ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Fusarium oxysporum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017930	TAGC	3	774	785	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
2	NC_017930	GTAA	3	1280	1291	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_017930	AAG	4	1583	1594	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_017930	TAT	4	2126	2138	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_017930	TAAA	3	2877	2887	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38793549
6	NC_017930	AAT	4	2960	2971	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38793549
7	NC_017930	TAA	4	3139	3150	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38793549
8	NC_017930	TTCA	3	4039	4049	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	38793549
9	NC_017930	CAAA	3	5194	5206	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
10	NC_017930	TTTA	3	5846	5857	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_017930	ATTAAC	3	6089	6106	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	38793549
12	NC_017930	AAAT	3	6193	6203	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38793549
13	NC_017930	TA	6	6337	6347	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38793549
14	NC_017930	TA	6	6350	6360	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38793549
15	NC_017930	TTA	4	6539	6549	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38793549
16	NC_017930	TAT	4	6694	6705	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38793549
17	NC_017930	TTTA	3	7252	7262	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38793549
18	NC_017930	AGC	4	8097	8107	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
19	NC_017930	TA	6	8551	8561	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_017930	ACATTT	3	8754	8771	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
21	NC_017930	TAT	5	8990	9003	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	38793549
22	NC_017930	ATA	4	9009	9020	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38793549
23	NC_017930	AAGC	3	9199	9210	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
24	NC_017930	A	12	9392	9403	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_017930	ATTT	3	10096	10107	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38793550
26	NC_017930	TAAA	3	10911	10922	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_017930	GCTA	3	11420	11432	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
28	NC_017930	T	13	11498	11510	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017930	CTAT	3	11769	11779	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	38793550
30	NC_017930	TTTA	3	12281	12292	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38793550
31	NC_017930	TTAT	3	12337	12348	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38793550
32	NC_017930	ATA	4	13041	13052	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38793550
33	NC_017930	AT	7	13462	13474	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38793550
34	NC_017930	AATT	3	13568	13579	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	38793550
35	NC_017930	ATT	4	13962	13973	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38793550
36	NC_017930	CTAAAG	3	15823	15841	19	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
37	NC_017930	AGCT	3	16416	16427	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017930	TAAA	4	16578	16593	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
39	NC_017930	T	12	16671	16682	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_017930	TA	10	16708	16727	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
41	NC_017930	AT	6	16730	16742	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_017930	TATATT	3	17451	17468	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	38793550
43	NC_017930	AGGG	3	18065	18075	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_017930	GCTA	3	18414	18425	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
45	NC_017930	A	12	18678	18689	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_017930	GCAA	3	19002	19013	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
47	NC_017930	TTACA	5	19269	19293	25	40 %	40 %	0 %	20 %	8 %	Non-Coding
48	NC_017930	TAAT	3	19453	19463	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_017930	TTA	4	20185	20196	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38793550
50	NC_017930	CTAA	3	21769	21780	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
51	NC_017930	A	12	22002	22013	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_017930	TAA	7	23666	23686	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38793550
53	NC_017930	TTAAAT	3	23695	23712	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	38793550
54	NC_017930	TA	6	24254	24264	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38793550
55	NC_017930	AAT	4	24798	24809	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38793550
56	NC_017930	ATT	4	25896	25907	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38793550
57	NC_017930	AT	7	26264	26276	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38793550
58	NC_017930	TATTTA	3	27079	27096	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	38793550
59	NC_017930	TTTA	3	27440	27450	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38793550
60	NC_017930	TAGC	3	27561	27572	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
61	NC_017930	GAG	4	28945	28955	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_017930	AATG	3	29081	29091	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_017930	TTTAT	3	29393	29406	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_017930	TAGCTT	6	30368	30405	38	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
65	NC_017930	A	13	30638	30650	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_017930	ATC	4	31625	31636	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	38793551
67	NC_017930	TTAA	3	31722	31733	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38793551
68	NC_017930	GCTTTT	3	31735	31753	19	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
69	NC_017930	CTAG	3	31831	31842	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
70	NC_017930	GTAATA	3	32014	32031	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
71	NC_017930	A	12	32365	32376	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_017930	CTATTC	3	32441	32458	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
73	NC_017930	TAA	5	32742	32757	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	38793551
74	NC_017930	ATACT	3	33054	33068	15	40 %	40 %	0 %	20 %	0 %	38793551

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Fusarium oxysporum mitochondrion