Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Daucus carota subsp. sativus mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_017855CTT410781089120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
2NC_017855CTT411911201110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
3NC_017855TCT458415851110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
4NC_017855GTA4972397341233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
5NC_017855ATA417301173121266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
6NC_017855ACA419028190381166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
7NC_017855TGC41951019520110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
8NC_017855GAA423624236351266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
9NC_017855TAA424891249011166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
10NC_017855CGT42589125902120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
11NC_017855GTT42626726277110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
12NC_017855TAT429811298221233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
13NC_017855GAA432244322561366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
14NC_017855AGC440102401121133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %38679931
15NC_017855AAG442049420601266.67 %0 %33.33 %0 %8 %38679931
16NC_017855GAA542356423691466.67 %0 %33.33 %0 %7 %38679931
17NC_017855ATC445869458791133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %38679931
18NC_017855ATT449650496621333.33 %66.67 %0 %0 %7 %38679931
19NC_017855CTC45038150391110 %33.33 %0 %66.67 %9 %38679931
20NC_017855ATC451532515421133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %38679931
21NC_017855AAG456503565131166.67 %0 %33.33 %0 %9 %38679931
22NC_017855TGC45896058971120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %38679931
23NC_017855GGT45974359755130 %33.33 %66.67 %0 %7 %38679931
24NC_017855CTA460242602531233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %38679931
25NC_017855ACG461029610411333.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %38679931
26NC_017855TTA461747617581233.33 %66.67 %0 %0 %8 %38679931
27NC_017855TCT56471464727140 %66.67 %0 %33.33 %7 %38679931
28NC_017855CAG475580755911233.33 %0 %33.33 %33.33 %0 %38679931
29NC_017855TGG47579175802120 %33.33 %66.67 %0 %8 %38679931
30NC_017855GAT476135761471333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %38679931
31NC_017855TAA482596826071266.67 %33.33 %0 %0 %8 %38679931
32NC_017855ACT483570835801133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %38679931
33NC_017855AGC486813868231133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %38679931
34NC_017855AGA491398914101366.67 %0 %33.33 %0 %7 %38679931
35NC_017855ACC492671926831333.33 %0 %0 %66.67 %7 %38679931
36NC_017855AAG495734957451266.67 %0 %33.33 %0 %8 %38679931
37NC_017855GAA596041960541466.67 %0 %33.33 %0 %7 %38679931
38NC_017855CGG4100157100168120 %0 %66.67 %33.33 %8 %38679931
39NC_017855CTT4102669102680120 %66.67 %0 %33.33 %8 %38679931
40NC_017855AGA41039671039781266.67 %0 %33.33 %0 %8 %38679931
41NC_017855CTC4104198104209120 %33.33 %0 %66.67 %8 %38679931
42NC_017855TTC4108704108714110 %66.67 %0 %33.33 %9 %38679931
43NC_017855TAT51089071089221633.33 %66.67 %0 %0 %6 %38679931
44NC_017855GTT4112196112207120 %66.67 %33.33 %0 %8 %38679931
45NC_017855GAA41136091136201266.67 %0 %33.33 %0 %0 %38679931
46NC_017855ACG41208731208841233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %38679931
47NC_017855CTT5125126125140150 %66.67 %0 %33.33 %6 %38679931
48NC_017855GTC4125170125181120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %38679931
49NC_017855ATA41253301253421366.67 %33.33 %0 %0 %7 %38679931
50NC_017855GCG4126707126718120 %0 %66.67 %33.33 %8 %38679931
51NC_017855ATT41292271292391333.33 %66.67 %0 %0 %7 %38679931
52NC_017855AGT41295701295811233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %38679931
53NC_017855TGT4130109130120120 %66.67 %33.33 %0 %8 %38679931
