ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Spirodela polyrhiza mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017840	TC	6	5736	5747	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
2	NC_017840	AT	8	10611	10626	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	38716470
3	NC_017840	CT	7	12674	12686	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	38716470
4	NC_017840	TC	6	19663	19673	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	38716470
5	NC_017840	TA	6	31462	31472	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38716470
6	NC_017840	CA	6	36125	36136	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	38716470
7	NC_017840	TC	6	51428	51439	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
8	NC_017840	TA	7	52048	52062	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_017840	TA	6	52081	52093	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_017840	TA	7	61149	61162	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38716470
11	NC_017840	AG	6	73756	73766	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	38716470
12	NC_017840	AG	7	74114	74126	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	38716470
13	NC_017840	AT	6	89653	89664	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38716470
14	NC_017840	TC	6	91200	91211	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	38716470
15	NC_017840	TC	6	98825	98835	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	38716470
16	NC_017840	TA	7	105452	105464	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38716472
17	NC_017840	TA	7	105475	105487	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38716472
18	NC_017840	TC	6	110513	110523	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	38716472
19	NC_017840	AG	6	111258	111268	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	38716472
20	NC_017840	AG	6	114313	114323	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	38716472
21	NC_017840	TA	6	115407	115417	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38716472
22	NC_017840	CG	6	116864	116874	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	38716472
23	NC_017840	AG	6	124412	124423	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	38716472
24	NC_017840	TA	6	124529	124539	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38716472
25	NC_017840	GA	6	142948	142958	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	38716472
26	NC_017840	AT	6	143832	143842	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38716472
27	NC_017840	TC	6	144727	144737	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	38716472
28	NC_017840	AT	6	146473	146483	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38716472
29	NC_017840	AT	9	152943	152959	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	38716472
30	NC_017840	GT	6	158508	158518	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	38716472
31	NC_017840	AC	8	159972	159986	15	50 %	0 %	0 %	50 %	6 %	38716472
32	NC_017840	CT	6	175965	175976	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	38716472
33	NC_017840	CA	6	182621	182632	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	38716472
34	NC_017840	AT	6	188152	188162	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_017840	TA	11	191016	191036	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_017840	AT	6	191048	191059	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_017840	AG	8	205523	205537	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_017840	TA	6	209079	209089	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_017840	GT	6	209329	209340	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_017840	TC	6	211422	211432	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
41	NC_017840	TA	6	212854	212864	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_017840	AT	7	228065	228079	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Spirodela polyrhiza mitochondrion