ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Saccharomyces paradoxus mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018044	AT	7	176	191	16	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
2	NC_018044	TA	6	519	530	12	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
3	NC_018044	TA	6	839	849	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
4	NC_018044	AT	8	1051	1066	16	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
5	NC_018044	AT	6	1226	1236	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
6	NC_018044	AT	6	1421	1433	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
7	NC_018044	TA	6	1463	1473	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
8	NC_018044	TA	9	2187	2203	17	50 %	50 %	5 %	Non-Coding
9	NC_018044	AT	9	2303	2319	17	50 %	50 %	5 %	Non-Coding
10	NC_018044	AT	6	2335	2346	12	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
11	NC_018044	TA	8	3600	3614	15	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
12	NC_018044	TA	7	3731	3744	14	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
13	NC_018044	TA	8	3749	3765	17	50 %	50 %	5 %	Non-Coding
14	NC_018044	TA	6	4356	4367	12	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
15	NC_018044	TA	6	4710	4720	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
16	NC_018044	AT	7	4783	4797	15	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
17	NC_018044	TA	13	4815	4840	26	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
18	NC_018044	AT	6	4841	4851	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
19	NC_018044	TA	13	5610	5633	24	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
20	NC_018044	TA	7	5653	5665	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
21	NC_018044	TA	7	5793	5805	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
22	NC_018044	AT	7	5930	5944	15	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
23	NC_018044	TA	8	6164	6180	17	50 %	50 %	5 %	Non-Coding
24	NC_018044	AT	9	6720	6736	17	50 %	50 %	5 %	Non-Coding
25	NC_018044	TA	6	6782	6792	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
26	NC_018044	TA	6	6820	6830	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
27	NC_018044	AT	6	6962	6975	14	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
28	NC_018044	AT	6	7064	7074	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
29	NC_018044	TA	8	7076	7090	15	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
30	NC_018044	AT	8	7354	7370	17	50 %	50 %	5 %	Non-Coding
31	NC_018044	AT	6	7894	7904	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
32	NC_018044	AT	6	8635	8645	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
33	NC_018044	AT	8	8763	8777	15	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
34	NC_018044	AT	7	8780	8792	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
35	NC_018044	AT	6	8986	8999	14	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
36	NC_018044	TA	12	9356	9378	23	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
37	NC_018044	TA	6	9946	9959	14	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
38	NC_018044	TA	13	10360	10384	25	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
39	NC_018044	AT	8	10994	11008	15	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
40	NC_018044	AT	8	11011	11025	15	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
41	NC_018044	TA	6	11046	11056	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
42	NC_018044	AT	11	11572	11593	22	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
43	NC_018044	AT	7	11716	11728	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
44	NC_018044	TA	7	11745	11760	16	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
45	NC_018044	TA	6	12180	12190	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
46	NC_018044	AT	11	12550	12570	21	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
47	NC_018044	AT	7	12687	12701	15	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
48	NC_018044	TA	7	13148	13162	15	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
49	NC_018044	AT	7	13206	13218	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
50	NC_018044	TA	6	13460	13472	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
51	NC_018044	TA	7	13552	13567	16	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
52	NC_018044	TA	7	13569	13583	15	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
53	NC_018044	TA	6	13585	13595	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
54	NC_018044	AT	6	13635	13645	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
55	NC_018044	AT	6	14152	14163	12	50 %	50 %	8 %	39122400
56	NC_018044	TA	8	16374	16389	16	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
57	NC_018044	AT	6	16439	16450	12	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
58	NC_018044	AT	10	16665	16685	21	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
59	NC_018044	AT	6	17184	17194	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
60	NC_018044	TA	7	17678	17690	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
61	NC_018044	TA	9	17742	17759	18	50 %	50 %	5 %	Non-Coding
