ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Samia cynthia ricini mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017869	TTTAT	3	128	142	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_017869	ATA	4	238	248	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_017869	AATT	4	966	981	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	38680048
4	NC_017869	ATT	4	1101	1112	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680048
5	NC_017869	TTTA	3	1256	1267	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38680048
6	NC_017869	GGA	4	2134	2144	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	38680048
7	NC_017869	ATT	4	2868	2880	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	38680048
8	NC_017869	AATT	3	3738	3748	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38680048
9	NC_017869	AATA	3	3880	3892	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_017869	TAT	4	3977	3988	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680048
11	NC_017869	ATT	4	4009	4019	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38680048
12	NC_017869	ATT	4	4171	4182	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680048
13	NC_017869	TTAT	3	4642	4653	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38680048
14	NC_017869	TTA	4	4905	4915	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38680048
15	NC_017869	TTA	4	5258	5269	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680048
16	NC_017869	ATT	4	5403	5414	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680048
17	NC_017869	TATTTA	3	5555	5573	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
18	NC_017869	ATTTTA	3	5640	5657	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	38680048
19	NC_017869	TAT	6	5909	5925	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	38680048
20	NC_017869	ATA	4	6127	6137	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_017869	TAAT	3	6147	6158	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_017869	TAAA	4	6436	6450	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	38680049
23	NC_017869	TAAA	3	6488	6499	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	38680049
24	NC_017869	TTTA	3	6502	6514	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	38680049
25	NC_017869	TA	7	6966	6978	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38680049
26	NC_017869	A	12	7025	7036	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	38680049
27	NC_017869	ATA	5	7418	7432	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	38680049
28	NC_017869	TAA	4	7856	7868	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38680049
29	NC_017869	ATA	4	7886	7897	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680049
30	NC_017869	AAAT	3	7898	7908	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38680049
31	NC_017869	AAAC	3	7972	7983	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	38680049
32	NC_017869	AAAT	3	8068	8080	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	38680049
33	NC_017869	ATA	4	8535	8546	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680049
34	NC_017869	ATA	4	9039	9051	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38680049
35	NC_017869	TAAA	3	9070	9080	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38680049
36	NC_017869	TATT	3	9090	9102	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	38680049
37	NC_017869	AAAT	3	9154	9164	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38680049
38	NC_017869	TAA	4	9207	9219	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38680049
39	NC_017869	AAAAT	3	9243	9256	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	38680049
40	NC_017869	ATT	4	9563	9574	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	38680049
41	NC_017869	ATA	5	9738	9751	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38680049
42	NC_017869	ATA	4	9845	9856	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680049
43	NC_017869	TTTA	3	10218	10229	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	38680049
44	NC_017869	TTTAT	3	10285	10298	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	38680049
45	NC_017869	TCTT	3	10838	10848	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	38680049
46	NC_017869	ATT	4	10928	10938	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38680049
47	NC_017869	ATTT	3	11134	11144	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38680049
48	NC_017869	ATTT	3	11163	11173	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38680049
49	NC_017869	CAAT	3	11532	11543	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	38680049
50	NC_017869	TAA	4	11562	11573	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680049
51	NC_017869	ATA	4	11841	11852	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680049
52	NC_017869	CTAAA	3	12000	12013	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	38680049
53	NC_017869	A	15	12411	12425	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	38680049
54	NC_017869	TAA	4	12450	12460	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38680049
55	NC_017869	TAAA	3	13159	13169	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_017869	TTTAA	3	13245	13259	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017869	AAAATT	3	13631	13647	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
58	NC_017869	ATTA	3	13727	13738	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017869	ATT	4	13769	13779	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_017869	AAAT	3	13821	13831	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_017869	ATTA	3	13925	13936	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017869	AATT	3	14714	14725	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_017869	ATA	4	14727	14739	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_017869	AATTT	3	14820	14834	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017869	T	22	15049	15070	22	0 %	100 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_017869	AATT	3	15128	15138	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_017869	TA	12	15257	15281	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Samia cynthia ricini mitochondrion