ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Saccharomyces paradoxus mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018044	AAAT	3	76	87	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_018044	ATTA	4	1254	1269	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_018044	ATTA	8	1435	1465	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_018044	TAAT	10	2093	2130	38	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_018044	ATAA	4	2269	2284	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_018044	ATTT	3	2421	2432	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_018044	AAGT	3	2509	2520	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_018044	ATAA	3	2680	2691	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018044	AATT	3	3690	3702	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_018044	TTTA	3	4145	4156	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_018044	TAAA	4	4597	4612	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_018044	TAAA	4	4898	4913	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_018044	ATTA	4	5118	5133	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_018044	ATAA	11	5143	5186	44	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_018044	TAAA	4	5307	5322	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018044	TAAT	4	5638	5652	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_018044	TTTA	3	5778	5788	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_018044	TAAT	8	5972	6003	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_018044	AAAT	3	6497	6508	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_018044	TATT	3	6751	6762	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_018044	TAAA	3	7476	7486	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_018044	ATAA	5	8227	8247	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_018044	TAAT	5	9089	9108	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
24	NC_018044	TAAA	3	9168	9179	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_018044	GTAA	3	9487	9497	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_018044	TTAA	3	9545	9555	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_018044	ATTA	6	10393	10416	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_018044	TATT	7	10890	10916	27	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_018044	TAAT	8	11142	11174	33	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_018044	ATAA	3	11187	11197	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_018044	TAAT	5	11396	11415	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
32	NC_018044	ATTA	4	11484	11499	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_018044	ATTT	3	12467	12478	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_018044	TAAT	8	12648	12678	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_018044	ATAA	3	13092	13103	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018044	ATTA	4	13225	13240	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_018044	TAAA	3	13358	13369	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018044	ATTA	4	13619	13634	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018044	ATTA	3	15516	15526	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122400
40	NC_018044	ATTA	9	16080	16115	36	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	39122400
41	NC_018044	ATTA	6	17475	17498	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_018044	TAAA	8	17803	17834	32	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_018044	TAAT	4	19567	19583	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
44	NC_018044	TTAA	3	20249	20259	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_018044	AATA	4	20616	20631	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_018044	ATAA	9	20991	21025	35	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
47	NC_018044	TAAA	11	21063	21106	44	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_018044	ATTT	5	21553	21572	20	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
49	NC_018044	TTAT	3	21598	21609	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018044	ATTA	7	22517	22543	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_018044	TAAT	4	23279	23293	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_018044	TTAA	4	23340	23354	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_018044	AAAG	3	24317	24328	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	39122400
54	NC_018044	ATTT	3	26729	26740	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39122400
55	NC_018044	AAAT	3	26747	26758	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	39122400
56	NC_018044	TTAA	3	26995	27005	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122400
57	NC_018044	TCAA	3	28938	28948	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	39122400
58	NC_018044	TAAT	3	29239	29250	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39122400
59	NC_018044	ATTT	3	30658	30669	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_018044	TTAA	3	30672	30682	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_018044	ATTT	3	31774	31785	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018044	ATAA	3	31958	31969	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_018044	ATTA	3	32161	32171	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_018044	TTAA	3	32394	32405	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39122401
65	NC_018044	ATTT	3	32470	32481	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39122401
66	NC_018044	TTTA	3	33309	33320	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_018044	TTTA	4	33412	33427	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_018044	TAAA	3	35233	35243	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_018044	ATTT	5	35927	35946	20	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
70	NC_018044	ATAA	6	36817	36839	23	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_018044	TATT	4	36850	36865	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_018044	AATT	6	36858	36881	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_018044	ATTA	3	37754	37764	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_018044	GGGA	3	38042	38053	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_018044	TAAT	3	38069	38080	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018044	TAAA	4	38344	38359	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018044	AATT	3	38929	38940	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018044	TAAT	6	39065	39088	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_018044	ATTA	3	39887	39897	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_018044	TTTA	3	40463	40474	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_018044	ATTA	9	42776	42810	35	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39122401
82	NC_018044	TTAA	6	43153	43180	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	39122401
83	NC_018044	TATT	3	44152	44163	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	39122401
84	NC_018044	AATT	3	44685	44696	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	39122401
85	NC_018044	ATAA	3	45923	45934	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	39122401
86	NC_018044	TAAA	8	47091	47122	32	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39122401
87	NC_018044	TAAT	4	47358	47372	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_018044	AAAT	3	47604	47614	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_018044	CATA	3	47780	47791	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
90	NC_018044	ATTT	3	48094	48104	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_018044	AATA	3	48310	48322	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_018044	TTAT	4	48928	48942	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
93	NC_018044	ATAA	8	50183	50214	32	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
94	NC_018044	TAAT	3	51250	51261	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018044	TAAA	3	51639	51651	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	39122401
96	NC_018044	TTAA	3	52407	52418	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39122401
97	NC_018044	TAAA	8	52818	52848	31	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_018044	ATAA	3	53144	53155	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_018044	ATTA	4	53372	53386	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
100	NC_018044	TTAT	7	53539	53566	28	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_018044	TATT	4	53819	53834	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
102	NC_018044	AATT	3	54210	54221	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_018044	TAAA	3	54456	54466	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_018044	AATA	8	54511	54541	31	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_018044	TATT	3	54890	54900	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_018044	ATAA	4	54952	54967	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
107	NC_018044	TAAA	5	56384	56403	20	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
108	NC_018044	TAAA	3	56916	56928	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
109	NC_018044	TAAA	3	57428	57438	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_018044	TATT	4	57621	57635	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
111	NC_018044	AATT	5	57946	57965	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
112	NC_018044	AATT	3	58288	58298	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_018044	TTTA	3	59696	59707	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018044	AATT	3	60066	60077	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_018044	TAAA	3	61113	61123	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_018044	TTAA	3	61147	61157	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_018044	AAAT	3	61163	61174	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_018044	ATTA	7	61201	61228	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_018044	ATAA	3	61283	61294	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_018044	ATAA	3	61445	61456	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018044	ATTA	7	61922	61949	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
122	NC_018044	TAAT	4	63731	63747	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
123	NC_018044	TAAA	3	63751	63762	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_018044	ATTA	3	63956	63967	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018044	ACCT	3	65211	65221	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
126	NC_018044	ATTT	3	66095	66106	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_018044	ATAA	3	66215	66226	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018044	ATAA	5	66446	66469	24	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_018044	TTTA	3	67110	67120	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_018044	ATTA	6	67355	67378	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_018044	ATAA	4	68592	68607	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
132	NC_018044	ATTT	5	68716	68735	20	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
133	NC_018044	GGAG	3	68799	68810	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_018044	ATTT	8	69260	69291	32	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_018044	TAAA	3	70629	70641	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
136	NC_018044	TAAT	5	70806	70825	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
137	NC_018044	TTAA	3	71199	71210	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018044	ATTA	3	71227	71238	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
139	NC_018044	TAAT	3	71239	71250	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Saccharomyces paradoxus mitochondrion