62	NC_018044	AT	6	17789	17799	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
63	NC_018044	TA	7	17896	17911	16	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
64	NC_018044	TA	11	17918	17938	21	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
65	NC_018044	AT	6	18631	18642	12	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
66	NC_018044	TA	6	19049	19059	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
67	NC_018044	TA	8	19345	19360	16	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
68	NC_018044	AT	11	19997	20017	21	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
69	NC_018044	AT	6	20300	20312	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
70	NC_018044	TA	11	20599	20619	21	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
71	NC_018044	AT	11	20724	20744	21	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
72	NC_018044	TA	6	21643	21656	14	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
73	NC_018044	AT	6	21718	21728	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
74	NC_018044	AT	6	21741	21752	12	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
75	NC_018044	TA	7	21785	21797	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
76	NC_018044	TA	8	22116	22131	16	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
77	NC_018044	TA	6	22377	22387	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
78	NC_018044	AT	7	22493	22505	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
79	NC_018044	AT	8	22838	22853	16	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
80	NC_018044	AT	6	22857	22868	12	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
81	NC_018044	TA	9	22872	22888	17	50 %	50 %	5 %	Non-Coding
82	NC_018044	TA	6	22904	22914	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
83	NC_018044	AT	6	22956	22966	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
84	NC_018044	AT	9	23100	23116	17	50 %	50 %	5 %	Non-Coding
85	NC_018044	AT	12	23130	23151	22	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
86	NC_018044	AT	6	23177	23188	12	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
87	NC_018044	AT	7	23326	23338	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
88	NC_018044	TA	6	26332	26342	11	50 %	50 %	9 %	39122400
89	NC_018044	TA	6	26345	26355	11	50 %	50 %	9 %	39122400
90	NC_018044	AT	12	26371	26395	25	50 %	50 %	8 %	39122400
91	NC_018044	AT	6	26394	26404	11	50 %	50 %	9 %	39122400
92	NC_018044	AT	6	26631	26641	11	50 %	50 %	9 %	39122400
93	NC_018044	TA	7	26659	26672	14	50 %	50 %	7 %	39122400
94	NC_018044	TA	11	27880	27901	22	50 %	50 %	9 %	39122400
95	NC_018044	AT	9	27910	27927	18	50 %	50 %	5 %	39122400
96	NC_018044	AT	10	27992	28010	19	50 %	50 %	5 %	39122400
97	NC_018044	AT	7	29757	29769	13	50 %	50 %	7 %	39122400
98	NC_018044	AT	6	29802	29812	11	50 %	50 %	9 %	39122400
99	NC_018044	TA	6	29985	29997	13	50 %	50 %	7 %	39122400
100	NC_018044	AT	6	30709	30721	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
101	NC_018044	TA	11	30802	30824	23	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
102	NC_018044	AT	8	30828	30842	15	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
103	NC_018044	AT	6	30877	30887	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
104	NC_018044	TA	6	31207	31218	12	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
105	NC_018044	TA	8	31501	31515	15	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
106	NC_018044	AT	7	31524	31537	14	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
107	NC_018044	TA	8	31839	31853	15	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
108	NC_018044	TA	14	31864	31891	28	50 %	50 %	10 %	Non-Coding
109	NC_018044	TA	7	32213	32225	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
110	NC_018044	TA	12	32230	32251	22	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
111	NC_018044	TA	8	32290	32304	15	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
112	NC_018044	TA	8	33426	33440	15	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
113	NC_018044	TA	6	33444	33454	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
114	NC_018044	TA	6	33478	33490	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
115	NC_018044	AT	7	33501	33513	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
116	NC_018044	TA	6	34006	34016	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
117	NC_018044	AT	7	34188	34201	14	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
118	NC_018044	AT	11	34216	34237	22	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
119	NC_018044	AT	6	34612	34624	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
120	NC_018044	AT	6	34749	34760	12	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
121	NC_018044	TA	12	35024	35047	24	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
122	NC_018044	TA	19	35780	35815	36	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
123	NC_018044	TA	7	36077	36090	14	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
124	NC_018044	TA	7	36177	36189	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
125	NC_018044	AT	8	36204	36219	16	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
