ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cordyceps bassiana mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017842	AT	6	136	146	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_017842	GAAA	3	879	890	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_017842	TAT	4	2789	2801	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_017842	TGAA	3	2956	2966	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	38584316
5	NC_017842	AT	6	2970	2980	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38584316
6	NC_017842	TTATTT	3	3049	3066	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	38584316
7	NC_017842	ATA	4	3081	3092	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38584316
8	NC_017842	TTTAC	3	3203	3216	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	38584316
9	NC_017842	AAT	4	3314	3324	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38584316
10	NC_017842	TTAGC	3	3357	3370	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	38584316
11	NC_017842	AT	7	4253	4268	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_017842	AAAG	3	4342	4353	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_017842	TA	6	5049	5060	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_017842	AT	8	5642	5658	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
15	NC_017842	ATAAA	3	5947	5961	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_017842	ATA	4	6140	6151	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017842	ATA	4	6154	6165	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_017842	AAAC	3	6281	6293	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
19	NC_017842	ATATTA	3	7812	7829	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	38584316
20	NC_017842	TTAT	3	8201	8212	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38584316
21	NC_017842	ATA	4	8506	8517	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38584316
22	NC_017842	TAT	4	8611	8625	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	38584316
23	NC_017842	AT	6	8788	8798	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38584316
24	NC_017842	TAT	4	8961	8973	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	38584316
25	NC_017842	TAT	5	9383	9397	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_017842	AGCAGG	3	9457	9474	18	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	5 %	38584316
27	NC_017842	ATT	4	9607	9618	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	38584316
28	NC_017842	AT	6	10149	10159	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38584316
29	NC_017842	ATA	4	10924	10936	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38584316
30	NC_017842	ATT	4	11158	11168	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38584316
31	NC_017842	ATGA	3	11175	11187	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	38584316
32	NC_017842	ATTA	4	11776	11791	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017842	TA	6	11960	11970	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38584316
34	NC_017842	TAA	4	12327	12338	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38584316
35	NC_017842	TTTA	3	12401	12412	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38584316
36	NC_017842	TAT	4	12879	12890	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38584316
37	NC_017842	ATT	4	13072	13083	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38584316
38	NC_017842	AGT	4	13277	13287	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	38584316
39	NC_017842	AT	6	13693	13703	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38584316
40	NC_017842	TA	6	13911	13921	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38584316
41	NC_017842	TCTA	3	13935	13946	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	38584316
42	NC_017842	CTTT	3	14464	14474	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	38584316
43	NC_017842	ATT	4	14617	14628	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38584316
44	NC_017842	ATAAA	3	14710	14723	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	38584316
45	NC_017842	AATT	3	15055	15066	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38584316
46	NC_017842	TAT	4	15512	15523	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38584316
47	NC_017842	AAGT	3	15532	15542	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	38584316
48	NC_017842	AT	13	15640	15663	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38584316
49	NC_017842	TAT	4	16445	16456	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38584316
50	NC_017842	TTAA	3	16610	16621	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38584316
51	NC_017842	TAT	5	17360	17374	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	38584317
52	NC_017842	TAT	7	17612	17632	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38584317
53	NC_017842	AAT	4	18316	18327	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38584317
54	NC_017842	TTTA	3	18631	18643	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	38584317
55	NC_017842	AATA	3	19275	19286	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38584317
56	NC_017842	ATT	4	19541	19553	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	38584317
57	NC_017842	TAA	4	19989	20000	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_017842	AGTATA	3	21174	21191	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
59	NC_017842	ATT	4	21266	21276	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_017842	AT	6	21541	21551	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_017842	TAT	4	21577	21588	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_017842	T	16	21721	21736	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_017842	TAG	4	21824	21835	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	38584317
64	NC_017842	ATT	8	22236	22260	25	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38584317
65	NC_017842	TAAA	3	22879	22889	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38584317
66	NC_017842	AAAT	4	23273	23288	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	38584317
67	NC_017842	TAA	4	23407	23419	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38584317
68	NC_017842	TA	6	23422	23433	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38584317
69	NC_017842	ATTT	4	23616	23632	17	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	38584317
70	NC_017842	TTA	4	24832	24843	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38584317
71	NC_017842	AT	7	25773	25787	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_017842	TA	6	25906	25916	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38584317
73	NC_017842	ATA	4	25975	25987	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38584317
74	NC_017842	TAAA	3	26029	26039	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_017842	AT	6	26064	26074	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_017842	TAA	4	26278	26289	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38584317
77	NC_017842	TAA	4	27091	27102	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_017842	AT	7	27877	27889	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_017842	AATG	3	28161	28171	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_017842	TAAA	3	28764	28775	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_017842	TAT	4	28790	28802	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_017842	TTA	4	29810	29820	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38584317
83	NC_017842	TA	6	30570	30580	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38584317
84	NC_017842	TTTTAT	3	30594	30611	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	38584317
85	NC_017842	ATA	4	30774	30784	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38584317
86	NC_017842	TAT	4	30936	30947	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38584317
87	NC_017842	ATA	5	30962	30976	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	38584317
88	NC_017842	TAGC	3	31160	31172	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding

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