ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Mimulus guttatus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018041	TCTT	3	203	214	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
2	NC_018041	GGTC	3	952	963	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_018041	CTTT	3	1770	1781	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
4	NC_018041	AAAG	4	5304	5319	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_018041	CAGT	3	6297	6309	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
6	NC_018041	TTAT	3	7132	7143	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_018041	GAAA	3	12368	12378	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_018041	CCCT	3	14631	14641	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
9	NC_018041	CTTC	3	15665	15675	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
10	NC_018041	CGAT	3	17064	17075	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
11	NC_018041	CCGA	3	17150	17161	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
12	NC_018041	AAGA	4	18195	18210	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_018041	GATT	3	22413	22424	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_018041	CCTT	3	23002	23013	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
15	NC_018041	TTAG	3	23978	23988	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_018041	AGGA	3	25705	25715	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_018041	AGGC	3	28509	28520	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
18	NC_018041	AAAG	3	30220	30231	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	39134891
19	NC_018041	CTTC	3	32467	32478	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
20	NC_018041	TTGA	3	33298	33309	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018041	TTTC	3	35135	35146	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	39134895
22	NC_018041	GGGA	3	36645	36656	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	39134895
23	NC_018041	TTCA	3	39594	39604	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	39134895
24	NC_018041	ATCG	3	40364	40374	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	39134895
25	NC_018041	ACTC	3	40544	40556	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	39134895
26	NC_018041	TGAA	3	44765	44775	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	39134895
27	NC_018041	CGGC	3	44979	44990	12	0 %	0 %	50 %	50 %	0 %	39134895
28	NC_018041	TTTC	3	49850	49861	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	39134895
29	NC_018041	AGCT	3	51973	51984	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	39134895
30	NC_018041	ATAG	3	54885	54896	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	39134895
31	NC_018041	AGTT	3	55362	55373	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	39134895
32	NC_018041	CATA	3	62892	62902	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	39134895
33	NC_018041	TTTC	3	64933	64943	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	39134895
34	NC_018041	GCTT	3	67728	67739	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	39134895
35	NC_018041	CATC	3	70388	70399	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	39134895
36	NC_018041	GAAC	3	70732	70744	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	39134895
37	NC_018041	CGGT	3	71490	71501	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	39134895
38	NC_018041	TAAA	3	75304	75314	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39134895
39	NC_018041	CTTA	3	75703	75714	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	39134895
40	NC_018041	TGAT	3	75901	75912	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	39134895
41	NC_018041	CTTA	3	77766	77776	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	39134895
42	NC_018041	TTCC	3	78196	78206	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	39134895
43	NC_018041	CTTG	3	88572	88582	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	39134895
44	NC_018041	GAAA	3	94313	94323	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	39134895
45	NC_018041	TCTA	3	94354	94365	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	39134895
46	NC_018041	AAAT	3	95333	95344	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	39134895
47	NC_018041	CTGT	3	100827	100838	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	39134895
48	NC_018041	CATC	3	103945	103956	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	39134895
49	NC_018041	TATG	3	104388	104399	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	39134895
50	NC_018041	TATG	3	105215	105225	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	39134895
51	NC_018041	CTAG	3	105780	105790	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	39134895
52	NC_018041	GATA	3	106764	106775	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	39134895
53	NC_018041	CAAC	3	108661	108672	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	39134895
54	NC_018041	GTAG	3	110891	110903	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	39134895
55	NC_018041	CAAG	3	112325	112336	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	39134895
56	NC_018041	AAGG	3	112544	112554	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	39134895
57	NC_018041	GATC	3	114507	114517	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	39134895
58	NC_018041	GAAA	3	118057	118068	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	39134895
59	NC_018041	ATTC	3	118995	119005	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	39134895
60	NC_018041	TAAA	4	120891	120906	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	39134895
61	NC_018041	TAAA	3	120909	120920	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	39134895
62	NC_018041	ACTC	3	121415	121426	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	39134895
63	NC_018041	GGGT	3	122355	122366	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	39134895
64	NC_018041	TACG	3	123847	123857	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	39134895
65	NC_018041	GAAA	3	124479	124491	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	39134895
66	NC_018041	GGAA	3	124659	124670	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	39134895
67	NC_018041	TGGG	3	125737	125748	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	39134895
68	NC_018041	CTTT	3	127182	127193	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	39134895
69	NC_018041	CTTC	3	127755	127766	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	39134895
70	NC_018041	TCCT	3	130811	130822	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	39134895
