ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Plasmodium falciparum HB3 apicoplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_017928TAAATA34684851866.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
2NC_017928TAA58048171466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
3NC_017928AT7100410181550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
4NC_017928ATAA3114411561375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
5NC_017928ATT4116311731133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
6NC_017928ATT5125412681533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
7NC_017928TAT4206520761233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
8NC_017928TA8219322071550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
9NC_017928ATT4250925191133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
10NC_017928TAA4252925411366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
11NC_017928TTTAA3254825611440 %60 %0 %0 %7 %Non-Coding
12NC_017928TAT4259626081333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
13NC_017928TTATTT3264626641916.67 %83.33 %0 %0 %10 %Non-Coding
14NC_017928ATTA3278227931250 %50 %0 %0 %0 %Non-Coding
15NC_017928TAA4279428041166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
16NC_017928ATA4299930101266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
17NC_017928AAAT3304430541175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
18NC_017928AATT3309831091250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
19NC_017928ATTT3311731271125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
20NC_017928TAAA3335433651275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_017928AATA3358836001375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
22NC_017928A143602361514100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
23NC_017928AT6371337231150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
24NC_017928ATTT3372837391225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
25NC_017928TA6384038501150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
26NC_017928TTAA3388038911250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
27NC_017928TAAT3406440761350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
28NC_017928AT6414141511150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
29NC_017928AT6415741681250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
30NC_017928ATT9418642122733.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
31NC_017928AT6442844391250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
32NC_017928TAAA3447544861275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
33NC_017928AAAT3495549661275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
34NC_017928ATT4506950801233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
35NC_017928ATT4513151431333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
36NC_017928AT6519552051150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
37NC_017928TAA4532753371166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
38NC_017928TAA6543954571966.67 %33.33 %0 %0 %10 %Non-Coding
39NC_017928AAATAT3550755231766.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
40NC_017928TAAA3562056321375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
41NC_017928TAT4565256621133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
42NC_017928AT6569757071150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
43NC_017928ATA4599360031166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
44NC_017928TA8604960641650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
45NC_017928ATA4606560761266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
46NC_017928AT6607960891150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
47NC_017928AT7610461191650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
48NC_017928AATT3649065011250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
49NC_017928ATTAT3661766311540 %60 %0 %0 %0 %Non-Coding
50NC_017928ATA4663066421366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
51NC_017928TAA4666266731266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
52NC_017928ATTTT3667966921420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
53NC_017928ATA4670667201566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
54NC_017928ATA4674867591266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
55NC_017928AAATA3677567881480 %20 %0 %0 %7 %Non-Coding
56NC_017928AT6698069921350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
57NC_017928ATT4705270631233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
58NC_017928TAA4710071101166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
59NC_017928ATT6715471711833.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
60NC_017928TA7722172331350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
61NC_017928AT6723472451250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
62NC_017928AAT4739074001166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
63NC_017928AAAT3740974201275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
64NC_017928ATA5762576401666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
65NC_017928AT8840884221550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
66NC_017928TA6857285821150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
67NC_017928TA6872487371450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
68NC_017928TAT5876887831633.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
69NC_017928ATG4922992391133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
70NC_017928AATT3927692861150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
71NC_017928AATT3940594161250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
72NC_017928ATT710152101722133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
73NC_017928AT610350103601150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
74NC_017928AATA310724107351275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
75NC_017928ATTTAT310768107861933.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
76NC_017928TAT410884108941133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
77NC_017928ATT410906109161133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
78NC_017928ATT410930109421333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
79NC_017928ATAA310943109531175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
80NC_017928TAAA310957109681275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
81NC_017928TAA411026110371266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
82NC_017928ATA411068110791266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
83NC_017928TATT311090111011225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
84NC_017928ATA511206112201566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
85NC_017928TAT611305113221833.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
86NC_017928ATA411488114991266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
87NC_017928AATT311608116181150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
88NC_017928ATAA311625116351175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
89NC_017928ATA411818118281166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
90NC_017928AT612007120171150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
91NC_017928AATT312067120781250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
92NC_017928ATA512206122191466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
93NC_017928TAA612227122441866.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
94NC_017928AT612367123771150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
95NC_017928TAA412395124051166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
96NC_017928TAAA312436124461175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
97NC_017928AT612718127301350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
98NC_017928TAT413236132461133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
99NC_017928ATAA313382133931275 %25 %0 %0 %0 %Non-Coding
100NC_017928AAATT313515135301660 %40 %0 %0 %6 %Non-Coding
101NC_017928TTAT313536135481325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
102NC_017928TAT413737137481233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
103NC_017928ATA413817138281266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
104NC_017928TA613888139001350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
105NC_017928TATAAA313902139201966.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
106NC_017928AAAT313947139571175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
107NC_017928TAT413964139741133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
108NC_017928AT714027140391350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
109NC_017928ATGA314072140831250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
110NC_017928TATAA314304143181560 %40 %0 %0 %6 %Non-Coding
111NC_017928ATT514516145301533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
