ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Amblyomma elaphense mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017758	AAT	4	89	100	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509996
2	NC_017758	TAT	4	104	114	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38509996
3	NC_017758	TCT	4	247	257	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	38509996
4	NC_017758	TCT	4	553	563	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	38509996
5	NC_017758	ATT	4	643	653	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38509996
6	NC_017758	ATT	4	813	823	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38509996
7	NC_017758	TCA	4	2497	2507	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	38509995
8	NC_017758	ATT	5	2544	2558	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	38509995
9	NC_017758	AGA	4	3056	3066	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	38509995
10	NC_017758	AAT	4	3535	3546	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	38509995
11	NC_017758	TAT	4	4548	4560	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	38509995
12	NC_017758	AAT	4	4960	4972	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38509995
13	NC_017758	TAA	4	5161	5172	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509995
14	NC_017758	TTA	4	5424	5435	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509995
15	NC_017758	AAT	4	5936	5948	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38509995
16	NC_017758	TTA	4	6265	6276	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509995
17	NC_017758	ATT	4	6474	6485	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509995
18	NC_017758	ATT	4	7191	7202	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_017758	TAA	4	7213	7224	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_017758	TTA	4	7421	7432	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_017758	ATT	4	7673	7684	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017758	TAA	4	9506	9516	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38509995
23	NC_017758	ATT	4	9662	9673	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509995
24	NC_017758	ATA	4	9756	9767	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509995
25	NC_017758	ATA	4	9958	9969	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509995
26	NC_017758	TAA	4	10325	10335	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38509995
27	NC_017758	TAA	4	11353	11363	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38509995
28	NC_017758	ATT	5	11876	11890	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	38509995
29	NC_017758	ATT	4	12062	12072	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38509995
30	NC_017758	ATA	6	12153	12169	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	38509995
31	NC_017758	TAT	4	12680	12691	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509996
32	NC_017758	TAT	4	12727	12738	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509996
33	NC_017758	TAA	4	12761	12772	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509996
34	NC_017758	AAT	4	12789	12800	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509996
35	NC_017758	AAT	4	12855	12866	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509996
36	NC_017758	ATT	4	12880	12891	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509996
37	NC_017758	ATA	4	12973	12984	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509996
38	NC_017758	TAA	4	13405	13416	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509996
39	NC_017758	ATA	4	14556	14566	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Amblyomma elaphense mitochondrion