ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Aponomma fimbriatum mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017759	ATT	5	104	118	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	38509997
2	NC_017759	A	15	193	207	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	38509997
3	NC_017759	TAA	4	744	755	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509997
4	NC_017759	TAT	4	1636	1647	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509997
5	NC_017759	ATTT	4	2164	2179	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	38509997
6	NC_017759	TAT	4	2662	2673	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509997
7	NC_017759	AAT	4	2763	2774	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509997
8	NC_017759	CTTT	3	3566	3576	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	38509997
9	NC_017759	TAA	4	3597	3607	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38509997
10	NC_017759	TTAA	3	3694	3705	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38509997
11	NC_017759	TAT	4	4202	4212	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38509997
12	NC_017759	TAATT	3	4401	4415	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	38509998
13	NC_017759	TTG	4	5037	5048	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	38509998
14	NC_017759	ATT	4	5053	5064	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509998
15	NC_017759	TAT	8	5172	5194	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509998
16	NC_017759	ATT	4	5358	5369	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509998
17	NC_017759	ATTT	3	5434	5445	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38509998
18	NC_017759	A	16	5857	5872	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	38509998
19	NC_017759	ATT	4	5902	5913	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509998
20	NC_017759	TAT	4	5958	5969	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509998
21	NC_017759	TA	6	6006	6017	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38509998
22	NC_017759	TAAA	3	6718	6729	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	38509998
23	NC_017759	TAAA	3	7552	7563	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_017759	ATTC	3	8239	8251	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
25	NC_017759	TAA	5	8300	8315	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_017759	TTA	4	8316	8327	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_017759	AATT	3	8563	8574	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017759	AAATT	3	8759	8773	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_017759	TTAA	3	8795	8805	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_017759	TAA	4	9152	9162	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_017759	ATA	4	9308	9319	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509998
32	NC_017759	AAAT	3	9343	9353	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38509998
33	NC_017759	TTAAAT	3	9621	9643	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38509998
34	NC_017759	TTAAAA	3	9678	9695	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	38509998
35	NC_017759	TAA	4	9757	9767	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38509998
36	NC_017759	AATTT	3	10233	10247	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	38509998
37	NC_017759	AAAT	3	10786	10796	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38509998
38	NC_017759	AAAT	3	10842	10853	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38509998
39	NC_017759	TAA	4	11430	11441	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509998
40	NC_017759	ATT	5	11623	11636	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	38509998
41	NC_017759	TAAA	4	11778	11793	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	38509998
42	NC_017759	TAA	4	11825	11835	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38509998
43	NC_017759	ATA	5	11962	11976	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	38509998
44	NC_017759	TAT	4	12048	12059	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509998
45	NC_017759	A	12	12276	12287	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	38509998
46	NC_017759	AT	7	12431	12444	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38509998
47	NC_017759	AAT	4	12898	12909	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509998
48	NC_017759	TAAT	3	13000	13011	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38509998
49	NC_017759	ATTT	3	13046	13056	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38509998
50	NC_017759	ATT	4	13072	13083	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509998
51	NC_017759	TAT	4	13108	13119	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509998
52	NC_017759	AAAT	3	13172	13183	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38509998
53	NC_017759	TCAT	3	13712	13723	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	38509998
54	NC_017759	ATT	4	14033	14044	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509998
55	NC_017759	TAAAT	3	14651	14665	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Aponomma fimbriatum mitochondrion