ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Saccharomyces paradoxus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018044	TAA	4	129	141	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_018044	TAA	4	195	209	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_018044	TAA	4	920	932	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_018044	TAA	5	1092	1106	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_018044	TAT	4	1173	1184	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_018044	TAA	8	1179	1203	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_018044	TAT	5	1428	1442	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_018044	TAA	5	3489	3504	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_018044	TAA	5	3517	3532	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_018044	AAT	4	3573	3583	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_018044	TAT	4	3771	3782	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_018044	TAA	5	3898	3912	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_018044	TAA	4	3982	3993	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_018044	ATA	4	4116	4126	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_018044	ATA	4	4376	4388	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_018044	TAT	4	4413	4424	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_018044	ATT	4	4481	4492	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_018044	ATT	4	4627	4637	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_018044	TAA	4	4956	4967	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_018044	AAT	5	5054	5069	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_018044	TAA	4	5209	5219	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_018044	TAT	5	5285	5299	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
23	NC_018044	ATA	4	5502	5514	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_018044	TAA	4	5592	5604	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_018044	TAT	4	5964	5975	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_018044	ATA	7	6027	6048	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_018044	TAA	4	6196	6206	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_018044	ATT	4	6596	6606	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_018044	TAA	4	6667	6678	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_018044	TAA	20	7125	7184	60	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	3 %	Non-Coding
31	NC_018044	TAA	6	7254	7271	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
32	NC_018044	ATT	4	7390	7402	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_018044	ATA	4	7518	7530	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_018044	TAT	4	7578	7589	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_018044	ATA	5	7766	7780	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_018044	ATA	5	7873	7888	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_018044	TTA	4	7942	7952	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_018044	TAA	4	8039	8050	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_018044	TAA	4	8163	8175	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_018044	ATA	8	8258	8281	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
41	NC_018044	TAT	5	8327	8341	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_018044	TAA	5	8656	8669	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_018044	ATA	5	8817	8830	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_018044	TAA	14	8839	8880	42	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	2 %	Non-Coding
45	NC_018044	ATA	5	9023	9036	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_018044	TAA	4	9047	9058	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_018044	TAT	4	9068	9079	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_018044	TAA	4	9275	9285	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_018044	TAT	5	9399	9414	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_018044	ATA	4	9451	9461	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_018044	TAT	5	9648	9661	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_018044	TAT	8	9854	9877	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_018044	ATT	4	9879	9890	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_018044	TAT	7	10016	10037	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_018044	TAA	4	10107	10117	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_018044	TAT	5	10231	10245	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_018044	ATA	4	10448	10459	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_018044	TAT	5	10631	10644	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_018044	ATA	4	10767	10779	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_018044	ATT	4	10932	10943	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_018044	ATA	4	11305	11317	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_018044	ATA	4	11376	11388	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_018044	TAA	5	11853	11868	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_018044	ATT	5	11869	11884	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_018044	TAT	4	12077	12091	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_018044	TAA	4	12132	12143	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_018044	TAA	4	12376	12386	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_018044	TTA	12	12978	13014	37	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_018044	ATA	4	13163	13174	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_018044	ATA	4	13480	13491	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_018044	ATA	7	13513	13533	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
72	NC_018044	TAA	9	14754	14780	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39122400
73	NC_018044	ATA	7	14903	14923	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39122400
74	NC_018044	ATA	4	15263	15274	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122400
75	NC_018044	TAA	4	15648	15658	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39122400
76	NC_018044	TAA	5	15837	15851	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	39122400
77	NC_018044	ATT	4	16156	16167	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_018044	ATT	4	16520	16531	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_018044	ATT	5	16633	16646	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_018044	TAT	4	16690	16700	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_018044	ATA	4	16771	16782	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_018044	TAT	8	16904	16926	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_018044	ATT	4	17036	17050	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
84	NC_018044	ATA	5	17059	17073	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_018044	TAT	4	17116	17126	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_018044	TAT	5	17161	17174	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_018044	ATA	4	17268	17279	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_018044	TTA	4	17314	17324	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_018044	TAA	4	17345	17359	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
90	NC_018044	ATT	4	17619	17630	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_018044	TAA	4	17770	17781	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_018044	ATA	4	17853	17864	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_018044	TTA	4	18036	18046	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_018044	ATA	8	18046	18067	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_018044	TAA	4	18291	18303	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_018044	TAT	4	18305	18317	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_018044	TTC	4	18415	18426	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
98	NC_018044	ATT	4	18450	18462	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_018044	AAT	4	18551	18561	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_018044	ATT	4	18599	18609	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_018044	TAA	4	18907	18917	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_018044	TTA	4	19040	19050	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_018044	AAT	4	19234	19244	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_018044	TAT	9	19265	19290	26	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_018044	ATT	4	19321	19333	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
106	NC_018044	TAT	4	19483	19493	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_018044	ATT	5	19633	19648	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
108	NC_018044	ATT	4	19679	19690	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_018044	TTC	4	19718	19729	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
110	NC_018044	TAT	4	19832	19843	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_018044	ATA	7	20184	20205	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_018044	TAA	8	20268	20291	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018044	AAT	4	20431	20442	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_018044	TAT	6	20578	20594	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
115	NC_018044	AAT	4	20802	20813	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_018044	ATA	4	20969	20980	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_018044	TAA	4	21310	21322	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
118	NC_018044	TAA	4	21327	21338	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_018044	ATT	4	21350	21361	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_018044	ATT	4	21385	21397	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
121	NC_018044	TAT	4	21452	21463	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_018044	TTA	7	21570	21591	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_018044	TAT	5	21662	21676	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
124	NC_018044	ATT	4	21762	21772	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_018044	TAT	9	22072	22097	26	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_018044	ATT	4	22169	22179	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_018044	TAA	8	22589	22611	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_018044	TAA	4	22793	22804	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_018044	AAT	5	24226	24240	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	39122400
130	NC_018044	AAT	5	26502	26515	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39122400
131	NC_018044	ATA	7	26572	26591	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	39122400
132	NC_018044	TAA	4	26680	26691	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122400
133	NC_018044	ATA	5	26761	26776	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	39122400
134	NC_018044	TAA	4	26782	26793	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122400
135	NC_018044	ATA	4	26844	26856	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39122400
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154	NC_018044	ATT	6	30971	30989	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
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249	NC_018044	ATT	4	47926	47937	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
250	NC_018044	ATA	7	47976	47997	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
251	NC_018044	TAT	7	48012	48033	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
252	NC_018044	AGA	4	48323	48334	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
253	NC_018044	ATA	4	48432	48443	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
254	NC_018044	TAA	6	48529	48545	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
255	NC_018044	TAT	4	48683	48694	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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257	NC_018044	TAA	5	48734	48748	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_018044	ATA	6	49017	49033	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
259	NC_018044	ATT	5	49097	49111	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
260	NC_018044	TAT	4	49227	49239	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
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262	NC_018044	ATA	5	49421	49435	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
263	NC_018044	ATA	4	49526	49536	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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393	NC_018044	ATA	5	70863	70878	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
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395	NC_018044	ATA	5	70969	70983	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
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400	NC_018044	TAA	4	71208	71219	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
401	NC_018044	TAT	4	71327	71337	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Saccharomyces paradoxus mitochondrion