ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Melitaea cinxia mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018029	TTTAT	3	128	142	15	20 %	80 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_018029	TTTTA	3	281	294	14	20 %	80 %	0 %	7 %	39122379
3	NC_018029	TAT	4	488	499	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	39122379
4	NC_018029	ATA	4	700	711	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39122379
5	NC_018029	TAT	4	867	878	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	39122379
6	NC_018029	AATT	3	1681	1692	12	50 %	50 %	0 %	8 %	39122379
7	NC_018029	AGG	4	2112	2123	12	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	39122379
8	NC_018029	GAAA	3	2231	2242	12	75 %	0 %	25 %	8 %	39122379
9	NC_018029	TTTA	4	2473	2488	16	25 %	75 %	0 %	6 %	39122379
10	NC_018029	TAA	4	2651	2663	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	39122379
11	NC_018029	ATA	7	2839	2859	21	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	39122379
12	NC_018029	TTAA	3	3330	3342	13	50 %	50 %	0 %	7 %	39122379
13	NC_018029	AATT	3	3713	3723	11	50 %	50 %	0 %	9 %	39122379
14	NC_018029	T	27	3894	3920	27	0 %	100 %	0 %	7 %	39122379
15	NC_018029	T	16	4254	4269	16	0 %	100 %	0 %	6 %	39122380
16	NC_018029	ATT	4	4610	4620	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	39122380
17	NC_018029	TTGA	3	4736	4746	11	25 %	50 %	25 %	9 %	39122380
18	NC_018029	TAT	4	5196	5207	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	39122380
19	NC_018029	ATT	4	5562	5572	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	39122380
20	NC_018029	TAA	4	5611	5622	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39122380
21	NC_018029	TAT	4	5849	5859	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	39122380
22	NC_018029	AATTA	3	5906	5919	14	60 %	40 %	0 %	7 %	39122380
23	NC_018029	AATT	3	6372	6383	12	50 %	50 %	0 %	8 %	39122380
24	NC_018029	TAA	5	6748	6762	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	39122380
25	NC_018029	ATAA	6	6886	6909	24	75 %	25 %	0 %	8 %	39122380
26	NC_018029	ATT	4	7066	7078	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	39122380
27	NC_018029	TAAA	3	7104	7114	11	75 %	25 %	0 %	9 %	39122380
28	NC_018029	TTA	4	7179	7190	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	39122380
29	NC_018029	TAA	4	7288	7298	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	39122380
30	NC_018029	AATT	3	7318	7329	12	50 %	50 %	0 %	8 %	39122380
31	NC_018029	AAAT	3	7523	7533	11	75 %	25 %	0 %	9 %	39122380
32	NC_018029	AAATTA	3	7566	7583	18	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	39122380
33	NC_018029	TAA	4	7722	7734	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	39122380
34	NC_018029	ATAA	3	7813	7823	11	75 %	25 %	0 %	9 %	39122380
35	NC_018029	AGA	4	7825	7835	11	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	39122380
36	NC_018029	ATA	4	7952	7962	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	39122380
37	NC_018029	AAAAAT	3	7994	8011	18	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	39122380
38	NC_018029	ATT	4	8288	8299	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	39122380
39	NC_018029	ATA	7	9152	9172	21	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	39122380
40	NC_018029	ATT	9	9347	9373	27	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	39122380
41	NC_018029	A	14	9601	9614	14	100 %	0 %	0 %	0 %	39122380
42	NC_018029	ATT	4	9839	9850	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_018029	ATTTT	4	10015	10034	20	20 %	80 %	0 %	10 %	39122380
44	NC_018029	TTTA	3	10060	10071	12	25 %	75 %	0 %	0 %	39122380
45	NC_018029	ATA	4	10307	10318	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	39122380
46	NC_018029	ATTT	4	10319	10334	16	25 %	75 %	0 %	6 %	39122380
47	NC_018029	ATTT	3	11108	11118	11	25 %	75 %	0 %	9 %	39122380
48	NC_018029	TAT	5	11405	11418	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	39122380
49	NC_018029	TAAT	3	11546	11557	12	50 %	50 %	0 %	0 %	39122380
50	NC_018029	TTAA	3	12070	12081	12	50 %	50 %	0 %	8 %	39122380
51	NC_018029	TAAAA	3	12242	12255	14	80 %	20 %	0 %	7 %	39122380
52	NC_018029	T	14	12868	12881	14	0 %	100 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_018029	TAA	4	13053	13065	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_018029	TTTAA	4	13343	13362	20	40 %	60 %	0 %	5 %	Non-Coding
55	NC_018029	T	15	13363	13377	15	0 %	100 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_018029	TATAA	3	13486	13500	15	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_018029	TTAA	3	13529	13539	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_018029	ATTTAA	3	13631	13648	18	50 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
59	NC_018029	ATTA	3	13739	13750	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018029	AATT	5	13997	14015	19	50 %	50 %	0 %	10 %	Non-Coding
61	NC_018029	TAT	5	14604	14619	16	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_018029	T	25	14858	14882	25	0 %	100 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_018029	AAATT	3	15014	15027	14	60 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_018029	TAAAT	3	15028	15041	14	60 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_018029	AT	8	15102	15119	18	50 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Melitaea cinxia mitochondrion