54NC_017855GAA51320461320591466.67 %0 %33.33 %0 %7 %38679931
55NC_017855CTT4132216132227120 %66.67 %0 %33.33 %8 %38679931
56NC_017855TTA41334181334291233.33 %66.67 %0 %0 %8 %38679931
57NC_017855GAA41383081383201366.67 %0 %33.33 %0 %7 %38679931
58NC_017855TCT4138743138753110 %66.67 %0 %33.33 %9 %38679931
59NC_017855AGA41427951428051166.67 %0 %33.33 %0 %9 %38679931
60NC_017855GAA51438181438321566.67 %0 %33.33 %0 %6 %38679931
61NC_017855TAA71469321469532266.67 %33.33 %0 %0 %4 %38679931
62NC_017855TTG4149415149426120 %66.67 %33.33 %0 %8 %38679931
63NC_017855CTA41511881512001333.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %38679931
64NC_017855AGA51526351526491566.67 %0 %33.33 %0 %6 %38679931
65NC_017855AGG41526501526611233.33 %0 %66.67 %0 %8 %38679931
66NC_017855GTA41541211541311133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %38679931
67NC_017855TTG4154378154389120 %66.67 %33.33 %0 %8 %38679931
68NC_017855TAA51600361600501566.67 %33.33 %0 %0 %6 %38679931
69NC_017855TAA41659331659441266.67 %33.33 %0 %0 %0 %38679931
70NC_017855TAA41659541659651266.67 %33.33 %0 %0 %8 %38679931
71NC_017855TGC4166267166278120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %38679931
72NC_017855CGC4171257171267110 %0 %33.33 %66.67 %9 %38679931
73NC_017855TAA41715571715671166.67 %33.33 %0 %0 %9 %38679931
74NC_017855GCG4175981175993130 %0 %66.67 %33.33 %7 %38679931
75NC_017855TCT4177041177052120 %66.67 %0 %33.33 %8 %38679931
76NC_017855CTA41783551783651133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %38679931
77NC_017855TAT41789791789891133.33 %66.67 %0 %0 %9 %38679931
78NC_017855TTA51797921798061533.33 %66.67 %0 %0 %6 %38679931
79NC_017855GAT41801671801771133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %38679931
80NC_017855AGG41823801823911233.33 %0 %66.67 %0 %8 %38679931
81NC_017855AGA41832801832911266.67 %0 %33.33 %0 %8 %38679931
82NC_017855CTT4184045184056120 %66.67 %0 %33.33 %8 %38679931
83NC_017855CTT4184522184532110 %66.67 %0 %33.33 %9 %38679931
84NC_017855AGA81845821846052466.67 %0 %33.33 %0 %8 %38679931
85NC_017855AGA41864021864131266.67 %0 %33.33 %0 %8 %38679931
86NC_017855TGA41864861864971233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %38679931
87NC_017855TCT4187447187458120 %66.67 %0 %33.33 %8 %38679931
88NC_017855TCA41882631882741233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %38679931
89NC_017855GAT51885681885821533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %38679931
90NC_017855TTA41930201930321333.33 %66.67 %0 %0 %7 %38679931
91NC_017855TCT5193427193441150 %66.67 %0 %33.33 %6 %38679931
92NC_017855TGC4194793194803110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %38679931
93NC_017855TAG41959881959981133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %38679931
94NC_017855CTT4196362196373120 %66.67 %0 %33.33 %8 %38679931
95NC_017855CTT4201479201489110 %66.67 %0 %33.33 %9 %38679931
96NC_017855TAT52044512044661633.33 %66.67 %0 %0 %6 %38679931
97NC_017855GTT4207740207751120 %66.67 %33.33 %0 %8 %38679931
98NC_017855GAA42091532091641266.67 %0 %33.33 %0 %0 %38679931
99NC_017855ACG42164172164281233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %38679931
100NC_017855TTA42204922205031233.33 %66.67 %0 %0 %8 %38679931
101NC_017855CTT4223657223667110 %66.67 %0 %33.33 %9 %38679931
102NC_017855GCA42341462341561133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %38679931
103NC_017855AGA42401832401951366.67 %0 %33.33 %0 %7 %38679931
104NC_017855AGA42435882435991266.67 %0 %33.33 %0 %8 %38679931
105NC_017855CTT4248861248871110 %66.67 %0 %33.33 %9 %38679931
106NC_017855TAT52518332518481633.33 %66.67 %0 %0 %6 %38679931
107NC_017855GTT4255122255133120 %66.67 %33.33 %0 %8 %38679931
108NC_017855GAA42565352565461266.67 %0 %33.33 %0 %0 %38679931
109NC_017855ACG42637992638101233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %38679931
110NC_017855TTA42678742678851233.33 %66.67 %0 %0 %8 %38679931
111NC_017855CTT4271039271049110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding