ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Papilio machaon mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018047	TTTAT	3	126	140	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_018047	AAAT	3	191	202	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_018047	TAATT	3	226	240	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018047	TTTTA	3	286	300	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	39122404
5	NC_018047	AATT	3	516	526	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122404
6	NC_018047	TAA	5	701	715	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	39122404
7	NC_018047	AATT	3	789	799	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122404
8	NC_018047	TAT	4	1103	1114	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122404
9	NC_018047	TAT	4	1335	1345	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_018047	AATT	3	1686	1697	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39122405
11	NC_018047	CT	6	1840	1850	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	39122405
12	NC_018047	ATTT	3	1879	1890	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39122405
13	NC_018047	GAAA	3	2237	2247	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	39122405
14	NC_018047	ATA	7	2844	2864	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39122405
15	NC_018047	ATT	4	2889	2899	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39122405
16	NC_018047	TTAA	3	3176	3186	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122405
17	NC_018047	TTTA	3	3187	3197	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39122405
18	NC_018047	AATT	3	3721	3731	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122405
19	NC_018047	TAA	7	3966	3986	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39122405
20	NC_018047	ATT	4	4118	4130	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39122405
21	NC_018047	T	15	4996	5010	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	39122405
22	NC_018047	TAT	4	5216	5227	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122405
23	NC_018047	ATTT	4	5361	5376	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	39122405
24	NC_018047	TAT	4	5627	5637	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39122405
25	NC_018047	ATA	7	6319	6340	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39122405
26	NC_018047	TAAA	3	6367	6378	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	39122405
27	NC_018047	TAAA	3	6509	6519	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39122405
28	NC_018047	TAT	4	6674	6685	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122405
29	NC_018047	TGAA	3	7385	7395	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	39122405
30	NC_018047	A	12	7536	7547	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	39122405
31	NC_018047	TAA	4	7735	7747	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39122405
32	NC_018047	A	13	7944	7956	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	39122405
33	NC_018047	A	12	8013	8024	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	39122405
34	NC_018047	ATTT	3	8045	8055	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_018047	TTAAA	4	8101	8119	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	39122405
36	NC_018047	ATA	4	8299	8310	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122405
37	NC_018047	AAAAT	3	8971	8984	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	39122405
38	NC_018047	AAAT	3	9021	9031	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39122405
39	NC_018047	ATATTT	4	9331	9354	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122405
40	NC_018047	TAA	5	9363	9377	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	39122405
41	NC_018047	AATA	3	9698	9708	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39122405
42	NC_018047	ATA	4	9711	9722	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122405
43	NC_018047	TTA	4	9900	9912	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39122405
44	NC_018047	TAT	5	9920	9933	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39122405
45	NC_018047	TTTA	3	10070	10081	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	39122405
46	NC_018047	TTTTA	3	10247	10260	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	39122405
47	NC_018047	TAA	5	10315	10329	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	39122405
48	NC_018047	TATT	3	10335	10346	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	39122405
49	NC_018047	TA	6	10586	10596	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122406
50	NC_018047	ATT	4	10779	10792	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39122406
51	NC_018047	TAT	4	10989	10999	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39122406
52	NC_018047	ATTT	3	11017	11027	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39122406
53	NC_018047	TAAAA	3	12255	12268	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	39122406
54	NC_018047	AT	7	12565	12580	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	39122406
55	NC_018047	TA	7	12598	12610	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_018047	TCAT	3	12955	12966	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
57	NC_018047	TTAA	3	12976	12987	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_018047	TTTAAT	3	13031	13048	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
59	NC_018047	TTA	4	13543	13554	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018047	T	13	13963	13975	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_018047	AAATT	3	13989	14002	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_018047	TATT	3	14465	14475	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_018047	T	22	14899	14920	22	0 %	100 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_018047	TTA	5	15012	15025	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_018047	AT	11	15051	15071	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_018047	ATAAA	3	15170	15184	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Papilio machaon mitochondrion