ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Daucus carota subsp. sativus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017855	CTT	4	1078	1089	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_017855	CTT	4	1191	1201	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
3	NC_017855	AGAATC	3	2593	2610	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
4	NC_017855	GCAG	3	3097	3107	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
5	NC_017855	AAAG	3	3290	3300	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_017855	T	14	4094	4107	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_017855	ACTCA	3	4631	4644	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
8	NC_017855	TGCC	3	4960	4971	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
9	NC_017855	TCT	4	5841	5851	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
10	NC_017855	TCGT	3	6761	6772	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	38679923
11	NC_017855	AGCG	3	7258	7268	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_017855	ATCT	3	8246	8256	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
13	NC_017855	TA	8	9486	9502	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
14	NC_017855	TTCC	3	9606	9617	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
15	NC_017855	GTA	4	9723	9734	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_017855	TTCCT	4	9765	9783	19	0 %	60 %	0 %	40 %	5 %	Non-Coding
17	NC_017855	GGGAGA	3	11301	11319	19	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
18	NC_017855	TC	6	12363	12373	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
19	NC_017855	GGGA	3	12469	12480	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_017855	GCTA	3	12701	12712	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017855	TTCTA	3	14621	14635	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
22	NC_017855	GAAA	3	15039	15050	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	38679926
23	NC_017855	ATA	4	17301	17312	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_017855	AT	6	18209	18219	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_017855	A	15	18271	18285	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_017855	GACT	3	18510	18520	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
27	NC_017855	TCTG	3	18769	18780	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
28	NC_017855	ACA	4	19028	19038	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
29	NC_017855	TGC	4	19510	19520	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
30	NC_017855	AGCT	3	19750	19760	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
31	NC_017855	GCTT	3	19996	20007	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
32	NC_017855	AAGG	3	22404	22414	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_017855	GAA	4	23624	23635	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_017855	GAGCTG	3	23706	23723	18	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
35	NC_017855	TCTA	3	24563	24574	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
36	NC_017855	TCTA	3	24605	24616	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
37	NC_017855	TAA	4	24891	24901	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_017855	CTTT	3	24933	24943	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
39	NC_017855	CGCC	3	25267	25278	12	0 %	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017855	CGT	4	25891	25902	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_017855	CTTA	3	26034	26044	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
42	NC_017855	GTT	4	26267	26277	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_017855	TAT	4	29811	29822	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_017855	TA	6	29843	29853	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_017855	GAA	4	32244	32256	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_017855	GTTG	3	32889	32900	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	38679930
47	NC_017855	CCAA	3	35176	35187	12	50 %	0 %	0 %	50 %	0 %	38679931
48	NC_017855	TCAT	4	36249	36264	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	38679931
49	NC_017855	ACTAG	3	36867	36881	15	40 %	20 %	20 %	20 %	0 %	38679931
50	NC_017855	GCCT	3	38015	38026	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	38679931
51	NC_017855	GATC	3	38616	38626	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	38679931
52	NC_017855	AG	6	39955	39965	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	38679931
53	NC_017855	AGC	4	40102	40112	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	38679931
54	NC_017855	CTTT	4	40191	40206	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	38679931
55	NC_017855	ATTG	3	41329	41339	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	38679931
56	NC_017855	AAG	4	42049	42060	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	38679931
57	NC_017855	GAA	5	42356	42369	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	38679931
58	NC_017855	ATC	4	45869	45879	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	38679931
59	NC_017855	A	14	47796	47809	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	38679931
60	NC_017855	GGGC	3	48204	48216	13	0 %	0 %	75 %	25 %	7 %	38679931
61	NC_017855	CAAG	3	48245	48255	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	38679931
62	NC_017855	AAGC	3	48278	48288	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	38679931
63	NC_017855	GATA	3	48497	48508	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	38679931
64	NC_017855	ATT	4	49650	49662	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	38679931
65	NC_017855	TGGG	3	49944	49955	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	38679931
66	NC_017855	CTC	4	50381	50391	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	38679931
67	NC_017855	GAGAT	3	50809	50822	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	38679931
68	NC_017855	ATC	4	51532	51542	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	38679931
69	NC_017855	TGGGC	3	53046	53059	14	0 %	20 %	60 %	20 %	7 %	38679931
