ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Rafetus swinhoei mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017901	ACC	4	1130	1142	13	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
2	NC_017901	GTTC	3	2506	2517	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_017901	TAA	5	2672	2686	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_017901	CTC	4	2772	2782	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
5	NC_017901	CTACCA	3	3060	3077	18	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	5 %	38680099
6	NC_017901	CCT	4	3104	3115	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	38680099
7	NC_017901	CAT	4	3242	3253	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	38680099
8	NC_017901	ACT	4	3588	3598	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	38680099
9	NC_017901	TAC	4	5982	5993	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	38680099
10	NC_017901	ATA	4	6797	6808	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680099
11	NC_017901	AAC	4	7218	7228	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	38680099
12	NC_017901	AACC	3	7618	7629	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	38680099
13	NC_017901	CACAC	3	8276	8289	14	40 %	0 %	0 %	60 %	7 %	38680100
14	NC_017901	TAC	4	8587	8598	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	38680100
15	NC_017901	AGC	4	8740	8751	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	38680100
16	NC_017901	ACA	4	8793	8803	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	38680100
17	NC_017901	ACACC	3	8887	8901	15	40 %	0 %	0 %	60 %	0 %	38680100
18	NC_017901	AATC	3	9149	9160	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	38680100
19	NC_017901	CAAT	3	9497	9508	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
20	NC_017901	TTC	4	9818	9829	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	38680100
21	NC_017901	TTCA	3	10112	10122	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	38680100
22	NC_017901	TAA	4	10635	10646	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680100
23	NC_017901	ATC	4	11423	11433	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	38680100
24	NC_017901	GCCA	3	12526	12536	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	38680099
25	NC_017901	ACA	5	13544	13558	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	38680099
26	NC_017901	CCAA	4	13698	13712	15	50 %	0 %	0 %	50 %	6 %	38680100
27	NC_017901	ATA	4	13728	13739	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680100
28	NC_017901	AAAG	3	13990	14001	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	38680100
29	NC_017901	AACC	3	14054	14064	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	38680100
30	NC_017901	CAAA	3	14104	14114	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	38680100
31	NC_017901	AACC	4	15341	15356	16	50 %	0 %	0 %	50 %	6 %	38680099
32	NC_017901	TA	8	16861	16877	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
33	NC_017901	TA	8	16879	16895	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
34	NC_017901	TA	8	16897	16913	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Rafetus swinhoei mitochondrion