ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Daucus carota subsp. sativus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017855	GCAG	3	3097	3107	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
2	NC_017855	AAAG	3	3290	3300	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_017855	TGCC	3	4960	4971	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
4	NC_017855	TCGT	3	6761	6772	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	38679923
5	NC_017855	AGCG	3	7258	7268	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
6	NC_017855	ATCT	3	8246	8256	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
7	NC_017855	TTCC	3	9606	9617	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
8	NC_017855	GGGA	3	12469	12480	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_017855	GCTA	3	12701	12712	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017855	GAAA	3	15039	15050	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	38679926
11	NC_017855	GACT	3	18510	18520	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_017855	TCTG	3	18769	18780	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
13	NC_017855	AGCT	3	19750	19760	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
14	NC_017855	GCTT	3	19996	20007	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
15	NC_017855	AAGG	3	22404	22414	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_017855	TCTA	3	24563	24574	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
17	NC_017855	TCTA	3	24605	24616	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
18	NC_017855	CTTT	3	24933	24943	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
19	NC_017855	CGCC	3	25267	25278	12	0 %	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017855	CTTA	3	26034	26044	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
21	NC_017855	GTTG	3	32889	32900	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	38679930
22	NC_017855	CCAA	3	35176	35187	12	50 %	0 %	0 %	50 %	0 %	38679931
23	NC_017855	TCAT	4	36249	36264	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	38679931
24	NC_017855	GCCT	3	38015	38026	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	38679931
25	NC_017855	GATC	3	38616	38626	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	38679931
26	NC_017855	CTTT	4	40191	40206	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	38679931
27	NC_017855	ATTG	3	41329	41339	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	38679931
28	NC_017855	GGGC	3	48204	48216	13	0 %	0 %	75 %	25 %	7 %	38679931
29	NC_017855	CAAG	3	48245	48255	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	38679931
30	NC_017855	AAGC	3	48278	48288	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	38679931
31	NC_017855	GATA	3	48497	48508	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	38679931
32	NC_017855	TGGG	3	49944	49955	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	38679931
33	NC_017855	GGCC	3	54396	54407	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	38679931
34	NC_017855	GTCC	3	54971	54981	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	38679931
35	NC_017855	CTTT	3	55566	55576	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	38679931
36	NC_017855	TTGC	3	57591	57601	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	38679931
37	NC_017855	TAGA	4	57913	57928	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	38679931
38	NC_017855	CTTT	3	60614	60624	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	38679931
39	NC_017855	GCCC	3	63577	63588	12	0 %	0 %	25 %	75 %	8 %	38679931
40	NC_017855	TGAG	3	65744	65755	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	38679931
41	NC_017855	AAAG	3	66578	66589	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	38679931
42	NC_017855	CTTT	3	68000	68012	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	38679931
43	NC_017855	CTCG	3	68566	68576	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	38679931
44	NC_017855	TCTA	3	75283	75294	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	38679931
45	NC_017855	AAAG	3	78628	78638	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	38679931
46	NC_017855	CAAG	3	78773	78785	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	38679931
47	NC_017855	TAGC	4	81489	81505	17	25 %	25 %	25 %	25 %	5 %	38679931
48	NC_017855	TTTC	3	86137	86148	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	38679931
49	NC_017855	TGTT	3	87026	87036	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	38679931
50	NC_017855	CTGG	3	87846	87856	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	38679931
51	NC_017855	AAAG	3	88754	88765	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	38679931
52	NC_017855	GAAA	3	88953	88965	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	38679931
53	NC_017855	GCTT	3	89426	89436	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	38679931
54	NC_017855	GCAA	3	89582	89592	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	38679931
55	NC_017855	AAGA	3	90641	90653	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	38679931
56	NC_017855	CATT	3	93130	93140	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	38679931
57	NC_017855	ATTG	3	95014	95024	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	38679931
58	NC_017855	AACG	3	100180	100191	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	38679931
59	NC_017855	ATTT	3	102146	102157	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38679931
60	NC_017855	CATC	3	103998	104009	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	38679931
61	NC_017855	AGCG	3	104960	104970	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	38679931
62	NC_017855	TTCA	3	105253	105263	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	38679931
63	NC_017855	CTTT	3	105519	105529	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	38679931
64	NC_017855	AAGC	3	106935	106945	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	38679931
65	NC_017855	TTCT	3	108787	108799	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	38679931
66	NC_017855	AAAG	3	111275	111286	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	38679931
67	NC_017855	GGTT	3	118309	118321	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	38679931
68	NC_017855	TGAA	3	118466	118476	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	38679931
69	NC_017855	AGGG	3	121001	121011	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	38679931
70	NC_017855	AAGA	3	124392	124404	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	38679931
71	NC_017855	AAAG	3	129110	129120	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	38679931