126	NC_018044	AT	6	36783	36796	14	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
127	NC_018044	TA	12	37359	37382	24	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
128	NC_018044	TA	7	37471	37484	14	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
129	NC_018044	TA	9	37601	37618	18	50 %	50 %	5 %	Non-Coding
130	NC_018044	TA	6	37991	38003	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
131	NC_018044	AT	9	38219	38235	17	50 %	50 %	5 %	Non-Coding
132	NC_018044	AT	6	38307	38317	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
133	NC_018044	AT	6	38584	38596	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
134	NC_018044	TA	7	39128	39143	16	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
135	NC_018044	TA	8	39196	39210	15	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
136	NC_018044	TA	6	39294	39304	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
137	NC_018044	AT	14	39592	39618	27	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
138	NC_018044	AT	9	39731	39747	17	50 %	50 %	5 %	Non-Coding
139	NC_018044	TA	10	40125	40143	19	50 %	50 %	10 %	Non-Coding
140	NC_018044	TA	6	40674	40684	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
141	NC_018044	AT	9	40691	40707	17	50 %	50 %	5 %	Non-Coding
142	NC_018044	AT	7	40751	40763	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
143	NC_018044	AT	6	42865	42876	12	50 %	50 %	8 %	39122401
144	NC_018044	AT	6	43343	43353	11	50 %	50 %	9 %	39122401
145	NC_018044	AT	6	44112	44124	13	50 %	50 %	7 %	39122401
146	NC_018044	TA	17	44352	44385	34	50 %	50 %	8 %	39122401
147	NC_018044	TA	7	44548	44560	13	50 %	50 %	7 %	39122401
148	NC_018044	AT	11	45011	45031	21	50 %	50 %	9 %	39122401
149	NC_018044	AT	6	47161	47174	14	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
150	NC_018044	AT	6	47477	47489	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
151	NC_018044	TA	12	47711	47733	23	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
152	NC_018044	AT	8	48411	48425	15	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
153	NC_018044	AT	16	48482	48512	31	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
154	NC_018044	AT	12	48947	48969	23	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
155	NC_018044	TA	6	49315	49325	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
156	NC_018044	TA	7	49463	49475	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
157	NC_018044	TA	7	49579	49591	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
158	NC_018044	TA	6	49682	49692	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
159	NC_018044	TA	8	49707	49721	15	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
160	NC_018044	TA	7	49737	49749	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
161	NC_018044	AT	6	50018	50029	12	50 %	50 %	8 %	39122401
162	NC_018044	AT	8	50143	50158	16	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
163	NC_018044	AT	9	50366	50382	17	50 %	50 %	5 %	Non-Coding
164	NC_018044	AT	6	50878	50889	12	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
165	NC_018044	AT	7	50996	51010	15	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
166	NC_018044	TA	12	51192	51216	25	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
167	NC_018044	TA	6	51271	51281	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
168	NC_018044	TA	10	51382	51402	21	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
169	NC_018044	TA	16	51407	51437	31	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
170	NC_018044	AT	8	52570	52586	17	50 %	50 %	5 %	39122401
171	NC_018044	AT	13	52598	52623	26	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
172	NC_018044	AT	7	52638	52651	14	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
173	NC_018044	TA	7	52680	52692	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
174	NC_018044	AT	7	53025	53038	14	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
175	NC_018044	TA	7	53239	53253	15	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
176	NC_018044	TA	6	53276	53286	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
177	NC_018044	AT	9	53416	53432	17	50 %	50 %	5 %	Non-Coding
178	NC_018044	TA	8	53757	53773	17	50 %	50 %	5 %	Non-Coding
179	NC_018044	AT	6	53774	53785	12	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
180	NC_018044	AT	12	54175	54198	24	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
181	NC_018044	TA	8	54273	54288	16	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
182	NC_018044	AT	6	54588	54600	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
183	NC_018044	TA	12	54756	54779	24	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
184	NC_018044	TA	6	54932	54945	14	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
185	NC_018044	AT	13	55017	55042	26	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
186	NC_018044	TA	8	56139	56154	16	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
187	NC_018044	AT	6	57163	57173	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
188	NC_018044	AT	10	57892	57913	22	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
189	NC_018044	TA	6	58100	58110	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
