ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pyropia haitanensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017751	AAAG	3	2311	2323	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	38515352
2	NC_017751	AATA	3	3246	3257	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38515352
3	NC_017751	GAAA	3	4426	4436	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_017751	TTTA	3	7288	7298	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_017751	AAAT	3	8626	8636	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_017751	TGC	4	9206	9217	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	38515352
7	NC_017751	TTAC	3	10675	10685	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	38515352
8	NC_017751	TCA	4	10826	10837	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	38515352
9	NC_017751	TAA	4	10911	10922	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38515352
10	NC_017751	TTTA	3	11340	11351	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_017751	AAAG	3	11769	11779	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	38515353
12	NC_017751	TTCAGC	3	12098	12115	18	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	38515353
13	NC_017751	TA	7	12191	12203	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38515353
14	NC_017751	ATA	4	12250	12260	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38515353
15	NC_017751	AACA	3	13002	13014	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	38515353
16	NC_017751	TAAA	3	14186	14196	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38515353
17	NC_017751	ATA	4	15855	15865	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38515353
18	NC_017751	ATA	4	15981	15991	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38515353
19	NC_017751	AAGT	3	16620	16632	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	38515353
20	NC_017751	ATT	4	16671	16682	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38515353
21	NC_017751	TAAA	3	19055	19066	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38515353
22	NC_017751	TTTA	3	19228	19238	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_017751	TA	6	19498	19508	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38515353
24	NC_017751	TTAA	4	19574	19590	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	38515353
25	NC_017751	ATA	5	20566	20580	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	38515353
26	NC_017751	ATAGA	3	21406	21420	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	38515354
27	NC_017751	TCAA	3	23593	23604	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	38515354
28	NC_017751	CATT	3	26676	26687	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	38515354
29	NC_017751	TTGC	3	26793	26803	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	38515354
30	NC_017751	ATC	4	27518	27528	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	38515354
31	NC_017751	CAAA	3	27750	27761	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	38515354
32	NC_017751	TTA	4	28650	28661	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_017751	TA	7	29317	29329	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_017751	AATT	9	29371	29405	35	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_017751	CTTA	3	29593	29603	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
36	NC_017751	CTTT	3	30879	30889	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
37	NC_017751	TAT	4	32826	32836	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38515354
38	NC_017751	AAACA	3	33663	33678	16	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	38515354
39	NC_017751	TACAA	3	34046	34065	20	60 %	20 %	0 %	20 %	5 %	38515354
40	NC_017751	AATA	3	35100	35111	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_017751	AATA	3	35146	35157	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_017751	TA	6	36269	36279	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_017751	TAT	4	36791	36802	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38515355
44	NC_017751	ATA	4	36871	36881	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38515355

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Pyropia haitanensis mitochondrion