72	NC_017855	TTCA	3	131253	131264	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	38679931
73	NC_017855	CCGC	3	132500	132511	12	0 %	0 %	25 %	75 %	8 %	38679931
74	NC_017855	GCCA	3	132542	132552	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	38679931
75	NC_017855	GGCC	3	134880	134891	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	38679931
76	NC_017855	AGAA	3	138263	138274	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	38679931
77	NC_017855	TCTT	3	139312	139322	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	38679931
78	NC_017855	TCCT	3	145411	145421	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	38679931
79	NC_017855	TCAT	3	145851	145861	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	38679931
80	NC_017855	AAAG	3	145933	145943	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	38679931
81	NC_017855	TGAT	3	148999	149010	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	38679931
82	NC_017855	GTTT	3	150049	150059	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	38679931
83	NC_017855	AGCA	3	150195	150206	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	38679931
84	NC_017855	CTTT	3	151151	151162	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	38679931
85	NC_017855	ATAG	3	151914	151924	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	38679931
86	NC_017855	ACTA	3	155422	155433	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	38679931
87	NC_017855	TAGA	3	155978	155990	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	38679931
88	NC_017855	AGAC	3	156375	156385	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	38679931
89	NC_017855	TCGC	3	157060	157071	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	38679931
90	NC_017855	TAAA	3	160055	160066	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38679931
91	NC_017855	CATA	3	160392	160403	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	38679931
92	NC_017855	TTTC	3	160633	160644	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	38679931
93	NC_017855	CCAG	3	165458	165469	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	38679931
94	NC_017855	TCGC	3	167594	167606	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	38679931
95	NC_017855	TTTC	3	168151	168161	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	38679931
96	NC_017855	TTCA	3	168979	168989	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	38679931
97	NC_017855	GCAA	4	170730	170744	15	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	38679931
98	NC_017855	AAAG	4	172173	172188	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	38679931
99	NC_017855	TTCA	3	173366	173377	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	38679931
100	NC_017855	TCTT	4	173962	173977	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	38679931
101	NC_017855	TTTG	3	177399	177409	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	38679931
102	NC_017855	TGAA	3	179255	179267	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	38679931
103	NC_017855	TCAG	3	180439	180450	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	38679931
104	NC_017855	TCAC	3	182610	182622	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	38679931
105	NC_017855	TGCC	3	183395	183405	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	38679931
106	NC_017855	AGCC	3	184298	184308	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	38679931
107	NC_017855	AAGC	3	189224	189235	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	38679931
108	NC_017855	AAAG	3	189979	189990	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	38679931
109	NC_017855	TAGT	3	190109	190120	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	38679931
110	NC_017855	TTCT	3	193656	193668	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	38679931
111	NC_017855	GGGT	3	194352	194362	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	38679931
112	NC_017855	TCTT	3	196987	196998	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	38679931
113	NC_017855	AAAG	3	206819	206830	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	38679931
114	NC_017855	GGTT	3	213853	213865	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	38679931
115	NC_017855	TGAA	3	214010	214020	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	38679931
116	NC_017855	AGGG	3	216545	216555	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	38679931
117	NC_017855	TGCT	3	220427	220438	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	38679931
118	NC_017855	CTTT	3	221205	221216	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	38679931
119	NC_017855	CAAG	3	221288	221298	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	38679931
120	NC_017855	TCAC	3	223023	223034	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	38679931
121	NC_017855	CCCA	3	223523	223533	11	25 %	0 %	0 %	75 %	9 %	38679931
122	NC_017855	AAAG	3	223773	223783	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	38679931
123	NC_017855	AGGG	3	224628	224639	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	38679931
124	NC_017855	CCAA	3	228685	228696	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	38679931
125	NC_017855	ATTG	3	231120	231130	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	38679931
126	NC_017855	AGCT	3	231563	231573	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	38679931
127	NC_017855	ACTT	3	231842	231853	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	38679931
128	NC_017855	GAAT	3	234375	234385	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	38679931
129	NC_017855	CTAG	3	238178	238188	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	38679931
130	NC_017855	ATGA	3	238280	238292	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	38679931
131	NC_017855	CCTT	3	238412	238423	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	38679931
132	NC_017855	GTTC	3	238463	238473	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	38679931
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142	NC_017855	TCAC	3	270405	270416	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
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145	NC_017855	AGGG	3	272010	272021	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
146	NC_017855	CCAA	3	276067	276078	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	38679930
147	NC_017855	ATTG	3	278502	278512	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
148	NC_017855	AGCT	3	278945	278955	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
149	NC_017855	ACTT	3	279224	279235	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Daucus carota subsp. sativus mitochondrion