_018056	TTTA	3	5430	5441	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_018056	TAAT	4	5596	5611	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_018056	TATT	3	5743	5755	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_018056	TATT	7	5800	5827	28	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_018056	ATAA	5	7028	7047	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
31	NC_018056	ATTA	4	7106	7120	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_018056	TTTA	4	7449	7464	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_018056	TTAA	3	7498	7508	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_018056	AATT	4	7534	7549	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_018056	ATTA	4	7594	7608	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_018056	TAAT	5	7783	7802	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
37	NC_018056	TTAA	4	7981	7995	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_018056	ATAA	3	8223	8235	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_018056	TAAT	6	8264	8288	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_018056	TACT	6	8561	8584	24	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
41	NC_018056	TTAA	3	8622	8632	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_018056	TTAA	4	8655	8670	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018056	TAAT	4	8997	9012	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
44	NC_018056	TTTA	3	9253	9263	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_018056	TTAT	3	9839	9850	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_018056	ATTA	4	9856	9871	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_018056	ATAA	3	10128	10140	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_018056	ATAA	4	10682	10696	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_018056	AAAT	3	10847	10858	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018056	TAAT	10	11009	11049	41	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_018056	TTTA	3	11629	11639	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_018056	ATCT	3	11661	11671	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
53	NC_018056	ATAA	4	11974	11989	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_018056	TTTA	8	11986	12017	32	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_018056	ATTA	4	12131	12146	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_018056	TAAT	6	12197	12220	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_018056	TATT	9	12201	12236	36	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_018056	TTTA	3	12267	12277	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_018056	TTTA	3	13650	13661	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018056	TAAT	3	13850	13862	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_018056	TATT	3	14545	14556	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018056	TTAA	3	14767	14777	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_018056	AAAT	3	14873	14883	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_018056	ATAA	3	15016	15027	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018056	TAAT	4	15289	15304	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018056	TAAT	4	15476	15491	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018056	TATT	6	15504	15527	24	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_018056	TTTA	3	15684	15695	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_018056	ATCT	4	15962	15977	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
70	NC_018056	TTTC	4	16002	16017	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
71	NC_018056	TTTA	6	16010	16033	24	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_018056	TATT	9	16088	16123	36	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_018056	TTCT	3	16363	16373	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
74	NC_018056	ATTT	4	16375	16394	20	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
75	NC_018056	TATT	6	16546	16569	24	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_018056	ATTA	5	16752	16771	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
77	NC_018056	AATA	4	16885	16899	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
78	NC_018056	AAAT	3	17083	17093	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_018056	ATCT	8	17162	17193	32	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
80	NC_018056	TATT	4	17246	17261	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_018056	TATT	5	17368	17387	20	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
82	NC_018056	TGAA	4	17965	17980	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
83	NC_018056	TATG	16	18058	18121	64	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_018056	TAAT	7	18182	18213	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_018056	AATT	9	18519	18554	36	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_018056	ATAA	4	19133	19148	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_018056	AATT	13	19136	19187	52	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_018056	AAAT	4	19459	19474	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_018056	AAAT	4	19546	19561	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	39123335
90	NC_018056	TAAA	3	19616	19626	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39123335
91	NC_018056	TAAA	3	19652	19662	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39123335
92	NC_018056	AAAT	3	19966	19977	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	39123335
93	NC_018056	TTTA	3	20154	20164	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39123335
94	NC_018056	TAAT	4	20706	20721	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
95	NC_018056	TTTA	3	21226	21237	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_018056	ATAA	6	21824	21847	24	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_018056	AAAT	3	22116	22127	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018056	TTTA	4	22211	22226	16	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018056	ATAA	4	22829	22844	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
100	NC_018056	TAAA	4	23057	23072	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018056	TAAT	3	23233	23244	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018056	TAAA	5	23864	23883	20	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
103	NC_018056	TAAT	7	23887	23915	29	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
104	NC_018056	AAAT	3	23974	23985	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_018056	TAGG	3	24217	24227	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_018056	AATT	6	25718	25741	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_018056	TAAT	3	26103	26113	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_018056	TAAT	4	26608	26622	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
109	NC_018056	TTTA	3	26624	26635	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_018056	AAAT	3	26958	26969	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_018056	AAAT	3	27057	27068	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_018056	AATT	3	27690	27702	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_018056	TTAA	3	27884	27894	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_018056	AATT	5	29148	29167	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
115	NC_018056	AATT	7	30117	30144	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
116	NC_018056	TATT	6	30164	30185	22	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_018056	TATT	3	31465	31475	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_018056	TATT	3	31776	31787	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018056	TTTA	3	31917	31928	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_018056	TTAA	3	32405	32415	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_018056	AAAT	3	32735	32746	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_018056	AAAT	3	32993	33004	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_018056	ATTT	3	33563	33578	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
124	NC_018056	ATAA	3	33685	33696	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_018056	ATAA	3	34359	34369	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39123335
126	NC_018056	AAAT	3	34475	34487	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	39123335
127	NC_018056	AATT	3	36785	36795	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39123335
128	NC_018056	AAAT	3	36930	36940	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39123335
129	NC_018056	CTTA	3	37794	37804	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	39123335
130	NC_018056	GTTT	3	38030	38041	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_018056	AAAT	3	39334	39345	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_018056	TATT	4	39377	39392	16	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018056	TATT	8	39497	39528	32	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
134	NC_018056	ATAA	3	40266	40277	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_018056	ATAA	4	40310	40325	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
136	NC_018056	ATTA	6	40493	40519	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
137	NC_018056	AAAT	3	40643	40654	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018056	AGTT	3	40822	40833	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018056	ATCT	3	40837	40849	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
140	NC_018056	ATTT	4	41592	41607	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
141	NC_018056	AATA	4	41639	41654	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
142	NC_018056	ATTA	8	41746	41777	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
143	NC_018056	TAAA	4	41867	41882	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
144	NC_018056	AAAT	3	42229	42240	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
145	NC_018056	AAAT	3	43598	43609	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	39123335
146	NC_018056	AAAT	4	43844	43859	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	39123335
147	NC_018056	AATT	3	45549	45559	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39123335
148	NC_018056	AATT	3	46587	46597	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39123335
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152	NC_018056	ATTT	3	47726	47737	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39123335
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161	NC_018056	ATAA	3	51432	51443	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Lachancea kluyveri mitochondrion