ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Spirodela polyrhiza mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017840	ACTG	3	5308	5319	12	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017840	AT	6	10611	10622	12	50 %	50 %	0 %	0 %	38716470
3	NC_017840	AGAT	3	12557	12568	12	50 %	25 %	25 %	0 %	38716470
4	NC_017840	TTTC	3	13496	13507	12	0 %	75 %	0 %	25 %	38716470
5	NC_017840	GGAA	3	18147	18158	12	50 %	0 %	50 %	0 %	38716470
6	NC_017840	GAA	4	20259	20270	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38716470
7	NC_017840	GCTT	3	23318	23329	12	0 %	50 %	25 %	25 %	38716470
8	NC_017840	ATAG	3	30598	30609	12	50 %	25 %	25 %	0 %	38716470
9	NC_017840	GCA	4	31795	31806	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38716470
10	NC_017840	TGT	4	32229	32240	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38716470
11	NC_017840	TAA	4	40424	40435	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38716470
12	NC_017840	TA	6	52048	52059	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017840	CAGG	3	54866	54877	12	25 %	0 %	50 %	25 %	38716470
14	NC_017840	GCCG	3	57025	57036	12	0 %	0 %	50 %	50 %	38716470
15	NC_017840	GATCA	3	58099	58113	15	40 %	20 %	20 %	20 %	38716470
16	NC_017840	T	12	71434	71445	12	0 %	100 %	0 %	0 %	38716470
17	NC_017840	TGTC	3	74811	74822	12	0 %	50 %	25 %	25 %	38716470
18	NC_017840	AGAT	3	80120	80131	12	50 %	25 %	25 %	0 %	38716470
19	NC_017840	TTGT	3	96286	96297	12	0 %	75 %	25 %	0 %	38716470
20	NC_017840	AGTA	3	98068	98079	12	50 %	25 %	25 %	0 %	38716470
21	NC_017840	TTTC	3	102956	102967	12	0 %	75 %	0 %	25 %	38716470
22	NC_017840	ACAA	3	105713	105724	12	75 %	0 %	0 %	25 %	38716472
23	NC_017840	TTC	4	117855	117866	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38716472
24	NC_017840	AAGA	3	128407	128418	12	75 %	0 %	25 %	0 %	38716472
25	NC_017840	CTT	4	129070	129081	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38716472
26	NC_017840	TTTA	3	142669	142680	12	25 %	75 %	0 %	0 %	38716472
27	NC_017840	GCT	4	146801	146812	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38716472
28	NC_017840	ATATT	3	150256	150270	15	40 %	60 %	0 %	0 %	38716472
29	NC_017840	A	12	150313	150324	12	100 %	0 %	0 %	0 %	38716472
30	NC_017840	TAG	4	152111	152122	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38716472
31	NC_017840	AT	7	152943	152956	14	50 %	50 %	0 %	0 %	38716472
32	NC_017840	TCCT	3	153585	153596	12	0 %	50 %	0 %	50 %	38716472
33	NC_017840	ACAA	3	154324	154335	12	75 %	0 %	0 %	25 %	38716472
34	NC_017840	TCAT	3	156265	156276	12	25 %	50 %	0 %	25 %	38716472
35	NC_017840	AC	6	159972	159983	12	50 %	0 %	0 %	50 %	38716472
36	NC_017840	TTTC	3	179066	179077	12	0 %	75 %	0 %	25 %	38716472
37	NC_017840	TTTC	3	183264	183275	12	0 %	75 %	0 %	25 %	38716472
38	NC_017840	G	14	198140	198153	14	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017840	CTAT	3	200737	200748	12	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017840	TCCAT	3	201062	201076	15	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017840	GATA	3	204574	204585	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017840	AG	6	205523	205534	12	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017840	AATC	3	212494	212505	12	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017840	CATT	3	215984	215995	12	25 %	50 %	0 %	25 %	38716472
45	NC_017840	GGCC	3	222440	222451	12	0 %	0 %	50 %	50 %	38716472
46	NC_017840	TCGC	3	224671	224682	12	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017840	G	14	226344	226357	14	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017840	AT	6	228065	228076	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Spirodela polyrhiza mitochondrion