ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Papilio bianor mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018040	TTTAT	3	129	143	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_018040	TAAAT	3	201	215	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018040	ATTT	3	275	286	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39122394
4	NC_018040	AATT	3	509	519	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122394
5	NC_018040	TAA	5	694	708	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	39122394
6	NC_018040	AATT	3	782	792	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122394
7	NC_018040	ATT	4	920	932	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39122394
8	NC_018040	TAT	4	1070	1081	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122394
9	NC_018040	T	12	1244	1255	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	39122394
10	NC_018040	AATT	3	1679	1690	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39122395
11	NC_018040	TAA	7	2835	2855	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	39122395
12	NC_018040	TAT	4	2881	2891	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39122395
13	NC_018040	AATT	3	3715	3725	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122395
14	NC_018040	ATA	8	3966	3989	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122395
15	NC_018040	TAA	4	3994	4005	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122395
16	NC_018040	ATT	4	4110	4122	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39122395
17	NC_018040	AATT	3	4386	4396	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122395
18	NC_018040	TTAT	3	5366	5377	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39122395
19	NC_018040	TAT	4	5579	5590	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122395
20	NC_018040	AAT	4	5838	5849	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122395
21	NC_018040	ATA	4	6327	6339	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39122395
22	NC_018040	TAAA	3	6366	6377	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	39122395
23	NC_018040	AATT	3	6384	6394	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122395
24	NC_018040	TAAA	3	6508	6518	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39122395
25	NC_018040	ATA	4	6758	6770	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39122395
26	NC_018040	AATTAT	3	6828	6846	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	39122395
27	NC_018040	TTA	4	7191	7202	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122395
28	NC_018040	ATA	5	7296	7310	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	39122395
29	NC_018040	TGAA	3	7384	7394	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	39122395
30	NC_018040	A	12	7535	7546	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	39122395
31	NC_018040	TAA	4	7734	7746	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39122395
32	NC_018040	ATTT	3	7990	8000	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39122395
33	NC_018040	TAAAAA	3	8002	8020	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	39122395
34	NC_018040	TTTA	3	8051	8062	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_018040	TTAA	3	8112	8123	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_018040	ATA	4	8156	8167	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122395
37	NC_018040	ATC	4	8424	8435	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	39122395
38	NC_018040	AAAT	3	9031	9041	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39122395
39	NC_018040	TAA	5	9175	9188	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39122395
40	NC_018040	ATATTT	3	9341	9358	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	39122395
41	NC_018040	AT	9	9583	9599	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	39122395
42	NC_018040	TAA	4	9725	9735	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39122395
43	NC_018040	ATT	4	9864	9874	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_018040	TTA	4	9916	9928	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39122395
45	NC_018040	AT	7	10197	10209	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	39122395
46	NC_018040	AAAT	3	10248	10260	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	39122395
47	NC_018040	TAA	5	10331	10345	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	39122395
48	NC_018040	TTAT	4	10346	10361	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	39122395
49	NC_018040	TA	6	10603	10613	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122396
50	NC_018040	ATT	4	10796	10809	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39122396
51	NC_018040	ATTT	3	11034	11044	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39122396
52	NC_018040	TAAAA	3	12268	12281	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	39122396
53	NC_018040	TAA	4	12306	12316	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39122396
54	NC_018040	AAAT	3	12580	12591	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	39122396
55	NC_018040	TA	7	12611	12624	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_018040	TCAT	3	12968	12979	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018040	TTTAAT	3	13044	13061	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
58	NC_018040	TAA	4	13072	13084	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_018040	ATTT	3	13379	13394	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_018040	TATTT	3	13421	13435	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
61	NC_018040	TAATTA	3	13485	13501	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
62	NC_018040	AAATT	3	14005	14018	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_018040	TAAA	3	14174	14186	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_018040	TTAAA	3	14766	14780	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_018040	ATTAT	3	15138	15152	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018040	TAAT	3	15153	15165	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_018040	TTAAA	3	15260	15274	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Papilio bianor mitochondrion