ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Bothriocroton undatum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017757	ATT	4	317	328	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509992
2	NC_017757	TTTA	3	687	698	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38509992
3	NC_017757	ATT	4	851	862	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509992
4	NC_017757	AATT	3	2539	2550	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38509992
5	NC_017757	AAT	4	2770	2781	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509992
6	NC_017757	ATT	4	2816	2827	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509992
7	NC_017757	TCAT	3	3162	3173	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	38509992
8	NC_017757	TAT	4	3730	3741	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509993
9	NC_017757	T	12	3884	3895	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	38509993
10	NC_017757	AATTTT	3	4463	4480	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	38509993
11	NC_017757	TAT	4	4573	4585	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	38509993
12	NC_017757	TTTC	3	4601	4612	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	38509993
13	NC_017757	TTTC	3	4975	4986	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	38509993
14	NC_017757	ATTT	3	5103	5113	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38509993
15	NC_017757	TTAAT	3	5438	5451	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	38509993
16	NC_017757	TTAA	3	5667	5678	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_017757	A	28	5861	5888	28	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	38509993
18	NC_017757	ATA	4	5896	5908	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38509993
19	NC_017757	TAT	4	5931	5942	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509993
20	NC_017757	CTT	4	6427	6438	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	38509993
21	NC_017757	AAT	4	6511	6522	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509993
22	NC_017757	ATT	4	6727	6738	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509993
23	NC_017757	TTAA	3	6763	6773	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38509993
24	NC_017757	AATTA	3	7171	7185	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_017757	TTTAA	3	7671	7685	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_017757	ATTT	3	7760	7771	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_017757	TAAA	3	8320	8330	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_017757	TTA	4	8581	8591	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_017757	AATT	3	8991	9002	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_017757	ATA	5	9329	9343	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	38509993
31	NC_017757	TAA	6	9613	9630	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	38509993
32	NC_017757	AAAT	3	9691	9701	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38509993
33	NC_017757	TAT	4	10153	10165	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	38509993
34	NC_017757	AAT	4	10438	10450	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38509993
35	NC_017757	AAAG	3	10862	10872	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	38509993
36	NC_017757	A	24	10916	10939	24	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	38509993
37	NC_017757	TAAA	3	11174	11185	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38509993
38	NC_017757	ATT	4	11217	11228	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509993
39	NC_017757	ATT	4	11364	11375	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509993
40	NC_017757	TAT	4	11813	11824	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509993
41	NC_017757	A	16	12026	12041	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	38509993
42	NC_017757	TTTA	3	12128	12138	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38509993
43	NC_017757	ATTTA	3	12354	12368	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	38509993
44	NC_017757	TAT	4	12810	12820	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38509993
45	NC_017757	TCTT	3	12836	12846	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	38509993
46	NC_017757	AAT	4	12888	12899	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509993
47	NC_017757	AT	6	12934	12944	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38509993
48	NC_017757	ATA	4	13036	13048	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38509993
49	NC_017757	ATT	5	13098	13112	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	38509993
50	NC_017757	ATT	4	13523	13534	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509993
51	NC_017757	ATT	4	13889	13900	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509993
52	NC_017757	ATT	5	14060	14074	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	38509993
53	NC_017757	AATT	3	14589	14600	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_017757	TTAT	3	14717	14728	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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All Imperfect Repeats of Bothriocroton undatum mitochondrion