ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pyropia yezoensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017837	TAAGC	3	1007	1021	15	40 %	20 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
2	NC_017837	AAAG	3	2315	2327	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	38680039
3	NC_017837	AATA	3	3250	3261	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38680039
4	NC_017837	TATC	3	3817	3828	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
5	NC_017837	GAAA	3	4430	4440	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_017837	TTTA	3	7305	7315	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_017837	TAA	4	11704	11714	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38680040
8	NC_017837	ATATT	3	12126	12140	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	38680040
9	NC_017837	A	13	12776	12788	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	38680040
10	NC_017837	TTCTGC	3	12887	12904	18	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	5 %	38680040
11	NC_017837	ATA	4	13039	13049	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38680040
12	NC_017837	TAAA	3	13295	13306	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38680040
13	NC_017837	ATAA	3	13657	13667	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38680040
14	NC_017837	ATAA	3	14947	14958	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38680040
15	NC_017837	TATAA	3	15043	15056	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	38680040
16	NC_017837	TAA	4	15072	15083	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680040
17	NC_017837	AAT	4	15664	15675	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680040
18	NC_017837	TGGC	3	16468	16479	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	38680040
19	NC_017837	ATA	4	16772	16782	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38680040
20	NC_017837	ACAT	3	17825	17836	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	38680040
21	NC_017837	TTG	4	18581	18592	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	38680040
22	NC_017837	AAT	4	19611	19622	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680041
23	NC_017837	TTA	4	20475	20485	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38680041
24	NC_017837	ATA	5	21118	21132	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	38680041
25	NC_017837	TTTA	3	21605	21615	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_017837	AAAATA	3	21677	21693	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
27	NC_017837	ACTA	3	22487	22497	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	38680041
28	NC_017837	TCAA	3	24396	24407	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	38680041
29	NC_017837	TA	7	31394	31407	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_017837	ATGGA	3	32421	32435	15	40 %	20 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017837	ATT	4	32999	33009	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_017837	ATTA	3	33093	33104	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_017837	AAT	4	33997	34008	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_017837	CTTA	3	35802	35812	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
35	NC_017837	AAAT	3	35845	35855	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38680042
36	NC_017837	ATT	4	37131	37141	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_017837	AGT	4	38006	38016	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	38680042
38	NC_017837	A	13	38195	38207	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	38680042
39	NC_017837	AT	6	39825	39838	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_017837	ATA	4	39926	39937	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_017837	AAT	4	41461	41472	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680042

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Pyropia yezoensis mitochondrion