ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Amblyomma elaphense mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017758	AAT	4	89	100	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509996
2	NC_017758	TAT	4	104	114	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38509996
3	NC_017758	TAAA	3	187	197	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38509996
4	NC_017758	TCT	4	247	257	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	38509996
5	NC_017758	AATT	3	469	479	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38509996
6	NC_017758	TCT	4	553	563	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	38509996
7	NC_017758	ATT	4	643	653	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38509996
8	NC_017758	ATT	4	813	823	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38509996
9	NC_017758	TAAT	3	1379	1390	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38509995
10	NC_017758	TATAA	3	1430	1443	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	38509995
11	NC_017758	TCA	4	2497	2507	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	38509995
12	NC_017758	ATT	5	2544	2558	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	38509995
13	NC_017758	AATT	3	2825	2835	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38509995
14	NC_017758	AATT	3	2897	2909	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38509995
15	NC_017758	ATTT	3	2932	2944	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	38509995
16	NC_017758	AGA	4	3056	3066	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	38509995
17	NC_017758	AAT	4	3535	3546	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	38509995
18	NC_017758	T	17	3564	3580	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	38509995
19	NC_017758	TTTGA	3	3962	3976	15	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	38509995
20	NC_017758	TAT	4	4548	4560	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	38509995
21	NC_017758	T	20	4572	4591	20	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	38509995
22	NC_017758	AAT	4	4960	4972	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38509995
23	NC_017758	ATTT	3	5075	5085	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38509995
24	NC_017758	ATAA	3	5133	5145	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	38509995
25	NC_017758	TAA	4	5161	5172	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509995
26	NC_017758	T	14	5193	5206	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	38509995
27	NC_017758	TTA	4	5424	5435	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509995
28	NC_017758	TTTAA	3	5717	5731	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_017758	AAT	4	5936	5948	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38509995
30	NC_017758	ATAA	3	5991	6002	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	38509995
31	NC_017758	TAAA	3	6149	6160	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38509995
32	NC_017758	TTA	4	6265	6276	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509995
33	NC_017758	ATT	4	6474	6485	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509995
34	NC_017758	AAATTA	4	6673	6696	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509995
35	NC_017758	TTAA	3	7064	7074	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_017758	ATT	4	7191	7202	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_017758	TAA	4	7213	7224	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_017758	TTA	4	7421	7432	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_017758	TA	7	7463	7475	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_017758	TTTA	3	7515	7525	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_017758	ATT	4	7673	7684	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017758	TTAAA	4	8489	8508	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
43	NC_017758	A	12	8524	8535	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017758	ATTT	3	9083	9094	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017758	TTAA	3	9262	9273	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38509995
46	NC_017758	AAAT	3	9488	9499	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38509995
47	NC_017758	TAA	4	9506	9516	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38509995
48	NC_017758	ATT	4	9662	9673	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509995
49	NC_017758	AATA	3	9740	9750	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38509995
50	NC_017758	ATA	4	9756	9767	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509995
51	NC_017758	A	12	9779	9790	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	38509995
52	NC_017758	ATA	4	9958	9969	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509995
53	NC_017758	TAA	4	10325	10335	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38509995
54	NC_017758	A	13	10395	10407	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	38509995
55	NC_017758	TA	6	11064	11075	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38509995
56	NC_017758	TAA	4	11353	11363	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38509995
57	NC_017758	ATCA	3	11513	11523	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	38509995
58	NC_017758	TA	6	11743	11756	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38509995
59	NC_017758	ATAA	5	11818	11837	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	38509995
60	NC_017758	ATT	5	11876	11890	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	38509995
61	NC_017758	A	16	11908	11923	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	38509995
62	NC_017758	AAATTG	3	12036	12053	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	38509995
63	NC_017758	ATT	4	12062	12072	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38509995
64	NC_017758	ATA	6	12153	12169	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	38509995
65	NC_017758	AATT	3	12350	12360	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38509995
66	NC_017758	ATAA	3	12395	12406	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	38509995
67	NC_017758	TAT	4	12680	12691	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509996
68	NC_017758	TAT	4	12727	12738	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509996
69	NC_017758	TAA	4	12761	12772	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509996
70	NC_017758	AAT	4	12789	12800	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509996
71	NC_017758	AAT	4	12855	12866	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509996
72	NC_017758	ATT	4	12880	12891	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509996
73	NC_017758	ATA	4	12973	12984	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509996
74	NC_017758	AATT	3	13078	13089	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38509996
75	NC_017758	T	12	13358	13369	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	38509996
76	NC_017758	TAA	4	13405	13416	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509996
77	NC_017758	T	15	13733	13747	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	38509996
78	NC_017758	A	13	13998	14010	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	38509996
79	NC_017758	ATA	4	14556	14566	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Amblyomma elaphense mitochondrion