190	NC_018044	TA	6	58138	58149	12	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
191	NC_018044	TA	11	58150	58170	21	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
192	NC_018044	TA	6	58227	58239	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
193	NC_018044	TA	6	58493	58503	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
194	NC_018044	TA	8	59154	59169	16	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
195	NC_018044	TA	6	59429	59439	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
196	NC_018044	TA	8	59722	59737	16	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
197	NC_018044	TA	6	59861	59873	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
198	NC_018044	AT	7	59965	59980	16	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
199	NC_018044	AT	6	60099	60112	14	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
200	NC_018044	TA	6	60245	60257	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
201	NC_018044	AT	6	60490	60501	12	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
202	NC_018044	TA	13	60742	60767	26	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
203	NC_018044	TA	6	60918	60931	14	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
204	NC_018044	AT	6	61135	61145	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
205	NC_018044	AT	6	61478	61489	12	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
206	NC_018044	TA	12	61492	61514	23	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
207	NC_018044	AT	9	61522	61538	17	50 %	50 %	5 %	Non-Coding
208	NC_018044	TA	14	61607	61632	26	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
209	NC_018044	TA	12	61904	61925	22	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
210	NC_018044	AT	7	62162	62174	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
211	NC_018044	AT	8	62202	62216	15	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
212	NC_018044	TA	7	62507	62519	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
213	NC_018044	AT	11	63201	63223	23	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
214	NC_018044	TA	7	63764	63779	16	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
215	NC_018044	TA	7	63781	63795	15	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
216	NC_018044	AT	6	64330	64340	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
217	NC_018044	TA	12	64586	64608	23	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
218	NC_018044	TA	7	65010	65022	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
219	NC_018044	AT	12	65242	65265	24	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
220	NC_018044	AT	18	65650	65683	34	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
221	NC_018044	TA	6	65723	65735	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
222	NC_018044	TA	6	65882	65892	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
223	NC_018044	TA	12	66555	66577	23	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
224	NC_018044	TA	6	67098	67109	12	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
225	NC_018044	AT	12	67250	67276	27	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
226	NC_018044	TA	7	67330	67342	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
227	NC_018044	AT	6	67389	67399	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
228	NC_018044	TA	6	67582	67592	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
229	NC_018044	AT	6	67847	67857	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
230	NC_018044	AT	6	68132	68145	14	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
231	NC_018044	TA	8	68263	68279	17	50 %	50 %	5 %	Non-Coding
232	NC_018044	TA	7	68469	68481	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
233	NC_018044	AT	10	68618	68638	21	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
234	NC_018044	AT	17	68914	68947	34	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
235	NC_018044	AT	6	68958	68968	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
236	NC_018044	TA	6	69116	69127	12	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
237	NC_018044	AT	6	69223	69235	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
238	NC_018044	TA	7	69585	69600	16	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
239	NC_018044	AT	6	69668	69678	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
240	NC_018044	AT	14	69698	69724	27	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
241	NC_018044	AT	7	69768	69780	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
242	NC_018044	TA	6	70062	70072	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
243	NC_018044	TA	10	70115	70135	21	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
244	NC_018044	AT	6	70136	70146	11	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
245	NC_018044	AT	11	70605	70625	21	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
246	NC_018044	AT	6	70914	70926	13	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
247	NC_018044	TA	9	71165	71181	17	50 %	50 %	5 %	Non-Coding
248	NC_018044	TA	7	71184	71198	15	50 %	50 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Saccharomyces paradoxus mitochondrion