112NC_017928TTA414541145531333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
113NC_017928TA614584145951250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
114NC_017928TA814641146561650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
115NC_017928TTTA314837148471125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
116NC_017928TTA414860148701133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
117NC_017928AT615167151821650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
118NC_017928TA815379153951750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
119NC_017928AAATA315448154611480 %20 %0 %0 %7 %Non-Coding
120NC_017928TAT515544155581533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
121NC_017928ATT415587155991333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
122NC_017928TAT415631156421233.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
123NC_017928AAT415644156541166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
124NC_017928TA615661156711150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
125NC_017928ATT515686157001533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
126NC_017928TTATAT315733157491733.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
127NC_017928TA815769157831550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
128NC_017928ATTAT315785157981440 %60 %0 %0 %7 %Non-Coding
129NC_017928ATT415854158641133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
130NC_017928TAA416059160691166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
131NC_017928ATA416108161191266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
132NC_017928AAAAT316122161361580 %20 %0 %0 %6 %Non-Coding
133NC_017928TTA616166161841933.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
134NC_017928TAA416341163521266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
135NC_017928AT616427164381250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
136NC_017928TATTTA416540165612233.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
137NC_017928TA616755167651150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
138NC_017928ATA417350173611266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
139NC_017928TAT417402174141333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
140NC_017928TA1017638176561950 %50 %0 %0 %10 %Non-Coding
141NC_017928ATT417698177111433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
142NC_017928TAAATA417730177512266.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
143NC_017928TTA417752177631233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
144NC_017928ATT417811178221233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
145NC_017928TAA417823178341266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
146NC_017928ATA418103181131166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
147NC_017928TAT418272182841333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
148NC_017928TAT418401184121233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
149NC_017928TTTA318661186731325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
150NC_017928TAA418737187491366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
151NC_017928TTTA318753187631125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
152NC_017928TAA418969189801266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
153NC_017928ATTACA319143191601850 %33.33 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
154NC_017928TAT519346193611633.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
155NC_017928TATT319498195081125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
156NC_017928TTA419509195201233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
157NC_017928ATA419748197601366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
158NC_017928ATT519859198731533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
159NC_017928AT619936199461150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
160NC_017928AT620186201961150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
161NC_017928AAAT320312203221175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
162NC_017928TAA420323203341266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
163NC_017928TAAA320774207841175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
164NC_017928TTA520809208231533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
165NC_017928TTAA321280212911250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
166NC_017928TTTA321518215281125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
167NC_017928TAT421541215531333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
168NC_017928TA621725217371350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
169NC_017928TAA421754217661366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
170NC_017928TAT421790218001133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
171NC_017928TAT421853218651333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
172NC_017928TA721887218991350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
173NC_017928ATA421907219181266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
174NC_017928AT1022001220212150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
175NC_017928TAT422030220411233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
176NC_017928ATA422113221241266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
177NC_017928TAATAT322139221561850 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
178NC_017928TTTATA422164221872433.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
179NC_017928TAT422318223281133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
180NC_017928ATT422352223641333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
181NC_017928AT622431224411150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
182NC_017928ATT422520225311233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
183NC_017928ATT722550225702133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
184NC_017928TAT422673226841233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
185NC_017928TTAA322725227371350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
186NC_017928TTTTA322827228401420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
187NC_017928TTAA322914229251250 %50 %0 %0 %0 %Non-Coding
188NC_017928TAA423062230731266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
189NC_017928TAT423124231351233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
190NC_017928ATA424076240881366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
191NC_017928AATA424438244531675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
192NC_017928TTTA324535245461225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
193NC_017928AT625215252261250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
194NC_017928TA825434254481550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
195NC_017928ATTT325558255681125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
196NC_017928AT725652256651450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
197NC_017928ATT425742257531233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
198NC_017928TATAA325771257851560 %40 %0 %0 %6 %Non-Coding
199NC_017928TATTAA326278262951850 %50 %0 %0 %0 %Non-Coding
200NC_017928TAAA326546265571275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
201NC_017928TAAAAT326654266711866.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
202NC_017928TTTA326767267791325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
203NC_017928ATT426793268041233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
204NC_017928TTA427042270541333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
205NC_017928TA627067270771150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
206NC_017928TA627122271321150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
207NC_017928TATT327300273111225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
208NC_017928TA627497275081250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
209NC_017928ATATTT327666276831833.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
210NC_017928ATT427991280021233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
211NC_017928TTTTTA328220282361716.67 %83.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
212NC_017928CAG428280282911233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
213NC_017928ATA528401284141466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
214NC_017928TATATT328585286011733.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
215NC_017928AAT428981289911166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
216NC_017928ATA429156291681366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
217NC_017928ATA429225292351166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
218NC_017928TA629274292851250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
219NC_017928AAT429332293431266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding