ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cyanophora paradoxa mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017836	TTA	4	260	270	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_017836	ATA	4	1167	1179	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_017836	AAT	4	5555	5565	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38680035
4	NC_017836	TAT	4	7932	7943	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680035
5	NC_017836	TAA	4	8784	8795	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680035
6	NC_017836	TAA	4	9327	9338	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_017836	ATT	4	13139	13149	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38680036
8	NC_017836	ATT	5	14526	14539	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	38680036
9	NC_017836	ATT	4	16468	16479	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680036
10	NC_017836	ATA	4	19308	19320	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38680037
11	NC_017836	ATA	4	20358	20369	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680037
12	NC_017836	ATA	4	20455	20465	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38680037
13	NC_017836	TAA	4	21058	21068	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_017836	TAT	4	21202	21213	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680037
15	NC_017836	AAT	4	22064	22075	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_017836	TAA	4	24414	24424	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_017836	ATA	4	24655	24666	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680038
18	NC_017836	TAT	4	27028	27039	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680038
19	NC_017836	TAT	4	29180	29190	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_017836	TAA	4	31428	31439	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680038
21	NC_017836	TAT	4	34555	34565	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38680038
22	NC_017836	TAA	4	35118	35128	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38680038
23	NC_017836	ATA	4	35581	35592	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_017836	ATA	4	36084	36096	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_017836	ATT	4	36331	36342	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680038
26	NC_017836	TAT	4	37209	37219	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38680038
27	NC_017836	TAA	4	41563	41574	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680039
28	NC_017836	TAT	4	42252	42263	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680039
29	NC_017836	ATA	4	42708	42720	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_017836	ATT	4	42955	42966	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680039
31	NC_017836	AGA	4	43584	43594	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	38680039
32	NC_017836	ATT	4	44438	44449	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680039
33	NC_017836	TAT	4	45301	45311	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38680039
34	NC_017836	ATT	4	50370	50380	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38680039
35	NC_017836	TTC	5	50925	50939	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	38680039

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cyanophora paradoxa mitochondrion