ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Aspergillus nidulans FGSC A4 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017896	TAA	4	493	504	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680091
2	NC_017896	ATT	4	1657	1668	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680091
3	NC_017896	ATT	4	2947	2958	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_017896	TAT	4	3293	3303	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38680091
5	NC_017896	ATA	4	4361	4372	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680091
6	NC_017896	GAT	4	8876	8887	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	38680092
7	NC_017896	ATT	4	10151	10162	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_017896	ATA	4	11409	11420	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680092
9	NC_017896	TCT	4	11450	11461	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	38680092
10	NC_017896	TAT	4	11913	11924	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680092
11	NC_017896	AAT	4	12175	12186	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680092
12	NC_017896	AAT	5	14122	14135	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38680092
13	NC_017896	AGT	4	15315	15326	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_017896	ATA	4	15603	15614	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_017896	AAT	4	15649	15660	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_017896	TCA	4	17503	17514	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	38680092
17	NC_017896	TAT	4	17702	17713	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680092
18	NC_017896	ACA	4	17886	17897	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	38680092
19	NC_017896	ATC	4	18496	18507	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	38680092
20	NC_017896	TTG	4	18541	18552	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	38680092
21	NC_017896	ATA	4	18810	18820	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_017896	TAA	4	20834	20845	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017896	ATT	5	22490	22503	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_017896	AAT	4	22504	22515	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017896	CAA	4	23062	23073	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	38680093
26	NC_017896	TAA	4	25634	25644	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_017896	ATT	5	26917	26931	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	38680093
28	NC_017896	TTA	6	27871	27888	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	38680093
29	NC_017896	AAT	4	28069	28080	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680093
30	NC_017896	TGG	4	29099	29110	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	38680093
31	NC_017896	ATT	6	30214	30231	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	38680093
32	NC_017896	ACA	4	31920	31931	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	38680093
33	NC_017896	TAA	7	32311	32330	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	38680093
34	NC_017896	ATA	4	32573	32583	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38680093
35	NC_017896	ATT	4	32766	32776	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38680093
36	NC_017896	TTA	4	33193	33204	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680093

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Aspergillus nidulans FGSC A4 mitochondrion