Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Spirodela polyrhiza mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_017840TAT4217521861233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
2NC_017840CTT436293641130 %66.67 %0 %33.33 %7 %38716469
3NC_017840CTT587268739140 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
4NC_017840GGT492799290120 %33.33 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
5NC_017840GTA410409104191133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %38716470
6NC_017840CGC41233512345110 %0 %33.33 %66.67 %9 %38716470
7NC_017840TCT41240612416110 %66.67 %0 %33.33 %9 %38716470
8NC_017840GAA420259202701266.67 %0 %33.33 %0 %0 %38716470
9NC_017840TCT42090920920120 %66.67 %0 %33.33 %8 %38716470
10NC_017840GCC43018630196110 %0 %33.33 %66.67 %9 %38716470
11NC_017840GCA531791318061633.33 %0 %33.33 %33.33 %6 %38716470
12NC_017840TGT43222732240140 %66.67 %33.33 %0 %7 %38716470
13NC_017840CGT43352233532110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %38716470
14NC_017840ATG434658346681133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %38716470
15NC_017840AGA440225402361266.67 %0 %33.33 %0 %8 %38716470
16NC_017840TAA740421404412166.67 %33.33 %0 %0 %9 %38716470
17NC_017840TTA441631416411133.33 %66.67 %0 %0 %9 %38716470
18NC_017840TTG44288242893120 %66.67 %33.33 %0 %8 %38716470
19NC_017840AAG445101451121266.67 %0 %33.33 %0 %8 %38716470
20NC_017840GCA447717477281233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %38716470
21NC_017840CGG44784347854120 %0 %66.67 %33.33 %8 %38716470
22NC_017840ACT450114501251233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
23NC_017840AAT450229502401266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
24NC_017840TAA459925599351166.67 %33.33 %0 %0 %9 %38716470
25NC_017840GAA561354613671466.67 %0 %33.33 %0 %7 %38716470
26NC_017840GAA461835618471366.67 %0 %33.33 %0 %7 %38716470
27NC_017840TAA567858678711466.67 %33.33 %0 %0 %7 %38716470
28NC_017840GAC471766717761133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %38716470
29NC_017840GAT572916729291433.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %38716470
30NC_017840AGC473452734631233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %38716470
31NC_017840AGA476634766451266.67 %0 %33.33 %0 %8 %38716470
32NC_017840ATT477148771591233.33 %66.67 %0 %0 %8 %38716470
33NC_017840ATG477357773671133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %38716470
34NC_017840AAC486721867321266.67 %0 %0 %33.33 %8 %38716470
35NC_017840CTA488796888061133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %38716470
36NC_017840CCT48976589775110 %33.33 %0 %66.67 %9 %38716470
37NC_017840AGA492702927121166.67 %0 %33.33 %0 %9 %38716470
38NC_017840GAA492955929661266.67 %0 %33.33 %0 %8 %38716470
39NC_017840TAG497444974541133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %38716470
40NC_017840TCT49987699887120 %66.67 %0 %33.33 %8 %38716470
41NC_017840TTC4100369100380120 %66.67 %0 %33.33 %8 %38716470
42NC_017840AAG41020411020511166.67 %0 %33.33 %0 %9 %38716470
43NC_017840CGA41029201029311233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %38716470
44NC_017840GCC4103442103453120 %0 %33.33 %66.67 %8 %38716470
45NC_017840AAT41049371049481266.67 %33.33 %0 %0 %8 %38716470
46NC_017840CAA41059871059981266.67 %0 %0 %33.33 %8 %38716472
47NC_017840TCT5107726107739140 %66.67 %0 %33.33 %7 %38716472
48NC_017840TCA41085181085291233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %38716472
49NC_017840ATA41124801124911266.67 %33.33 %0 %0 %8 %38716472
50NC_017840GAA41141001141111266.67 %0 %33.33 %0 %8 %38716472
51NC_017840GAG41157121157231233.33 %0 %66.67 %0 %8 %38716472
52NC_017840TTC6117855117872180 %66.67 %0 %33.33 %5 %38716472
53NC_017840CTT4118136118146110 %66.67 %0 %33.33 %9 %38716472
54NC_017840GAT41194091194191133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %38716472
55NC_017840ATA41208111208221266.67 %33.33 %0 %0 %8 %38716472
56NC_017840TAA41220121220231266.67 %33.33 %0 %0 %8 %38716472
57NC_017840TAT41232561232671233.33 %66.67 %0 %0 %8 %38716472
58NC_017840ACG41260041260151233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %38716472
59NC_017840GGT4126058126068110 %33.33 %66.67 %0 %9 %38716472
60NC_017840AGT41276971277071133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %38716472
61NC_017840CTT5129070129083140 %66.67 %0 %33.33 %7 %38716472
62NC_017840AGA41400991401091166.67 %0 %33.33 %0 %9 %38716472
63NC_017840AAG41434831434941266.67 %0 %33.33 %0 %8 %38716472
64NC_017840ATA41439781439881166.67 %33.33 %0 %0 %9 %38716472
65NC_017840AAG41444431444551366.67 %0 %33.33 %0 %7 %38716472
66NC_017840TGC4144690144701120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %38716472
67NC_017840GCT5146801146814140 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %38716472
68NC_017840CAG41511161511271233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %38716472
69NC_017840TAG41521111521221233.33 %33.33 %33.33 %0 %0 %38716472
70NC_017840TTC4153605153616120 %66.67 %0 %33.33 %8 %38716472
71NC_017840AGA41536321536441366.67 %0 %33.33 %0 %7 %38716472
72NC_017840ATC41554491554591133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %38716472
73NC_017840ACT41566011566121233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %38716472
74NC_017840GAA41607901608011266.67 %0 %33.33 %0 %8 %38716472
75NC_017840ACC41662981663091233.33 %0 %0 %66.67 %8 %38716472
76NC_017840AGA41670821670941366.67 %0 %33.33 %0 %7 %38716472
77NC_017840AAC41701371701481266.67 %0 %0 %33.33 %8 %38716472
78NC_017840GAA41707851707961266.67 %0 %33.33 %0 %8 %38716472
79NC_017840AAG41887481887591266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
80NC_017840GTC4194638194649120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %38716472
81NC_017840GAA41960381960491266.67 %0 %33.33 %0 %8 %38716472
82NC_017840CTT4206762206774130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
83NC_017840TTA42076522076631233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
84NC_017840GGT4209385209395110 %33.33 %66.67 %0 %9 %Non-Coding
85NC_017840AGA42131782131881166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
86NC_017840GAA42138382138501366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
87NC_017840TAT42158502158621333.33 %66.67 %0 %0 %7 %38716472
88NC_017840AAC42167352167461266.67 %0 %0 %33.33 %8 %38716472
89NC_017840CAT42194102194201133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
90NC_017840AGA42210752210871366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
91NC_017840GTA42216192216291133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %38716472
92NC_017840TTG4221862221873120 %66.67 %33.33 %0 %8 %38716472
93NC_017840TCC4222103222114120 %33.33 %0 %66.67 %8 %38716472
94NC_017840AGA42225992226101266.67 %0 %33.33 %0 %8 %38716472
95NC_017840CTT4223804223816130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
96NC_017840GAA42271642271751266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
97NC_017840ACT42278782278891233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
98NC_017840GAT42279262279371233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding