ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cyanophora paradoxa mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017836	TTA	4	260	270	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_017836	TAAA	3	571	582	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_017836	ATA	4	1167	1179	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_017836	A	16	3587	3602	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	38680035
5	NC_017836	TAAAAA	4	3970	3994	25	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	38680035
6	NC_017836	A	15	4410	4424	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	38680035
7	NC_017836	A	16	4436	4451	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	38680035
8	NC_017836	A	14	4511	4524	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	38680035
9	NC_017836	AAAT	3	4536	4548	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	38680035
10	NC_017836	A	28	4635	4662	28	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	38680035
11	NC_017836	A	14	4670	4683	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	38680035
12	NC_017836	AAAT	3	4691	4702	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38680035
13	NC_017836	A	14	4721	4734	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	38680035
14	NC_017836	AAT	4	5555	5565	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38680035
15	NC_017836	TAT	4	7932	7943	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680035
16	NC_017836	AAAT	3	8379	8389	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38680035
17	NC_017836	AT	6	8439	8449	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38680035
18	NC_017836	TAAA	3	8699	8710	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38680035
19	NC_017836	ATTTA	4	8729	8748	20	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	38680035
20	NC_017836	TAA	4	8784	8795	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680035
21	NC_017836	TAAA	4	9230	9245	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_017836	TAA	4	9327	9338	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_017836	AATT	3	9563	9574	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_017836	CAAA	3	11616	11626	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	38680036
25	NC_017836	TCTT	3	11748	11758	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	38680036
26	NC_017836	TTAT	3	11826	11837	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38680036
27	NC_017836	TAAA	3	11874	11884	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38680036
28	NC_017836	ATTT	3	12797	12808	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38680036
29	NC_017836	ATAA	3	13056	13067	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38680036
30	NC_017836	ATT	4	13139	13149	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38680036
31	NC_017836	A	15	13376	13390	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	38680036
32	NC_017836	T	15	14089	14103	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	38680036
33	NC_017836	AT	20	14216	14252	37	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_017836	T	12	14391	14402	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	38680036
35	NC_017836	ATT	5	14526	14539	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	38680036
36	NC_017836	ATTT	3	14697	14708	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38680036
37	NC_017836	TTAA	3	14806	14817	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38680036
38	NC_017836	TTAA	3	15098	15110	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38680036
39	NC_017836	AT	6	15150	15160	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38680036
40	NC_017836	ATTT	3	15459	15471	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	38680036
41	NC_017836	ATTTAT	3	15474	15490	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	38680036
42	NC_017836	TAAAA	3	15975	15990	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	38680036
43	NC_017836	CTTT	3	16113	16124	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	38680036
44	NC_017836	T	13	16222	16234	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	38680036
45	NC_017836	ATTTG	3	16432	16446	15	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	38680036
46	NC_017836	ATT	4	16468	16479	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680036
47	NC_017836	AAAC	3	17079	17089	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	38680037
48	NC_017836	TAAA	4	17682	17697	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_017836	AT	6	18828	18838	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38680037
50	NC_017836	T	12	19185	19196	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	38680037
51	NC_017836	ATA	4	19308	19320	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38680037
52	NC_017836	ATTTT	3	19493	19506	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	38680037
53	NC_017836	TATT	3	19798	19808	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38680037
54	NC_017836	ATA	4	20358	20369	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680037
55	NC_017836	ATA	4	20455	20465	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38680037
56	NC_017836	AATTAA	3	20782	20800	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
57	NC_017836	ATTT	3	20801	20812	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_017836	TAA	4	21058	21068	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_017836	TAT	4	21202	21213	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680037
60	NC_017836	AAT	4	22064	22075	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_017836	TA	7	22203	22215	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_017836	ATAA	3	22472	22483	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	38680037
63	NC_017836	AATG	3	23039	23051	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	38680037
64	NC_017836	TAAA	3	23329	23341	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	38680037
65	NC_017836	A	12	24402	24413	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_017836	TAA	4	24414	24424	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_017836	AAAT	3	24542	24552	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38680038
68	NC_017836	ATA	4	24655	24666	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680038
69	NC_017836	AATA	3	25024	25036	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	38680038
70	NC_017836	A	13	25352	25364	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_017836	TA	9	25363	25380	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
72	NC_017836	TTTA	3	25577	25587	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38680038
73	NC_017836	A	16	25901	25916	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	38680038
74	NC_017836	TAAAA	3	26448	26461	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	38680038
75	NC_017836	A	12	26583	26594	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	38680038
76	NC_017836	A	16	26656	26671	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	38680038
77	NC_017836	TAT	4	27028	27039	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680038
78	NC_017836	TAAA	3	27084	27094	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38680038
79	NC_017836	TA	6	27325	27335	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_017836	ATTTA	3	27374	27387	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_017836	T	15	27394	27408	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	38680038
82	NC_017836	TAAA	3	27938	27948	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38680038
83	NC_017836	TA	6	28996	29006	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_017836	TAT	4	29180	29190	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_017836	AAAG	3	29259	29270	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	38680038
86	NC_017836	A	12	29902	29913	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	38680038
87	NC_017836	AT	7	30554	30566	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38680038
88	NC_017836	TA	7	31150	31162	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_017836	GAAT	3	31247	31258	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	38680038
90	NC_017836	ATTT	3	31404	31415	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	38680038
91	NC_017836	TAA	4	31428	31439	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680038
92	NC_017836	TGTT	3	31586	31596	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	38680038
93	NC_017836	TA	6	32068	32078	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38680038
94	NC_017836	AT	8	32891	32905	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
95	NC_017836	AAAT	3	33285	33296	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_017836	TAT	4	34555	34565	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38680038
97	NC_017836	TTGTTT	3	34919	34936	18	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	38680038
98	NC_017836	TAA	4	35118	35128	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38680038
99	NC_017836	TAAT	4	35217	35232	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
100	NC_017836	ATA	4	35581	35592	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_017836	ATA	4	36084	36096	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_017836	AATA	3	36118	36130	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	38680038
103	NC_017836	ATTA	4	36168	36183	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	38680038
104	NC_017836	ATT	4	36331	36342	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680038
105	NC_017836	TGAT	3	36381	36393	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	38680038
106	NC_017836	TTAA	3	36836	36847	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38680038
107	NC_017836	TAT	4	37209	37219	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38680038
108	NC_017836	TTTA	3	37896	37908	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
109	NC_017836	TTTA	4	38136	38151	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
110	NC_017836	T	13	38179	38191	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_017836	T	17	39153	39169	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	38680039
112	NC_017836	AAAT	3	39708	39718	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38680039
113	NC_017836	ATTTAA	3	40088	40105	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
114	NC_017836	TAA	4	41563	41574	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38680039
115	NC_017836	TTAT	3	41639	41649	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38680039
116	NC_017836	TTTA	3	41741	41752	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38680039
117	NC_017836	TA	6	42198	42208	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38680039
118	NC_017836	TAT	4	42252	42263	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680039
119	NC_017836	ATA	4	42708	42720	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
120	NC_017836	AATA	3	42742	42754	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	38680039
121	NC_017836	ATTA	4	42792	42807	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	38680039
122	NC_017836	ATT	4	42955	42966	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680039
123	NC_017836	AAAT	3	43099	43110	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38680039
124	NC_017836	A	13	43567	43579	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	38680039
125	NC_017836	AGA	4	43584	43594	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	38680039
126	NC_017836	AT	7	44200	44212	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38680039
127	NC_017836	AATA	3	44225	44237	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	38680039
128	NC_017836	ATTA	4	44275	44290	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	38680039
129	NC_017836	ATT	4	44438	44449	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38680039
130	NC_017836	TGAT	3	44488	44500	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	38680039
131	NC_017836	TTAA	3	44943	44954	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38680039
132	NC_017836	TAT	4	45301	45311	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38680039
133	NC_017836	ACAA	3	45410	45420	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	38680039
134	NC_017836	AATA	3	45594	45605	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38680039
135	NC_017836	TTTA	3	45985	45997	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
136	NC_017836	TTTA	4	46216	46231	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
137	NC_017836	TTTC	3	47238	47248	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
138	NC_017836	AAAT	3	47786	47796	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_017836	ATTTAA	3	48167	48184	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Cyanophora paradoxa mitochondrion