70	NC_017855	C	13	53988	54000	13	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	38679931
71	NC_017855	GGCC	3	54396	54407	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	38679931
72	NC_017855	GTCC	3	54971	54981	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	38679931
73	NC_017855	CTTT	3	55566	55576	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	38679931
74	NC_017855	AAG	4	56503	56513	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	38679931
75	NC_017855	TTGC	3	57591	57601	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	38679931
76	NC_017855	TAGA	4	57913	57928	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	38679931
77	NC_017855	TGC	4	58960	58971	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	38679931
78	NC_017855	TA	6	59289	59299	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38679931
79	NC_017855	GGT	4	59743	59755	13	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	38679931
80	NC_017855	TC	7	60158	60171	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	38679931
81	NC_017855	CTA	4	60242	60253	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	38679931
82	NC_017855	CTTT	3	60614	60624	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	38679931
83	NC_017855	ACG	4	61029	61041	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	38679931
84	NC_017855	TTA	4	61747	61758	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38679931
85	NC_017855	GCCC	3	63577	63588	12	0 %	0 %	25 %	75 %	8 %	38679931
86	NC_017855	TCT	5	64714	64727	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	38679931
87	NC_017855	TGAG	3	65744	65755	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	38679931
88	NC_017855	TA	6	65968	65979	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38679931
89	NC_017855	AAAG	3	66578	66589	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	38679931
90	NC_017855	ATTCCT	3	67726	67743	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	38679931
91	NC_017855	CTTT	3	68000	68012	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	38679931
92	NC_017855	CTCG	3	68566	68576	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	38679931
93	NC_017855	CT	7	72931	72944	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	38679931
94	NC_017855	TCTA	3	75283	75294	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	38679931
95	NC_017855	CAG	4	75580	75591	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38679931
96	NC_017855	TGG	4	75791	75802	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	38679931
97	NC_017855	GAT	4	76135	76147	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	38679931
98	NC_017855	TCTCTT	3	78411	78427	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	38679931
99	NC_017855	AAAG	3	78628	78638	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	38679931
100	NC_017855	CAAG	3	78773	78785	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	38679931
101	NC_017855	AG	6	79287	79298	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	38679931
102	NC_017855	TAGC	4	81489	81505	17	25 %	25 %	25 %	25 %	5 %	38679931
103	NC_017855	TAA	4	82596	82607	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38679931
104	NC_017855	ACT	4	83570	83580	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	38679931
105	NC_017855	CCGTC	3	83650	83663	14	0 %	20 %	20 %	60 %	7 %	38679931
106	NC_017855	TTTC	3	86137	86148	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	38679931
107	NC_017855	CCTTTC	3	86182	86199	18	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	38679931
108	NC_017855	AGAAA	3	86790	86804	15	80 %	0 %	20 %	0 %	0 %	38679931
109	NC_017855	AGC	4	86813	86823	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	38679931
110	NC_017855	TGTT	3	87026	87036	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	38679931
111	NC_017855	AG	6	87786	87797	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	38679931
112	NC_017855	CTGG	3	87846	87856	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	38679931
113	NC_017855	AAAG	3	88754	88765	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	38679931
114	NC_017855	GAAA	3	88953	88965	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	38679931
115	NC_017855	GCTT	3	89426	89436	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	38679931
116	NC_017855	GCAA	3	89582	89592	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	38679931
117	NC_017855	AAGA	3	90641	90653	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	38679931
118	NC_017855	AGA	4	91398	91410	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	38679931
119	NC_017855	ACC	4	92671	92683	13	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	7 %	38679931
120	NC_017855	CATT	3	93130	93140	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	38679931
121	NC_017855	ATTG	3	95014	95024	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	38679931
122	NC_017855	AAG	4	95734	95745	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	38679931
123	NC_017855	GAA	5	96041	96054	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	38679931
124	NC_017855	CGG	4	100157	100168	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	38679931
125	NC_017855	AACG	3	100180	100191	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	38679931
126	NC_017855	ATTT	3	102146	102157	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38679931
127	NC_017855	CTT	4	102669	102680	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	38679931
128	NC_017855	AGA	4	103967	103978	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	38679931
129	NC_017855	CATC	3	103998	104009	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	38679931
130	NC_017855	CTC	4	104198	104209	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	38679931
131	NC_017855	AGCG	3	104960	104970	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	38679931
132	NC_017855	TTCA	3	105253	105263	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	38679931
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Daucus carota subsp. sativus mitochondrion