ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Vigna unguiculata chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018051	TTG	4	2473	2484	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39339608
2	NC_018051	ATG	4	2596	2607	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	39339608
3	NC_018051	ATT	4	2815	2825	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_018051	AGA	4	5685	5695	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	39339608
5	NC_018051	TAA	5	8036	8050	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_018051	ATA	5	9894	9908	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_018051	ATA	4	13467	13477	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_018051	TAA	4	16455	16465	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_018051	TAT	4	16878	16888	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_018051	AAT	4	18512	18524	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39339609
11	NC_018051	TAA	4	33557	33568	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_018051	TCT	4	34639	34650	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
13	NC_018051	AAC	4	40357	40368	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	39339610
14	NC_018051	GAA	4	41887	41899	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	39339610
15	NC_018051	AAT	4	48729	48740	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_018051	GTT	5	49380	49394	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	39339610
17	NC_018051	TGT	4	52744	52755	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39339611
18	NC_018051	ATT	4	56387	56397	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_018051	TAA	4	56886	56896	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_018051	TAT	4	60016	60026	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39339611
21	NC_018051	TAA	4	60374	60384	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39339611
22	NC_018051	ATT	4	60851	60862	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_018051	TTA	4	67851	67862	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_018051	ATT	4	69414	69425	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_018051	CTG	4	70004	70015	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	39339608
26	NC_018051	ATA	4	71156	71167	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39339608
27	NC_018051	AAT	4	75367	75378	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39339608
28	NC_018051	TAT	5	81330	81344	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	39339608
29	NC_018051	ACG	4	81808	81819	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	39339608
30	NC_018051	CTT	4	81851	81862	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	39339608
31	NC_018051	GAT	4	82319	82329	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	39339608
32	NC_018051	GAT	4	83686	83696	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	39339608
33	NC_018051	TTA	4	97357	97368	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39339615
34	NC_018051	AAT	5	98072	98085	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39339615
35	NC_018051	ATT	4	109702	109714	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39339615
36	NC_018051	TAT	6	109829	109845	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	39339615
37	NC_018051	ATT	4	110281	110291	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39339615
38	NC_018051	TAA	4	113780	113792	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39339615
39	NC_018051	TTA	4	117164	117174	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39339615
40	NC_018051	ACA	4	118737	118748	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	39339615
41	NC_018051	ATT	5	134037	134050	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39339615
42	NC_018051	TAA	4	134754	134765	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39339615
43	NC_018051	TCT	4	135723	135733	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	39339615
44	NC_018051	ACC	4	143641	143651	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	39339608
45	NC_018051	ATC	4	148426	148436	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
46	NC_018051	ATC	4	149793	149803	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	39339616
47	NC_018051	GAA	5	150259	150273	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	39339616
48	NC_018051	AAT	8	150770	150793	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_018051	ATA	5	151982	151996	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Vigna unguiculata chloroplast