ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ochlodes venata mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018048	TAAA	3	65	75	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_018048	ATTT	3	488	498	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39122406
3	NC_018048	AAT	5	573	587	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	39122406
4	NC_018048	AATT	3	810	820	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122406
5	NC_018048	ATA	4	1066	1077	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122406
6	NC_018048	TTA	4	1083	1093	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39122406
7	NC_018048	TTTA	4	1272	1286	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	39122406
8	NC_018048	AGG	4	2177	2188	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	39122406
9	NC_018048	GAAA	3	2296	2307	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	39122406
10	NC_018048	ATTT	4	2537	2552	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	39122406
11	NC_018048	ATA	8	2901	2924	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122406
12	NC_018048	ATA	4	3236	3247	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122406
13	NC_018048	TTAA	3	3395	3407	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	39122406
14	NC_018048	AATT	3	3778	3788	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122406
15	NC_018048	TAAAAA	3	4045	4063	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	39122406
16	NC_018048	TTAA	3	4161	4172	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39122406
17	NC_018048	AATT	3	4459	4469	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122406
18	NC_018048	TAT	4	4663	4674	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122406
19	NC_018048	ATTT	3	4907	4918	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39122406
20	NC_018048	ATT	4	4930	4940	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39122406
21	NC_018048	T	15	5057	5071	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	39122406
22	NC_018048	ATT	4	5278	5289	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122406
23	NC_018048	ATT	4	5532	5543	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122406
24	NC_018048	TAT	4	5585	5597	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_018048	ATT	5	5657	5670	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39122406
26	NC_018048	TAT	5	5680	5694	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	39122406
27	NC_018048	TAT	4	5704	5714	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39122406
28	NC_018048	TAT	5	5944	5957	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39122406
29	NC_018048	ATAA	6	6343	6366	24	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_018048	AT	41	6355	6435	81	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_018048	TAAA	3	6537	6548	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	39122407
32	NC_018048	TAA	4	6798	6808	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39122407
33	NC_018048	TAA	4	6931	6941	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39122407
34	NC_018048	TTA	4	7362	7373	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122407
35	NC_018048	ATA	5	7467	7481	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	39122407
36	NC_018048	AAT	5	7651	7665	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	39122407
37	NC_018048	TAA	4	7905	7917	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39122407
38	NC_018048	AAAAT	4	8142	8162	21	80 %	20 %	0 %	0 %	9 %	39122407
39	NC_018048	A	12	8183	8194	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	39122407
40	NC_018048	TAATAT	3	8474	8491	18	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	39122407
41	NC_018048	AATTT	3	8898	8913	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	39122407
42	NC_018048	TAAA	3	9113	9123	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39122407
43	NC_018048	AAAT	3	9197	9207	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39122407
44	NC_018048	AAAAT	3	9286	9299	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	39122407
45	NC_018048	TAT	4	9410	9421	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122407
46	NC_018048	A	17	9527	9543	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	39122407
47	NC_018048	TA	6	9742	9752	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122407
48	NC_018048	AAAT	3	9758	9769	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	39122407
49	NC_018048	ATT	5	9779	9793	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	39122407
50	NC_018048	A	14	9886	9899	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	39122407
51	NC_018048	ATT	4	10016	10027	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_018048	ATT	5	10228	10242	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	39122407
53	NC_018048	TAAA	3	10290	10300	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39122407
54	NC_018048	TAT	4	10330	10341	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122407
55	NC_018048	AAAT	3	10395	10406	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	39122407
56	NC_018048	TATT	3	10407	10418	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39122407
57	NC_018048	AAT	4	10439	10450	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122407
58	NC_018048	ATTT	4	10502	10517	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	39122407
59	NC_018048	TAG	4	10521	10532	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	39122407
60	NC_018048	ATT	4	10964	10974	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39122407
61	NC_018048	ATTT	3	11157	11167	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39122407
62	NC_018048	TTA	4	11327	11338	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122407
63	NC_018048	TTA	4	11650	11660	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39122407
64	NC_018048	TAT	5	11693	11706	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39122407
65	NC_018048	ATT	4	11714	11726	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39122407
66	NC_018048	TAAT	3	11743	11754	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	39122407
67	NC_018048	TAA	4	12363	12375	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39122407
68	NC_018048	TAA	4	12473	12483	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39122407
69	NC_018048	TA	6	12778	12789	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_018048	TA	14	12842	12867	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_018048	ATCA	3	13153	13164	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018048	ATT	5	13237	13251	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_018048	TTAA	3	13621	13632	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_018048	TAT	5	14518	14531	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_018048	TAT	4	14805	14819	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_018048	AAATT	3	14832	14846	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_018048	T	22	15062	15083	22	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
78	NC_018048	T	12	15113	15124	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_018048	A	13	15177	15189	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_018048	ATTTTT	3	15200	15216	17	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
81	NC_018048	AAT	4	15233	15244	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_018048	AATT	4	15282	15297	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
83	NC_018048	TAAAA	3	15298	15312	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
84	NC_018048	AT	9	15327	15344	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
85	NC_018048	TA	8	15391	15406	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_018048	AAT	4	15407	15417	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_018048	TA	6	15532	15543	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

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