ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Blastocystis sp. subtype 3 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018042	TTAT	3	25	36	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39122396
2	NC_018042	TTATT	4	290	308	19	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	39122396
3	NC_018042	ATGT	3	490	500	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_018042	TAT	4	563	574	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122396
5	NC_018042	TTAT	3	823	833	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39122396
6	NC_018042	AAT	4	1389	1401	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_018042	TAA	4	1644	1654	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_018042	TA	7	2898	2911	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_018042	CTAA	3	3054	3065	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
10	NC_018042	TAAA	3	3262	3274	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_018042	TTTAA	3	4259	4273	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_018042	TTTTTA	3	4754	4772	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
13	NC_018042	AGTTT	3	4796	4811	16	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_018042	AATT	3	4945	4955	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_018042	TATT	4	5752	5767	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	39122396
16	NC_018042	TAT	5	6079	6093	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	39122396
17	NC_018042	TAAA	3	6877	6887	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39122396
18	NC_018042	AAAAT	3	6935	6948	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	39122396
19	NC_018042	ACAA	3	7277	7288	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	39122396
20	NC_018042	TA	6	7339	7350	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39122396
21	NC_018042	ATTT	3	7908	7918	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39122396
22	NC_018042	ATTT	3	9113	9124	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39122397
23	NC_018042	TTTA	3	9670	9681	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39122397
24	NC_018042	ATTT	3	9796	9807	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39122397
25	NC_018042	AAT	4	9936	9946	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39122397
26	NC_018042	AAT	8	10267	10289	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122397
27	NC_018042	TTTAAT	3	11562	11579	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	39122397
28	NC_018042	AAATT	4	11740	11759	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	39122397
29	NC_018042	TTTTA	3	12225	12238	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	39122397
30	NC_018042	ATT	4	12404	12416	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39122397
31	NC_018042	ATT	4	12518	12528	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39122397
32	NC_018042	AATTTA	3	12743	12760	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	39122397
33	NC_018042	TCAA	3	12766	12777	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	39122397
34	NC_018042	TAAA	3	12813	12824	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	39122397
35	NC_018042	TATT	3	13491	13502	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	39122397
36	NC_018042	ATT	4	13688	13699	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122397
37	NC_018042	TAA	4	13752	13763	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122397
38	NC_018042	TTTAA	3	13891	13906	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	39122397
39	NC_018042	TAA	4	14096	14106	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39122397
40	NC_018042	TA	6	14358	14368	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122397
41	NC_018042	TAA	4	15035	15046	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122397
42	NC_018042	AAAT	3	15745	15756	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	39122397
43	NC_018042	TAA	4	15805	15817	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39122397
44	NC_018042	AATTT	4	15864	15882	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	39122397
45	NC_018042	TAA	4	16217	16228	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122397
46	NC_018042	ACAAA	3	16265	16279	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	39122397
47	NC_018042	A	15	16328	16342	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	39122397
48	NC_018042	TAA	5	16340	16354	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	39122397
49	NC_018042	ATTT	4	16479	16494	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	39122397
50	NC_018042	TAA	4	16590	16601	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122397
51	NC_018042	TTAG	3	16711	16721	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	39122397
52	NC_018042	TTTA	3	16829	16839	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39122397
53	NC_018042	TAAA	3	17490	17500	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39122397
54	NC_018042	ATT	4	18293	18305	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39122398
55	NC_018042	TAA	4	18890	18901	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122398
56	NC_018042	AAT	4	19406	19417	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122398
57	NC_018042	ACA	4	19677	19689	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	39122398
58	NC_018042	T	15	20034	20048	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	39122398
59	NC_018042	T	12	20489	20500	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	39122398
60	NC_018042	T	16	21406	21421	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	39122398
61	NC_018042	TTA	4	21447	21457	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39122398
62	NC_018042	AAT	4	21591	21602	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122398
63	NC_018042	GGAT	3	21603	21613	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	39122398
64	NC_018042	ATT	4	21949	21959	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39122398
65	NC_018042	TAAA	3	22268	22278	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39122398
66	NC_018042	AATAA	3	22361	22375	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	39122398
67	NC_018042	TAA	4	22410	22421	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122398
68	NC_018042	AAT	6	22596	22612	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	39122398
69	NC_018042	GAAA	3	22854	22864	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	39122398
70	NC_018042	AT	6	22925	22935	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122398
71	NC_018042	TTAT	3	23839	23850	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39122398
72	NC_018042	TTTTA	3	25554	25567	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	39122398
73	NC_018042	TTTA	3	25660	25671	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39122398
74	NC_018042	TAT	4	25699	25709	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39122398
75	NC_018042	TTTA	3	26494	26506	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	39122398
76	NC_018042	ATT	4	26698	26709	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_018042	TTTA	3	26979	26989	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39122398
78	NC_018042	A	13	27112	27124	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	39122398
79	NC_018042	TTAA	3	27316	27327	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39122398

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Blastocystis sp. subtype 3 mitochondrion