ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Aspergillus nidulans FGSC A4 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017896	TAA	4	493	504	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680091
2	NC_017896	AT	6	546	556	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38680091
3	NC_017896	TTTA	3	986	997	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38680091
4	NC_017896	TATT	3	1285	1296	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38680091
5	NC_017896	ATT	4	1657	1668	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680091
6	NC_017896	TTAA	3	2623	2633	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38680091
7	NC_017896	TTATA	3	2636	2650	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_017896	AT	12	2707	2730	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_017896	AT	6	2875	2888	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_017896	ATT	4	2947	2958	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_017896	ATTT	3	3166	3177	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_017896	TAT	4	3293	3303	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38680091
13	NC_017896	TATC	3	3306	3317	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	38680091
14	NC_017896	TTAT	3	3601	3611	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38680091
15	NC_017896	ATTAT	3	3690	3703	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	38680091
16	NC_017896	ATA	4	4361	4372	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680091
17	NC_017896	TTAT	3	4434	4445	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38680091
18	NC_017896	TTTA	3	4610	4620	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38680091
19	NC_017896	TAAT	3	4821	4832	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38680091
20	NC_017896	TA	13	4898	4924	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_017896	AT	12	5387	5410	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_017896	TA	10	5547	5565	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
23	NC_017896	TA	7	5747	5760	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38680092
24	NC_017896	A	14	7402	7415	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_017896	A	17	7640	7656	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
26	NC_017896	A	19	7675	7693	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
27	NC_017896	AAAAT	3	8537	8550	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	38680092
28	NC_017896	GAT	4	8876	8887	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	38680092
29	NC_017896	ATT	4	10151	10162	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_017896	TA	6	10512	10522	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_017896	AATA	3	10530	10541	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017896	ATA	4	11409	11420	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680092
33	NC_017896	TCT	4	11450	11461	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	38680092
34	NC_017896	TAAA	3	11660	11671	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_017896	TTAA	4	11762	11776	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_017896	TA	9	11890	11906	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	38680092
37	NC_017896	TAT	4	11913	11924	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680092
38	NC_017896	AAT	4	12175	12186	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680092
39	NC_017896	AT	6	13411	13422	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_017896	TA	7	13842	13855	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38680092
41	NC_017896	AATTAT	5	13851	13879	29	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	38680092
42	NC_017896	AAT	5	14122	14135	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38680092
43	NC_017896	TA	6	15130	15140	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_017896	AGT	4	15315	15326	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_017896	ATA	4	15603	15614	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_017896	AAT	4	15649	15660	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_017896	TACT	3	15790	15801	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
48	NC_017896	TA	7	16569	16582	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_017896	ATTA	3	16964	16975	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_017896	TA	6	17029	17039	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_017896	TCA	4	17503	17514	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	38680092
52	NC_017896	GTAA	3	17593	17603	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	38680092
53	NC_017896	TAT	4	17702	17713	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680092
54	NC_017896	ACA	4	17886	17897	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	38680092
55	NC_017896	GTAAT	3	17958	17971	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	38680092
56	NC_017896	ATC	4	18496	18507	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	38680092
57	NC_017896	TTG	4	18541	18552	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	38680092
58	NC_017896	TA	7	18623	18637	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_017896	ATA	4	18810	18820	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_017896	AT	6	18854	18864	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_017896	AT	6	19257	19269	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_017896	A	13	19284	19296	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_017896	AT	8	19680	19694	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_017896	TA	6	20732	20742	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_017896	TAA	4	20834	20845	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017896	TAAA	3	21031	21041	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_017896	AT	8	21189	21203	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_017896	TA	6	21207	21217	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_017896	AGTA	3	21239	21250	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_017896	AT	7	21369	21383	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_017896	ATT	5	22490	22503	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_017896	AAT	4	22504	22515	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017896	AAAT	3	22578	22589	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017896	A	12	22974	22985	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	38680093
75	NC_017896	CAA	4	23062	23073	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	38680093
76	NC_017896	ATATAA	3	23658	23675	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	38680093
77	NC_017896	TTAA	3	23823	23834	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38680093
78	NC_017896	TA	6	24202	24213	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_017896	AT	7	24446	24458	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_017896	TA	7	25424	25439	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_017896	A	16	25591	25606	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_017896	TAA	4	25634	25644	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_017896	ATTAT	3	25862	25876	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
84	NC_017896	TAAT	3	25964	25975	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_017896	TTAA	3	26035	26045	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_017896	TAAA	3	26202	26212	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_017896	TAAA	3	26720	26730	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38680093
88	NC_017896	AATC	3	26817	26827	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	38680093
89	NC_017896	ATT	5	26917	26931	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	38680093
90	NC_017896	TTA	6	27871	27888	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	38680093
91	NC_017896	TTAT	3	27952	27963	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38680093
92	NC_017896	AAT	4	28069	28080	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680093
93	NC_017896	TGG	4	29099	29110	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	38680093
94	NC_017896	ATT	6	30214	30231	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	38680093
95	NC_017896	ACA	4	31920	31931	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	38680093
96	NC_017896	TTATAA	3	32273	32290	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	38680093
97	NC_017896	TAA	7	32311	32330	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	38680093
98	NC_017896	AAGG	3	32340	32351	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017896	AAAT	3	32437	32448	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_017896	ATA	4	32573	32583	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38680093
101	NC_017896	ATT	4	32766	32776	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38680093
102	NC_017896	TTA	4	33193	33204	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680093

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Aspergillus nidulans FGSC A4 mitochondrion