71	NC_018041	TTTG	3	133500	133511	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	39134895
72	NC_018041	GATA	3	134089	134100	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	39134895
73	NC_018041	GTAG	3	135929	135940	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	39134895
74	NC_018041	CAAT	3	135988	136000	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	39134895
75	NC_018041	CTTT	3	136216	136227	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	39134895
76	NC_018041	CAAG	4	136299	136313	15	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	39134895
77	NC_018041	TACG	3	138199	138209	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	39134895
78	NC_018041	CGTT	3	141897	141908	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	39134895
79	NC_018041	CTTT	3	145035	145045	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	39134895
80	NC_018041	ACCT	3	145399	145410	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	39134895
81	NC_018041	GTAA	3	150869	150884	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	39134895
82	NC_018041	TCAT	3	151209	151219	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	39134895
83	NC_018041	CTTA	3	153333	153343	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	39134895
84	NC_018041	CATT	3	163176	163187	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	39134895
85	NC_018041	TCTT	4	164030	164044	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	39134895
86	NC_018041	ATTT	3	165621	165632	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39134895
87	NC_018041	TAGA	3	168083	168095	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	39134895
88	NC_018041	ATGG	3	169018	169029	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	39134895
89	NC_018041	TCGC	3	171179	171190	12	0 %	25 %	25 %	50 %	0 %	39134895
90	NC_018041	AAGA	3	173957	173968	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	39134895
91	NC_018041	CTTT	3	182724	182735	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	39134895
92	NC_018041	GAAT	3	184655	184666	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	39134895
93	NC_018041	AGCT	3	185054	185064	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	39134895
94	NC_018041	AAGG	3	186335	186345	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	39134895
95	NC_018041	GCTA	3	186676	186686	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	39134895
96	NC_018041	TCAA	3	189747	189758	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	39134895
97	NC_018041	AAGC	3	194397	194408	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	39134895
98	NC_018041	GGCT	3	194894	194906	13	0 %	25 %	50 %	25 %	7 %	39134895
99	NC_018041	CGAA	3	195146	195157	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	39134895
100	NC_018041	TGAA	3	195770	195782	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	39134895
101	NC_018041	CTCA	3	198186	198197	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	39134895
102	NC_018041	AACT	3	198629	198640	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	39134895
103	NC_018041	CCTT	3	206506	206516	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	39134895
104	NC_018041	AGAA	3	206685	206696	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	39134895
105	NC_018041	CTAA	3	208232	208242	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	39134895
106	NC_018041	AAGG	3	209207	209218	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	39134895
107	NC_018041	CTTT	3	209660	209672	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	39134895
108	NC_018041	TTCT	4	214009	214024	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	39134895
109	NC_018041	AATC	3	215144	215155	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	39134895
110	NC_018041	GAAG	3	216545	216555	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	39134895
111	NC_018041	AGGG	3	217579	217589	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	39134895
112	NC_018041	TTTC	3	219842	219852	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	39134895
113	NC_018041	AGAT	3	225075	225086	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	39134895
114	NC_018041	AAAG	3	225400	225410	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	39134895
115	NC_018041	ACTG	3	225911	225923	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	39134895
116	NC_018041	CAGA	3	227038	227048	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	39134895
117	NC_018041	AAAG	3	230439	230450	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	39134895
118	NC_018041	TCCA	3	230508	230518	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	39134895
119	NC_018041	GACC	3	231257	231268	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	39134895
120	NC_018041	ATTT	3	232852	232863	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39134895
121	NC_018041	GAAA	3	233108	233119	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	39134895
122	NC_018041	GAAA	4	235119	235134	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	39134895
123	NC_018041	GGGA	3	240057	240068	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	39134895
124	NC_018041	GAAA	3	245155	245167	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	39134895
125	NC_018041	AAAG	3	246926	246938	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	39134895
126	NC_018041	CCTT	3	249721	249732	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	39134895
127	NC_018041	TAGC	4	254556	254572	17	25 %	25 %	25 %	25 %	5 %	39134895
128	NC_018041	GAAT	3	255329	255339	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	39134895
129	NC_018041	GTCC	4	256230	256246	17	0 %	25 %	25 %	50 %	5 %	39134895
130	NC_018041	CTTT	3	259586	259598	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	39134895
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132	NC_018041	GCTT	3	261583	261594	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	39134895
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287	NC_018041	AGCA	3	518876	518887	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
288	NC_018041	AATC	3	520452	520462	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
289	NC_018041	AGGG	3	521284	521296	13	25 %	0 %	75 %	0 %	7 %	Non-Coding
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291	NC_018041	TTCT	3	522690	522701	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
292	NC_018041	ACTG	3	523124	523136	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Mimulus guttatus mitochondrion